#軟體工程##基因組觀#Juicebox:可視化Hi-C互作區(Cell System 乾貨)V1.0

2021-02-26 生物信息

Juicebox Provides a Visualization System for Hi-C Contact Maps with Unlimited Zoom

Juicebox程序  提供了Hi-C互作圖譜高解析度的可視化方案

Erez Lieberman Aiden

（大神級的人物，諾獎都無法企及）

The Center for Genome Architecture, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA

•Juicebox enables users to explore Hi-C contact maps

•Juicebox程序允許用戶探索HiC DNA互作圖譜

•Users can create maps from their own experimental data

•用戶可以以自己的實驗數據 來創建圖譜

•Users can zoom in and out of a contact map in real time

•用戶可以實時放大縮小圖譜 並尋找聯繫

•Maps can be compared to 1D tracks, 2D feature sets, or one another

•圖譜可以解構為「一維」，「二維」特性集，相互之間進行轉換

Hi-C experiments study how genomes fold in 3D, generating contact maps containing features as small as 20 bp and as large as 200 Mb. 

Hi-C 實驗研究 基因組如何摺疊三維形態；生成的DNA接觸圖譜精度能小到20 bp和長到200 Mb DNA的互作。

Here we introduce Juicebox, a tool for exploring Hi-C and other contact map data. 

本工作介紹Juicebox程序，探索Hi-C 的工具和其他圖譜數據之間的聯繫。

Juicebox allows users to zoom in and out of Hi-C maps interactively, just as a user of Google Earth might zoom in and out of a geographic map. 

Juicebox程序 允許用戶放大和縮小Hi-C 圖的交互圖譜；就像用戶使用谷歌地球 放大和縮小地理地圖的體驗一樣。

Maps can be compared to one another, or to 1D tracks or 2D feature sets.

圖譜可以比較：或「一維」軌道或「二維」特性集。

原文連結為該文


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