霍恩海姆是鋼之鍊金術師中非常重要的角色，他的外表參考了耶穌的父親約瑟，也可以說他是整個故事的起源。
霍恩海姆出生於鍊金術非常發達的國家克賽爾克賽斯，但是發達與否卻與他無關，因為他是這個國家的奴隸。主人利用他來做研究，把真理之門裡的真理變為實體困在瓶子中，被稱為瓶中小人。
這之後，瓶中小人為了報答霍恩海姆利用自己的血使他誕生，於是他教導霍恩海姆使用鍊金術，最終脫離了自己奴隸的身份，所以霍恩海姆同樣也感謝瓶中小人。霍恩海姆也想要為瓶中小人做點什麼，而瓶中小人只想要自由。但是這個願望卻難以實現，因為一旦脫離瓶子就會死去。
雖然瓶中小人想要自由的願望難以實現，但是依然出現了轉折點。擁有強大鍊金術能力的克賽爾克賽斯王想要獲得長生不死，於是他來求助瓶中小人。這個時候瓶中小人欺騙了他，叫他挖水路，還讓他濫殺無辜。其實這一切都是瓶中小人想要完成「血印」，創造出國土煉成陣。
在這一切都正常運行時，瓶中小人也成功利用霍恩海姆進行了人體煉成。整個國家1000多萬人的靈魂一個都不剩地被分別吸收到他們兩人體內。瓶中小人為了報答霍恩海姆，他還給了霍恩海姆人類最想要得到的長生不死。
但是這一切卻不是霍恩海姆想要的，他只是感到愧疚，因為自己的不負責任而導致了克賽爾克賽斯的滅亡。並且長生不死也給他造成了困擾，因為自己的身體不會變老所以沒辦法去談戀愛，直到他遇到了特蕾莎。
他與特蕾莎順利生活，還一同還產下了艾力克兄弟。但是霍恩海姆並沒有高興起來，他沒辦法接受自己的妻子和孩子慢慢老去。最終霍恩海姆決定為了自己的家人不再逃避，他決定暫時離開家人去找瓶中小人。只是這個離開，就再也沒能見到特蕾莎了。
某一天，霍恩海姆遇見自己的大兒子愛德華，愛德華沒辦法原諒他的離去。之後他又遇見了自己的小兒子阿爾，阿爾因為見過瓶中小人，所以能理解自己的父親所為。阿爾還把所以計劃都告訴給了霍恩海姆。霍恩海姆看著自己的孩子這麼信任自己，也把自己的計劃一五一十全部告訴了阿爾。
最終約定之日如期而至，儘管愛德華依然沒辦法原諒父親，但是面對boss瓶中小人，他只能暫時接受合作。作為交換，愛德華把母親臨終時的歲霍恩海姆說的話「對不起，我要先走了」告訴了他，聽到這句話的霍恩海姆當場淚崩，面對著這樣的父親，愛德華的心慢慢地也開始融化。
故事的結局是霍恩海姆利用自己體內靈魂的感情成功反制了瓶中小人，但是為了擊敗他也犧牲掉了小兒子阿爾。面對這樣的結果，他讓愛德華利用自己的身體來換回阿爾。其實劇情在這裡，相信所有觀眾都會認為愛德華利用父親來換回阿爾的生命，最終來一個大悲傷結局。但是誰也沒想到，在這個瞬間，愛德華拒絕了父親，而且還在這一刻終於對霍恩海姆叫出了「老爸」。
最後的最後，霍恩海姆拖著僅剩下精神的身體來到了特蕾莎的墳前笑著離開了。正如他曾經和特蕾莎所說「雖然沒辦法和你白頭偕老，但是至少我會跟上你的腳步一起離開」。
不得不說，身為奴隸的霍恩海姆渴望自由，但當他終於獲得自由時，才發下自己已經被困在永恆的「自由」當中。因為沒有犧牲就不會有回報，明明想要替兒子做些什麼，卻反倒被自己兒子上了一課，霍恩海姆真的是本作中相當有特色的人物。