果樹分為地上和地下兩部分，整形修剪主要針對的上部，近年來也提出了根系修剪問題。
地上部：主幹和樹冠
樹冠：中心幹、主枝、側枝和枝組，中心幹、主枝、側枝構成樹冠的骨架，稱為骨幹枝。果樹樹體以及各組成部分的大小，形狀，結構，間隔等，都影響樹體和群體的光能利用和生產效率，因此，分析樹體結構，對指導整形修剪有重要意義。
1．主幹
地面至第一層主枝之間的樹幹部分。幹高對樹體影響很大。
高幹：根、冠間距大，樹冠成形晚，體積小幹的無效消耗增多，易上強，便於地下管理，過高增加樹上管理難度。下部通透性好。
矮幹：成形快，冠體積大，生長勢強，早期豐產，易下強，便於樹冠管理，不利於地下管理，結果易下垂託地，通風不良，下部難以生產優質果。
幹高的確定應具體分析：
樹種品種：乾性強，樹性直立，枝條硬，幹可以矮些；樹形開張，枝條軟垂的，幹宜高些。
栽植密度及整形方式：稀植大冠宜矮，矮化密植宜高，疏散分層形宜矮，開心形、紡錘形宜高，三挺身形宜矮。
主枝角度：角度大，幹宜高。角度小，宜矮。
氣候：大陸性氣候，高緯度，宜矮；海洋性氣候，低緯度，可高。
立地條件：山地、丘陵地、貧瘠土壤、高海拔幹宜矮；平地、低洼地、肥沃土壤、低海拔宜高。
間作宜高。幹高一般50~90cm。
2．樹冠
（1）樹冠體積 由冠高、冠徑決定。
樹高冠大（大冠），可充分利用空間，立體結果，經濟壽命長，適應性、抗性較強，但成形慢，早期光能和土地利用率低，結果晚，早期產量低，樹冠形成後分枝級次多，枝幹增多，運輸距離大，無效消耗多，管理不便，同時無效空間增大。
美國學者Heinicke(1975)調查，蘋果樹高從2.4m增加到6.1m，有效葉面積的比例從92%減少到76%，單位土地面積的有效葉面積減少1/3。
據蘇聯的研究，蘋果有效結果枝年齡在8~10年以內，而大冠半圓形樹冠中，小於8年生的枝條只佔總長的40%左右，有效體積比小冠形減少。
從營養消耗來看，蘋果（旭）矮化樹在生長期用於果實以外的同化營養佔總合成量的20%，而大冠型則高達50%以上。
（2）冠高、冠徑和間隔
主要影響光能利用和勞動效率。
機械化程度高，行間樹冠間隔宜大，以方便管理為宜從光能利用來看，主要考慮樹冠基部光照條件，在生長季能得到滿足。在夏季每天樹冠下部應保證3~3.5小時的直射光。
研究認為，溫帶地區蘋果花芽分化，至少需要約30%的日光輻射，樹冠投影面積內有15~25%左右的光斑（光投影面積），花臉狀篩網狀。
生產優質著色果，需要40~50%的日光輻射，地面上光投影面積佔25~30%。
確形角是衡量樹冠是否合理的重要指標。（群體結構）
在華北地區，確形角49°左右，一般間隔1.2~1.5m，冠高不超過行距的2/3。冠高與冠徑密其相關，冠高，則冠徑宜小，如紡錘形、圓柱形；冠矮，則冠徑宜大，如半圓型，開心形。
（3）冠形
主要分為自然形、扁平型（籬架形、樹籬形）、水平形（棚架、盤狀形、匍匐形）三類。
扁平形：群體有效體積、樹冠有效面積大，操作方便，產量高，品質好，是密植的主要樹形。
自然形多用於大冠。無效空間較大，產量高，但品質較差。
水平形光照好，但產量低。
（4）樹冠結構和葉幕配置
樹冠分層，單位枝群（呈圓錐形）葉片立體分布，形成立體葉幕則光能利用率高。
3．中心幹
又稱中性領導幹，中心幹的有無，與樹種、品種及樹形有關。
有中心幹的樹形，主枝和中心乾結合牢固，主枝可上下分層或錯落排布，保持明顯主從關係，有利於立體結果和提高光能利用。
有中心幹高的大冠樹形，易出現上強下弱，下部通風透光不良，影響產量和品質因此，應採取分層性，或延遲開心形，改善光照條件有主幹小冠形，可採用紡錘形、圓柱形，形成單位枝群。
有中幹樹型，在結果後也可改造成開心形（無主幹形），背上垂直優勢強，應加以控制。無中幹樹形主要有：開心形、棚架形。結果容易平面化，背上生長勢強。
有無主幹，主要取決於樹種、品種的乾性強弱，蘋果、梨、柿子、棗等樹種有中心幹，核果類、葡萄等無中心幹。
中心幹有直線延伸和彎曲延伸兩種類型，用於平衡上下生長勢。