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...結果今日發布:經與全球資料庫中新冠病毒全基因組序列進行比對...
【廣東發布陸豐疫情病毒溯源結果】陸豐疫情病毒溯源結果今日發布:經與全球資料庫中新冠病毒全基因組序列進行比對分析,發現屬於香港本地流行的HK1分支,與香港流行毒株的病毒序列高度同源,同源百分率達99.99%。
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21個國家377個全基因組分析:探究新冠病毒起源
21個國家的377個全基因組序列,探究COVID-19病毒之間的相似性和進化關係西安電子科技大學教授李雁妮等人和北京大學講席教授劉兵發表了一篇關於新冠病毒全基因序列相似性的研究,題為「Similarities and Evolutionary Relationships of COVID-19 and Related Viruses
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如何進行基因組序列比對?
、比對軟體、SAM文件拿到人基因組全外顯子illumina下機數據fastq文件之後,如何進行後續的變異檢測呢?首先要做的就是將測序得到的reads比對到人基因組參考序列上。隨著人類基因組計劃(Human Genome Project,HGP)的進行,International Human Genome Sequencing Consortium在2001年首次公布了人基因組序列的草圖,2003年人類基因組計劃宣布完成。
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天津、河北與北京新冠病例均為同一病毒序列,同屬歐洲家系!
(健康時報記者 魯洋)11月8日,天津市疾控中心對本市第138例本土確診病例,進行了新冠病毒全基因組高通量測序和序列分析。測序分析結果顯示:與北美3至6月份流行毒株高度近似,屬於L基因型歐洲家系分支II。11月10日,天津市疾病預防控制中心對本市第93例(搬運工王某某)新冠肺炎無症狀感染者的呼吸道標本,進行新冠病毒全基因組高通量測序和序列比對。
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疑似病例完成新冠病毒全基因組分析僅需半小時—新聞—科學網
當前,針對新型冠狀病毒的主要檢測技術有免疫、PCR和高通量測序(NGS)三類,其中免疫和PCR方法是一種定向檢測,可以對病毒進行篩查,適合對患者標本中是否存在病毒進行診斷
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...標本進行新冠病毒全基因組高通量測序和序列分析。21日測序分析...
2020-11-22 09:37:37來源:FX168 【天津瞰海軒小區19號樓確診病例測序分析結果公布:與本土第3例無症狀感染者病毒序列一致】11月18日至21日,天津市疾病預防控制中心對本土第5例無症狀感染者康某某、第141例確診病例申某及第144例確診病例楊某呼吸道標本進行新冠病毒全基因組高通量測序和序列分析。
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21個國家377個全基因組分析:探究新冠病毒起源,重大突變及進化關係
21個國家的377個全基因組序列,探究COVID-19病毒之間的相似性和進化關係 西安電子科技大學教授李雁妮等人和北京大學講席教授劉兵發表了一篇關於新冠病毒全基因序列相似性的研究,題為「Similarities and Evolutionary Relationships of COVID-19 and Related Viruses
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21個國家的377個全基因組序列,探究COVID-19病毒之間的相似性和...
因此,有效地控制與扼制新冠病毒COVID-19疫情、治癒感染病人、免受由疫情所帶來的巨大經濟損失是當前世界面臨的最緊迫與重要問題。本文報告了作者對新冠病毒COVID-19全基因序列(以下簡稱序列)本身,以及COVID-19病毒序列與其它相關病毒序列之間的相似性與進化關係的計算及分析。由於新冠病毒COVID-19是一種新型病毒,對它的研究才剛剛開始。
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不應過度解讀新冠病毒基因序列分析
新冠疫情全球暴發,共享新型冠狀病毒基因組序列十分重要。但在資源共享、推進科學發展對抗全球疫情的同時,也切不可放棄科學的嚴謹,警惕對於數據的片面放大解讀。繼省、狄德羅、史雋 / 文2020年2月28日,德國柏林Charité大學醫院的病毒學家Christian Drosten發布了從一位德國患者身上分離出的新冠病毒 (SARS-CoV-2) 的基因組序列,隨後,他立刻在twitter上發布了一條警告:目前,分析解讀新冠病毒的基因序列還不是時候
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北京新發地疫情新冠病毒基因序列公布,專家認為與捷克等地病毒相似
此外,6月18日晚,中國疾控中心在「新型冠狀病毒國家科技資源服務系統」上發布了2020年6月北京新發地市場新冠疫情及病毒基因組序列數據。三條數據中兩條為北京市確診病例基因組序列數據,一條為環境樣本基因組序列數據。
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新冠病毒的基因組序列分析
2月3日,《自然》在線發表論文介紹了上海公共衛生臨床中心和復旦大學公共衛生學院教授張永振等人對2019-nCov的基因組序列的分析。該病毒基因組從就職於出現首批患者的海鮮市場的一名病人身上獲得。基因組分析顯示,該病毒與此前在中國蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關。
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最新發布!全球冠狀病毒組學數據共享與分析系統
此次武漢發現的新型冠狀病毒2019-nCov是一種以前尚未在人類中發現的新型冠狀病毒,屬於冠狀病毒β屬,世界衛生組織將新型冠狀病毒感染引起的肺炎正式命名為COVID-19。為做好新型冠狀病毒感染的肺炎疫情防控和科研工作支撐,2020年2月18日,中國科學院微生物研究所主持的國家微生物科學數據中心發布「全球冠狀病毒組學數據共享與分析系統」(http://nmdc.cn/#/coronavirus)。
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穿山甲是新冠病毒潛在中間宿主?專家:需公開基因序列
這是繼蛇和水貂假說後,又一項針對新冠病毒中間宿主進行的研究。據華南農業大學網站消息,這項最新研究由華南農業大學、嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室沈永義教授、肖立華教授等科研人員聯合開展。2月7日上午,華南農業大學舉行新聞發布會透露,攻關團隊通過分析1000多份宏基因組樣品,鎖定穿山甲為新型冠狀病毒的潛在中間宿主;繼而通過分子生物學檢測,揭示穿山甲中β冠狀病毒的陽性率為70%;進一步對病毒進行分離鑑定,電鏡下觀察到典型的冠狀病毒顆粒結構;最後通過對病毒的基因組分析,發現分離的病毒株與目前感染人的毒株序列相似度高達99%。
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一文讀懂測序技術在新冠病毒檢測中的應用
測序技術在新冠病毒檢測中的意義和價值 在科學研究方向,採用高通量測序技術,可在第一時間獲取新發未知病毒的基因組序列信息,為突發疫情的防控和後續研究提供了幫助,例如通過構建進化樹揭示其病原相關特性、分析新冠病毒的進化來源、研究新冠病毒的致病病理機制等。
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專家解碼中疾控公布的基因組序列:北京新發地病毒為輸入性
來源:一財網原標題:專家解碼中疾控公布的基因組序列:北京新發地病毒為輸入性北京疫情再起,病毒到底起源於何處?何時傳入北京?經過病毒專家日夜奮戰,有了初步的科學結論:這是一種輸入性病毒。6月18日晚,中國疾病預防控制中心通過「新型冠狀病毒國家科技資源服務系統」,正式發布2020年6月北京新發地市場新冠疫情及病毒基因組序列數據。
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北京基因組所等開發完成基於K-mer的基因組組分分析資料庫
在過去的幾十年中,人們往往使用高度保守的基因家族進行系統進化分析,採用全基因組序列進行系統進化分析並不普遍。目前,基於是否進行序列的比對,分子系統發生樹的構建分為兩類。其中,不需要進行序列比對的方法是依據K-mer向量計算的距離矩陣進行系統進化分析,大量的研究證實該算法是行之有效的,尤其是對基因組中諸如蛋白編碼序列等的特定區域。
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《核酸研究》:高質量模式微生物基因組資料庫及分析平臺
由國家微生物科學數據中心(世界微生物數據中心)建立的模式微生物基因組資料庫(gcType)http://gctype.wdcm.org/,是為分類學家進行基因組研究、新種鑑定的一個非常有價值的工具平臺。平臺不僅集成了目前所有公共來源的模式微生物物種和基因組數據,還發布了大量自測模式微生物基因組數據,是目前國內外模式微生物基因組數據最為豐富的平臺。
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《核酸研究》:高質量模式微生物基因組資料庫及分析平臺
由國家微生物科學數據中心(世界微生物數據中心)建立的模式微生物基因組資料庫(gcType)http://gctype.wdcm.org/,是為分類學家進行基因組研究、新種鑑定的一個非常有價值的工具平臺。
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大連疫情基因組與俄羅斯流行毒株高度同源
中新網大連1月3日電 (記者 楊毅)大連市衛生健康委員會副主任趙連3日在當地政府舉行的疫情防控新聞發布會上表示,國家、省、市疾控中心對此次疫情確診病例、無症狀感染者及相關環境、貨物樣本病毒,進行了全基因組測序分析,病毒基因組與此前大連市以往的新冠病毒全基因組序列比對均不同源,排除本地新冠病毒的持續傳播
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法國完成新冠病毒全基因組測序,該病毒不需要突變即可適應和傳播
法國完成新冠病毒全基因組測序,該病毒不需要突變即可適應和傳播引言法國巴斯德研究院於1月30日向世界宣布,目前,我們已經成功的完成了新型冠狀病毒的基因組測序工作,這是自2020爆發的疫情以來,歐洲地區首次測出新型冠狀病毒的全基因組序列。