中國科大在動物長鏈非編碼RNA研究中取得進展

2021-01-08 中國科學院

　　中國科學技術大學生命科學學院非編碼RNA功能及功能機理研究團隊近日在國際期刊《基因組生物學》（Genome Biology）發表了題為Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章，報導了實驗室最新的研究成果。該實驗室通過優化的基因編輯技術，對秀麗線蟲中155個基因間的長鏈非編碼RNA(lincRNA)進行逐一敲除（秀麗線蟲已知的全部lincRNA共170個），系統地研究了秀麗線蟲中lincRNA的功能。這是第一篇在多細胞動物中利用基因編輯技術、在全基因組水平上、對一個種類的長非編碼RNA進行敲除並系統分析其在動物中生理功能及功能機理的研究。

　　他們對155個lincRNA敲除突變體進行六個方面表型的篩選發現，23個lincRNA突變體分別在其中一個或者兩個生理表型上具有不同程度的缺陷。通過對秀麗線蟲不同發育時期的轉錄組測序進行分析，研究了lincRNA和mRNA共表達情況，同時建立了lincRNA和microRNA共表達及調控網絡。通過對秀麗線蟲不同發育時期近300個轉錄因子的分析來探究轉錄因子在線蟲不同發育階段對lincRNA表達的調控，進而研究了這23個lincRNA行使其生理調控功能的機理。

　　該研究系統地探索了lincRNA在多細胞動物中的生理功能，一定程度拓寬了lincRNA研究領域。同時該研究獲得的lincRNA敲除線蟲株，為後續進一步研究長鏈非編碼RNA在衰老和疾病等中的作用提供了有力支持。文章的共同第一作者是博士生衛帥、博士後陳禾和最近博士畢業的國際學生Emmanuel Enoch Dzakah，通訊作者為中國科大教授單革。

　　該研究得到科技部、國家基金委和中科院「衰老的生物學基礎和幹預策略」先導科技專項（培育）的經費支持。

　　論文連結

 

中國科大在動物長鏈非編碼RNA研究中取得進展

　　中國科學技術大學生命科學學院非編碼RNA功能及功能機理研究團隊近日在國際期刊《基因組生物學》（Genome Biology）發表了題為Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章，報導了實驗室最新的研究成果。該實驗室通過優化的基因編輯技術，對秀麗線蟲中155個基因間的長鏈非編碼RNA(lincRNA)進行逐一敲除（秀麗線蟲已知的全部lincRNA共170個），系統地研究了秀麗線蟲中lincRNA的功能。這是第一篇在多細胞動物中利用基因編輯技術、在全基因組水平上、對一個種類的長非編碼RNA進行敲除並系統分析其在動物中生理功能及功能機理的研究。
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　　該研究系統地探索了lincRNA在多細胞動物中的生理功能，一定程度拓寬了lincRNA研究領域。同時該研究獲得的lincRNA敲除線蟲株，為後續進一步研究長鏈非編碼RNA在衰老和疾病等中的作用提供了有力支持。文章的共同第一作者是博士生衛帥、博士後陳禾和最近博士畢業的國際學生Emmanuel Enoch Dzakah，通訊作者為中國科大教授單革。
　　該研究得到科技部、國家基金委和中科院「衰老的生物學基礎和幹預策略」先導科技專項（培育）的經費支持。
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