宋旭:長非編碼RNA-蛋白質相互作用對基因表達的調控

崔慶華:在長非編碼RNA的世界中,一定存在著長非編碼RNA中的P53, PTEN

隨著人類基因組計劃的初步完成，人們發現「能夠編碼蛋白質的基因只佔全部基因組的2%左右」，而之後的ENCODE計劃揭示了非編碼RNA佔據了剩下的98%人類基因組中的大量份額，非編碼RNA在生物信息領域中扮演著越來越重要的角色，有關非編碼RNA的研究也多次入選「世界科學十大進展」或「世界醫學十大進展」。但是，目前相對於蛋白質編碼基因，人們對非編碼RNA的了解十分有限。

沈曉驊:關於一個長鏈非編碼RNA對HOXA基因表達調控研究的論文

文章首次提出了一個長鏈非編碼RNA（lncRNA）的表達產物和編碼這個lncRNA的基因組區域同時對其下遊的HOXA基因簇的表達進行調控，並且起著相反的調控方式。PTN-BBS聯合培養項目2010級學生尹亞飛為本文的第一作者，論文的其他作者還包括2012級清華大學—北京大學生命科學聯合中心（CLS）2012級學生顏丕熙和盧雨陽等。沈曉驊博士為本文的通訊作者。

我國學者揭示長鏈非編碼RNA順式調控基因表達的新模式

RNA調控基因表達和多能幹細胞分化），系統揭示了長鏈非編碼RNA順式調控基因組上鄰近基因的表達，以及它們在幹細胞分化和發育中的作用。LncRNA的功能分類及預測，是非編碼RNA領域一直追尋和探索的重要問題，它對於認識非編碼RNA生物學功能和存在的意義具有重要作用。沈曉驊研究組發現，lncRNA在基因組上的分布不是隨機的，並根據它們在基因組上與鄰近蛋白編碼基因的位置關係進行了分類。其中，反義長鏈非編碼RNA（divergent lncRNAs）與鄰近蛋白基因在基因組上以頭對頭的方式反向排列和轉錄。

Nucleic Acids Research:研究揭示長非編碼RNA對節律基因的調控機制

該項研究揭示了一類節律表達的長非編碼RNA（lncRNA）標記了基因組上可以介導長程染色質相互作用的增強子，並通過這種相互作用調節了節律基因的表達。晝夜節律（circadian rhythm）是一種24小時的周期性生理現象，可以通過在轉錄水平、轉錄後水平等多種層次上調控基因表達，來調節動物的許多生理與行為過程。

辜雪硯、林海帆共同綜述:PIWI蛋白及piRNA對基因表達的調控

揭示反義長鏈非編碼RNA順式調控基因轉錄的新模式

》（Divergent lncRNAs regulate gene expression and lineage differentiation in pluripotent cells）的研究論文，系統揭示了長鏈非編碼RNA順式調控基因組上鄰近基因的表達，以及它們在幹細胞分化和發育中的作用。

基因測序(視頻+課件),輕鬆學會數據的處理和分析

資料內容：基因組學PPT（中英聯合實驗室)1、基因組學_課件_遺傳作圖2、基因組學_課件基因組測序與序列組裝3、基因組學_課件_基因組序列的詮釋4、基因組學_課件_基因組解剖5、基因組學_課件_基因的表達調控6、基因組學_課件_比較基因組學7、基因組學_課件_功能基因組學

史上最全非編碼RNA合集，擁有2021的第一篇SCI

非編碼RNA的前世今生多年來，人們已經清楚的認識了一系列結構RNA和調節RNA。ncRNA比以前所想像的要豐富和重要的多,它們在轉錄調節,染色體複製,RNA加工,修飾,mRNA穩定性和翻譯,甚至蛋白質降解和轉運過程中都起作用。

長鏈非編碼 RNA DANCR 在部分腫瘤性疾病中作用的研究進展

Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｗｙ＿ｓｍｃ＠１６３.ｃｏｍ［摘要］長鏈非編碼RNA(long non-coding RNAs，lncRNAs)是一大類長度超過200個鹼基對的具有有限蛋白質編碼能力的轉錄本，在調控基因表達、染色質修飾、轉錄調控等過程中均發揮了重要的作用。

Cell:發現長非編碼RNA對細胞核仁功能的重要調控機制

associated with Pol I transcription，該成果揭示了長非編碼RNA SLERT 在細胞核仁功能和RNA聚合酶I (Pol I) 轉錄過程中的重要作用機制。由於rDNA序列具有高度重複性，因而這些序列上非常相似的rDNA的差異表達如何實現和相關Pol I轉錄調控機制等仍然未知。經典的長非編碼RNA和mRNA結構相似，含有5' 端帽子及3' 端多聚腺苷酸尾巴結構，廣泛參與各種重要生命活動的調控。

四川大學黃燦華團隊 | 從非編碼RNA與氧化應激相互調控的角度重新審視腫瘤特徵 | Molecular Biomedicine

非編碼RNA是人體中主要的轉錄產物，能夠通過調控基因的轉錄來調控細胞的各種生理和病理過程。近年來，非編碼RNA的異常表達已被證實與多種腫瘤的發生、轉移和耐藥等過程密切相關。其中，miRNA和lncRNA可通過與DNA、RNA或蛋白質結合或編碼小肽來調節大多數腫瘤特徵，使得其有望成為腫瘤診斷和治療的新型生物標誌物[2]。

非編碼RNA研究技術大盤點

目前主要研究方向集中在非編碼RNA 及其相互結合的DNA、RNA、蛋白質等科學問題，而科學問題的解答依賴於實驗技術的創新使用和革命。ncRNA可以海陸空全面調控細胞功能，厲害了，其實主要指lncRNA，而miRNA、siRNA主要作用於mRNA層面，本文按非編碼RNA的三個調控維度，就當前主要的實驗技術簡單介紹一下。

Cell Reports報導揭示非編碼RNA和轉座子在長壽中的作用機制

3月21日，中國科學院-馬普學會計算生物學夥伴研究所研究員韓敬東在《細胞-報告》（Cell Reports）上在線發表了題為Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin-Related Factors 的研究論文，該研究在探索能量限制調控非編碼

2月長非編碼RNA和環狀RNA研究推薦

長非編碼RNA研究推薦1.Nature Medicine: 調控巨噬細胞膽固醇穩態及動脈粥樣硬化的長非編碼RNALXRs是配體依賴性轉錄因子，調節參與巨噬細胞對膽固醇反應的基因的表達。其中，LXRs的激活通過誘導一系列基因（包括編碼質膜轉運蛋白ABCA1的Abca1）促進膽固醇逆向轉運。Abca1對於高密度脂蛋白（HDL）的產生是至關重要的，其功能的缺失會導致丹吉爾病（Tangier disease）。研究者通過用LXRs的興奮劑處理細胞，鑑定到一系列差異表達的長非編碼RNA。

...附屬兒科醫院周玉峰課題組揭示長非編碼RNA調控巨噬細胞活化和...

然而，M2型巨噬細胞激活的調控機制尚未完全清楚，尤其是長非編碼RNA（lncRNA）在其中的作用還知之甚少。近日，復旦大學生物醫學研究院、附屬兒科醫院周玉峰課題組在Science Advances 雜誌發表題為「LncRNA PTPRE-AS1 modulates M2 macrophage activation and inflammatory diseases by epigenetic promotion of PTPRE」的文章，揭示了長非編碼RNA調控M2型巨噬細胞活化和炎症性疾病的新機制

RAN在細胞中作用是什麼?RNA參與基因調控嗎?

基因，到處都是基因，而不是蛋白質這是常見的三種RNA的功能，但是在過去的二十年裡，科學家們發現了一個潘多拉盒子，裡面有不同的RNA，它們與蛋白質合成沒有直接關係。這些RNA被廣泛稱為「非編碼RNA」（ncRNA）。

新技術「解密」非編碼RNA

作者| 韓揚眉增強子—啟動子RNA連結圖薛願超供圖人類基因組計劃研究表明，人類基因組中只有不到2%的蛋白質編碼序列，而剩餘98%為非編碼核酸序列。這些非編碼序列可能有功能，也可能僅僅是副產物，曾被稱為「垃圾DNA」或者「暗物質」。

【盤點】非編碼RNA與人類疾病關聯性亮點研究

隨著基因組學和生物信息學的發展，尤其是高通量測序技術的大量應用，科學家發現了越來越多的非蛋白編碼的轉錄單元（即非編碼RNA，ncRNAs），長非編碼RNA在許多重要的生物進程中都起著重要作用，在哺乳動物早期發育過程中lncRNA能調節多種細胞中的基因表達，癌細胞中lncRNAs的改變也被發現與腫瘤形成、發展和轉移密切相關，近期的研究還發現，非編碼RNA，尤其是microRNA參與了炎症反應的發展

生物醫學研究院、附屬兒科醫院周玉峰課題組揭示長非編碼RNA調控巨...