新冠病毒的基因組序列分析

2020-11-30 生物谷



2月3日,《自然》在線發表論文介紹了上海公共衛生臨床中心和復旦大學公共衛生學院教授張永振等人對2019-nCov的基因組序列的分析。該病毒基因組從就職於出現首批患者的海鮮市場的一名病人身上獲得。基因組分析顯示,該病毒與此前在中國蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關。

最近出現在武漢的一種2019-nCov已傳播到中國其他地區和其他幾個國家,其中包括美國、德國和日本。首例患者於2019年12月12日被收治入院,調查發現武漢一家同時銷售野生動物的海鮮市場或是此次疫情的潛在來源。

張永振等研究了一名41歲的男性海鮮市場工人,其於2019年12月26日在武漢一家醫院住院,表現出呼吸系統疾病症狀,包括發燒、胸悶和咳嗽。聯合使用

抗生素

、抗病毒藥和糖皮質激素進行治療,但患者表現出呼吸衰竭,治療三天後病情無改善。

作者對從患者收集的支氣管肺泡灌洗液(肺分泌物)進行了基因組測序。他們鑑定出了一種新型病毒,並發現該病毒基因組與蝙蝠體內發現的SARS樣冠狀病毒有89.1%的核苷酸相似性。

作者表示,儘管從單個患者的分析中不可能得出該冠狀病毒是當前疫情爆發原因的結論,不過這些發現已被針對其他患者的獨立調查研究證實。相關序列信息1月10日發表於病毒學網站。(

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