circRNA研究領域，最近有件事很轟動。連續兩篇《Molecular Cell》上的研究揭示了circRNA翻譯蛋白的能力。這讓很多小夥伴們都凌亂了，好不容易從母基因調控，ceRNA機制去研究circRNA，怎麼跳出來circRNA還可以去翻譯蛋白調控細胞功能呢？對於這件事情，小編認為，這對於circRNA研究來說，是一個新的機制研究方向，是一個新的突破。那麼，怎麼去預測一些一個circRNA是否具有翻譯潛能呢？以下幾個在線工具，小編只介紹一次，你一定要記住哦。
一段RNA序列，無論是線性，還是環狀的，是不是具有翻譯潛能，首先得看是否有開放閱讀框（ORF）。因此，決定一個circRNA是否有翻譯潛能，第一步就要看看這個circRNA是否有ORF區域。ORF Finder (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)，只要您輸入circRNA的序列信息，就可以直接看到ORF區域了。
CircRNA有ORF區域，要想實現翻譯還有另外一個條件，那就是具有內在的核糖體進入結合位點（Internal Ribosome Entry Site，IRES）。IRESite（http://iresite.org/IRESite_web.php），基於已有68個病毒和115個真核細胞的實驗數據，收錄了大量的具有IRES位點的基因。因此，將感興趣的circRNA的序列輸入比對，就能預測circRNA是否具有IRES位點。
除了以上兩個資料庫，Pfam31.0(http://pfam.xfam.org/),也可以用來分析circRNA序列是否具有ORFs，也能對已知蛋白motif進行檢索。
以上3個網站基本把circRNA是否具有ORF，是否具有IRES進行了預測，如果一個circRNA滿足以上條件，那麼，它具有翻譯的能力已經很近了。CircInteractome（http://circinteractome.nia.nih.gov/index.html），專門用於circRNA信息檢索和預測的網站，可以預測RNA結合蛋白（RBP）和miRNA是否能結合到circRNA上。因此，如果通過上面的預測，知道某個circRNA具有IRES，那麼可以通過這個網站來看看特定的RBP是否能和該circRNA結合，以確保預測數據的可靠性。
以上4個網站基本可以實現對circRNA是否具有翻譯能力進行預測。如果通過前期篩選的circRNA具有翻譯能力。那麼，在後續功能研究的時候，就可以通過circRNA-蛋白-功能的路線出發，相信一定會有非常好的科研成果出來。
參考文獻：Granados-Riveron JT, Aquino-Jarquin G. The complexity of the translation ability of circRNAs. Biochim Biophys Acta. 2016 Oct;1859(10):1245-51.