小結| 2月下半月circRNA研究報導匯總

2020-11-24 騰訊網

歡迎各位來到「circRNA研究報導匯總」欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發布的circRNA文獻共計24篇,下面我們一起回顧下過去一個月circRNA有哪些進展。

1、肝細胞癌EMT過程中YY1複合物通過與Quaking超增強子結合促進Quaking表達

文獻標題:YY1 complex promotes Quaking expression via super-enhancer binding during EMT of hepatocellular carcinoma

期刊:Cancer Res.

影響因子:9.13

通訊作者單位:南開大學

QKI可變剪切因子在EMT(上皮間質轉化)中可調控circRNA的形成,但具體機制還不明確。HCC肝細胞癌中,高表達的QKI預示臨床短生存期,高轉移性。該研究發現YY1/p65/p300複合物可促進QKI基因的轉錄激活,YY1結合QKI基因的超級增強子上,p65結合QKI的啟動子,p300起到位置YY1複合體與QKI的結合作用。體內體外實驗共同表明,YY1/p65/p300複合物增強QKI的表達並促進circRNA的形成,最終導致HCC惡性程度的增加。進一步的研究表明金絲桃苷(又名槲皮素-3-O-β-D-吡喃半乳糖苷,屬於黃酮醇苷類化合物)可靶向YY1/p65/p300複合物抑制QKI的表達,阻止HCC細胞的惡性轉化。

圖註:QKI與EMT過程相關並促進circRNA形成。A:QKI過表達的PLC-PRF-5細胞表達譜晶片分析發現,主要與VEGF,NF-KB通路激活,細胞粘附和凋亡途徑下調相關。B:過表達QKI後上調基因主要與細胞增殖、遷移和血管生成相關。c、d、e:腫瘤、QKI過表達和YY1過表達組中circRNA聚類分析發現大部分circRNA受QKI和YY1影響。F:受QKI和YY1過表達影響而上調的circRNA交集圖。G:circRNA,miRNA和mRNA的ceRNA互作網絡圖。H:qPCR驗證的部分受QKI和YY1影響的circRNA。I:QKI調控的circ0008150, circ0007821, 和 circ0029308可促進細胞侵襲能力增強。

2、環狀RNA cTFRC充當MicroRNA-107的海綿以促進膀胱癌進展

文獻標題:Circular RNA cTFRC acts as the sponge of MicroRNA-107 to promote bladder carcinoma progression

期刊:Mol Cancer.

影響因子:7.776

通訊作者單位:西南醫科大學附屬中醫醫院

該研究首先針對3對膀胱癌患者組織進行circRNA高通量篩選,發現circRNA-cTFRC在膀胱癌中顯著上調,且與腫瘤惡性程度和生存率密切相關。體內外實驗表明敲定circRNA-cTFRC可顯著抑制膀胱癌增殖和侵襲。進一步在膀胱癌細胞和臨床組織標本中circRNA-cTFRC和miR-107負相關,另外上調circRNA-cTFRC可促進宿主基因TFRC的表達導致BC細胞EMT轉化。表明circRNA-cTFRC在膀胱癌中起重要調控功能是潛在的診斷和治療標誌物。

圖註:cTFRC介導TGF-β誘導的EMT過程。A-B:TGF-β或LiCL處理EJ細胞EMT過程中cTFRC和TFRC均增加(qPCR和WB)。C:cTFRC過表達的BC細胞可觀察到EMT樣細胞形態。D:WB分析cTFRC過表達的BC細胞中TFRC的表達水平升高。E:幹擾cTFRC後,TFRC下調,E-cadherin上調。F:幹擾TFRC後,E-cadherin上調。

3、精神分裂症患者皮質灰質中環狀RNA減少可能改變相關miRNA的功能

文獻標題:Circular RNA biogenesis is decreased in postmortem cortical gray matter in schizophrenia and may alter the bioavailability of associated miRNA

期刊:Neuropsychopharmacology

影響因子:6.544

通訊作者單位:澳大利亞雪梨精神分裂症研究所

環狀RNA(circRNA)分子在哺乳動物大腦中相對穩定並且特別豐富,因此可能參與神經發育和功能。之前研究報導circRNA分子涉及突觸可塑性等多個生物學過程,因此作者推測circRNA可能在神經行為障礙中起作用。該研究中作者利用circRNA高通量測序技術分析了35個皮質灰質(BA46)精神分裂症(已死亡)和非精神病學對照組的患者的腦皮質中circRNA表達。儘管在背外側前額葉皮層(DLPFC)中鑑定出超過90,000種circRNA物種,但與對照相比,該病症標本中的circRNA複雜性較低,可變剪接率更高且快速耗盡。這些快速耗盡的circRNA預測結合的miRNA,跟多數上調的miRNA重合,預示circRNA可能通過miRNA發揮重要生理功能,差異表達的circRNA宿主基因的基因富集分析發現與神經功能和神經障礙顯著相關,該研究首次報導精神分裂症中circRNAs表達異常,並提示circRNA在精神疾病的病理生理學中發揮重要作用,甚至可以作為治療靶標。

文獻列表:

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