國外臨床公開資料庫大盤點:未被挖掘的小眾非生信資料庫有哪些?

近幾年應用公開的資料庫發生信文章蔚然成風，但入門門檻稍高，需要掌握遺傳學知識和計算機語言。

今天，筆者想通過這篇文章總結一些國外的非生信資料庫，為大家提供另一種選擇。

1. National Institute on Alcohol Abuse and Alcoholism Data Archive （NIAAADA，美國國家酒精濫用資料庫）

網址：

https://nda.nih.gov/niaaa

獲得數據的英文指南網址：

https://nda.nih.gov/niaaa/getting-data

適用的研究方向/領域：酒精濫用，應該可以與心血管疾病結合。

優點：NIAAADA 的數據可向任何人分享，即使沒有 NDA 的帳號也可以。

缺點：需要證明您所在的機構是 NIH 承認的研究機構。

免費與否：免費。

是否需要註冊：總結的數據不需要註冊。個體水平數據需要註冊、研究計劃、申請。

瀏覽器要求：最好使用 Chrome 瀏覽器。

圖片來源：官網截圖

NIAAADA 的數據可向任何人分享，即使沒有 NDA 的帳號也可以。這包括一些總結的數據，比如測量了哪些變量，和這些變量的總體分布。

如果想得到個體水平的數據，研究者需要滿足一定的前提條件，在進行 NDA 的申請後獲得授權。

NDA 的數據申請會由一個特別的委員會審核，向 NDA 遞交申請需要註冊 NDA 的帳號。

獲取數據的前提：

-必須認真說明有獲得數據的研究需要。

-你必須在 NIH 承認的研究機構內，且這個機構授權你這麼做。

2. International Physical Activity and the Environment Network（IPEN）

網址：

http://www.ipenproject.org/faq.html

適用的研究方向/領域：

運動對健康的影響，城市建築環境對健康的影響，可以結合肥胖、糖尿病、心血管疾病等與運動有關的慢性病進行研究。

優點：該團隊已經用該數據在 Lancet 上發表了文章。

缺點：該項目上一次情況的更新是 4 年前，可能回覆郵件不一定及時。

免費與否：免費。

是否需要註冊：不需要。但需要向該組織發郵件進行溝通。

瀏覽器要求：無

圖片來源：官網截圖

該資料庫涉及到城市環境與健康（運動）的關係，是美國加州大學聖地牙哥分校教授牽頭的聯盟。

官網最後一次更新是 2014 年，這個聯盟在 2016 年在 Lancet 主刊發了一篇成果（https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27045735/），想了解數據具體是什麼的可以去看這篇文章，這篇文章的通訊作者是聖地牙哥分校的 James F Sallis 教授。

如何用 IPEN 的數據寫文章了?

向 IPEN 團隊（郵箱 [e-mail]）提交預備發表文章的研究計劃申請即可。

3. National Survey on Drug Use and Health（NSDUH，美國藥物使用和健康調查）

網址：

https://nsduhweb.rti.org/respweb/homepage.cfm

適用的研究方向/領域：藥物濫用，如阿片類、醫用大麻類。

優點: 網站自帶回歸、卡方檢驗的分析工具，可以自己選取輸入的變量，操作簡便、友好。

缺點：該主題對於中國社會意義不是很大。不過，可以試著挖一挖止痛劑濫用方向的點，可能結合一下中國學者的研究興趣。

免費與否：免費。

是否需要註冊：需要註冊。

瀏覽器要求：建議使用 Chrome 瀏覽器。

圖片來源：官網截圖

眾所周知，美國藥物濫用情況還是略嚴重，是一個緊迫的社會問題。

這個資料庫是可直接使用性最強的，在網頁上有自動模塊，可以操作卡方回歸和 logistics 回歸。我曾經和導師交流時，導師也很推薦這個資料庫。

4. National Institute of Mental Health Data Archive（美國國家精神健康資料庫，NDA）

網 址：

https://nda.nih.gov/

適用的研究方向/領域：精神健康。

優點：是美國該領域數據非常全面的官方機構。

缺點：但相較前面幾個資料庫，申請時較為麻煩。

免費與否：免費。

是否需要註冊：需要註冊。

瀏覽器要求：建議使用 Chrome 瀏覽器或者 360 瀏覽器。

圖片來源：官網截圖

圖片來源：官網截圖

FQA 環節中有解答數據的詳細情況，但需要聯繫官方，提交申請，才能獲取數據。

5. Women Health Initiative（女性健康聯盟）

網址：

https://www.whi.org/

適用的研究方向/領域：女性健康、運動對女性健康的影響。

優點：久負盛名的數據聯盟，數據質量高。

缺點：申請過程較以上 1、2、3 資料庫相對繁瑣。

免費與否：免費。

是否需要註冊：需要，且需要提供研究計劃。

瀏覽器要求：建議使用 Chrome 瀏覽器。

圖片來源：官網截圖

這是運動和心血管健康聯盟（OPACH）之下的一個子研究，需要操作一下才能打開主頁。這個研究用可穿戴設備檢測老年婦女的運動和心血管健康。

如何獲取數據發表文章的指南在這裡:

https://www.whi.org/page/propose-a-paper

6. UK biobank

網 址:

https://www.ukbiobank.ac.uk/

適用的研究方向/領域：

基因、包含了各種重大疾病，如各種癌症、心血管疾病、中風、痴呆、糖尿病、關節炎、骨質疏鬆、眼部疾病、抑鬱等。

優點：包含了 50 萬人基因數據、多種表型的大型資料庫，已經很多人利用該資料庫產出孟德爾隨機研究的高質量文章。

缺點：需要交幾千英鎊甚至更多的申請費（視申請數據的種類而定）。

免費與否：需付費。

是否需要註冊：需要註冊，且需要有研究方案。

瀏覽器要求：建議使用 Chrome 瀏覽器。

圖片來源：官網截圖

該資料庫收集了 50 萬英國人的基因數據和其他流行病學特徵，像廣闊的海洋，值得深挖。

缺點就是需要收取一定的費用，從網上的攻略來看，發一篇一般的文章（數據量不是很大），大概需要 2250 英鎊左右。

7. Surveillance, Epidemiology, and End Results（SEER，美國癌症監測資料庫）

網址：

https://seer.cancer.gov/

適用的研究方向/領域：癌症和癌症的預後研究，各種死因的研究。

優點：涵蓋了各種癌症和死亡的數據，非常全面。

缺點：僅有一部分數據是免費的。

免費與否：部分免費。

是否需要註冊：需要註冊。

瀏覽器要求：建議使用 Chrome 瀏覽器。

圖片來源：官網截圖

這個資料庫估計聽過的小夥伴比較多。一部分數據是可以免費獲得的，可以用數據做比較簡單的 logistics 回歸（據說都是能發 2-3 分的文章）。

在搜尋引擎上搜索，也會發現大量的中文資源教大家怎麼使用 SEER 資料庫。

這麼多資料庫，除了 UK Biobank，其他都是可以直接免費獲得或者提交研究計劃後免費獲得。

以上，就是今天分享的內容，希望對你有幫助。#木木西裡#

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內容來源：科研論文時間

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