基因測序(視頻+課件),輕鬆學會數據的處理和分析

2021-01-12 紐創博美

生物信息學與以往的傳統生物學不同，它本身是一個混合體，而且在今天看來它應當還要包含現在的NGS和基因組學。它重在數據，因此在這個領域中比較重要的是數學和計算機——計算機指的是：編程能力和算法設計能力。

但生物信息畢竟還是和生物有關，毫無生物知識其實也說不過去。那麼對於初學者來說，想要進入這個領域，我覺得一開始需要重點搞清楚幾個基本概念。比如，什麼是基因組，什麼是轉錄組，什麼是蛋白組，什麼是染色體，什麼是基因，什麼是基因重組，什麼是進化/演化，什麼是表觀遺傳，什麼是變異，變異類型有哪些，NGS技術是什麼，測序儀的工作原理是什麼，DNA是如何被測出來的等這些東西。因為，你只有真正了解數據是如何來的，才能更好地明白數據該如何處理和分析，以及如何才能有效地挖掘出它背後隱含的生物知識。

資料內容：

基因組學PPT（中英聯合實驗室)

1、基因組學_課件_遺傳作圖

2、基因組學_課件基因組測序與序列組裝

3、基因組學_課件_基因組序列的詮釋

4、基因組學_課件_基因組解剖

5、基因組學_課件_基因的表達調控

6、基因組學_課件_比較基因組學

7、基因組學_課件_功能基因組學

8、基金標書摘要撰寫技巧+中標經驗

9、基因組學 課件 分子進化

單個基因生物信息學分析視頻教程13講

1、單個基因生物信息學分析 - 概述

2、基因結構預測和功能注釋

3、蛋白結構域預測

4、同源基因分析

5、多序列比對

6、蛋白二級三級結構預測

7、蛋白特性分析

8、跨膜結構分析

9、信號肽分析

10、亞細胞定位預測

11、調控目的基因的miRNA預測

12、啟動子分析

13、基因表達分析

14、單個基因生物信息分析課程-資料

基因組學講義

1、實驗技能課系列--高通量測序實踐

2、蛋白質組分析資料

3、陳連福第三期NGS生物信息學講習與交流會議邀請函

4、宋述慧=第二代RNA-Seq數據分析理論及上機

5、周曉光-第二代測序技術

6、陳飛老師核酸檢測及診斷技術

7、胡松年老師：基因轉錄組的測定及分析

8、胡松年老師：基因組文章構成分析

9、Acupuncture for Chronic Pain

基因組學與蛋白質組學

1、微生物基因組學

2、基因組學_電子書

3、蛋白質組學分析技術

4、蛋白質與蛋白質組學實驗指南

基因晶片技術

1、雙端測序介紹

2、基因晶片與功能基因組_電子書

3、基因晶片檢測技術

4、基因晶片技術-電子書

5、高通量測序的應用與進展

6、單細胞測序在表觀遺傳學中的應用

基因測序（視頻+課件）

1、【從零學測序】癌症基因組重測序分析第一講 √

2、【從零學測序】癌症基因組重測序分析第二講 √

3、【從零學測序】癌症基因組重測序分析第三講 √

4、【從零學測序】癌症基因組重測序分析第四講 √

5、【從零學測序】癌症基因組重測序分析第五講 √

6、【從零學測序】癌症基因組重測序分析第六講之circos圖的繪製

癌症基因組重測序分析

1、視頻和PPT

2、測序中國推廣大使邀請

3、癌症基因組文章

轉錄組和長非編碼RNA測序

1、轉錄組與長非編碼RNA測序分析第一講

2、轉錄組與長非編碼RNA測序分析第二講

3、轉錄組與長非編碼RNA測序分析第四講

4、轉錄組與長非編碼RNA測序分析第五講

5、轉錄組實戰講解第三講之測序質量評估和Reads回貼

轉錄組分析視頻課程

1、轉錄組新轉錄本和新lncRNA

2、轉錄組資料庫準備和質控

3、轉錄組分析簡介

4、轉錄組差異表達

5、轉錄組比對和表達量計算

6、轉錄組新轉錄本和新lncRNA

7、轉錄組差異表達

8、轉錄組-比對和表達量計算

9、轉錄組分析簡介

小rna測序

1、小rna測序1_質控和reads長度統計

2、小rna測序2_比對genome_miRNA_Rfam

3、小rna測序3_ 差異表達和靶基因

4、小rna測序4_新miRNA

高通量測序生物信息分析

1、Linux操作與生物信息

2、高通量測序生物信息分析

3、RNAseq生物信息分析

4、16S測序生物信息分析

5、高通量核酸檢測技術概述

蛋白質測序

1、蛋白檢測篇1-Western Blot

2、蛋白檢測篇2-免疫組化

3、蛋白檢測篇3-免疫螢光技術

4、蛋白檢測篇4-免疫共沉澱（Co-IP）

5、蛋白檢測篇5-GST-pulldown

6、蛋白檢測篇6-雙向凝膠電泳

7、蛋白檢測篇7-ELISA

8、蛋白檢測篇8-酵母雙雜交系統

9、蛋白檢測篇9-FRET

生物信息學--LncRNA與circRNA

1、2014-2015年自然基金中,lncRNA項目和分析匯總.pdfx

2、DNA甲基化相關的lncRNAs肝癌發生過程中的功能及機制研究

3、lncRNA 在腫瘤中的作用

4、lncRNA與miRNA相互調控作用及其與腫瘤的關係

5、lncRNA作用機制

6、長鏈非編碼RNA的作用機制及其研究方法

7、從互作揭開lncRNA的秘密

8、基因印記與lncRNA

9、肝細胞癌1ncRNA表達譜研究

10、lncRNA研究範文 Control of somatic tissue differentiation by the long non-coding

其他資料

1、測序的發展與文獻案例剖析

2、轉錄組有參考生物信息分析結題報告模版-V2.0

3、DenovoRNA測序分析報告

4、轉錄組測序方案與報告解讀

5、piRNA測序分析報告-動物

6、NGS在轉錄組互相作用網絡研究中的應用

7、NGS組學實踐項目練習

8、差異表達基因相關ppt

相關焦點

  • 三代nanopore宏基因組測序數據分析，北京，11月7-9日
    本期主題圍繞「nanopore宏基因組測序數據分析」，nanopore測序實時，快速，便攜，長度長，高通量等諸多特點，特別適合微生物研究。在新冠病毒研究以及後續病毒溯源方面都會有重要的應用。主講老師王通曾任職於華大基因，10年以上生物信息分析經驗，從2010年開始做宏基因組數據分析
  • 基因擴增和基因測序分析3D虛擬仿真軟體
    在基因測序指導下的遺傳病診治、個性化精準醫療等能夠更加高效的進行。 基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用，可以說基因測序技術是下一個改變世界的技術。
  • 單細胞基因測序市場分析
    二、單細胞基因測序的基本流程：單細胞分離--基因組擴增--測序和分析　　單細胞測序，簡單地說，主要經過如下的步驟：單細胞的分離--DNA/RNA的提取和擴增(全基因組擴增和全轉錄組擴增)---測序以及後續的分析和應用。
  • 2015年基因測序領域產業格局分析
    ，大數據處理能力提升也為分析和解讀基因數據提供支持，測序技術及大數據分析能力的不斷提升將會推動精準醫學進入快速增長的軌道。由於第三代DNA測序技術目前面臨測序成本高和測序結果準確度相對較低的市場化瓶頸，因此TGS儀器大規模商業化仍然需要較長的時間。NGS各環節對測序結果有重要影響：NGS測序流程包括樣本收集、基因提取、文庫構建、基因測序和數據分析，各環節的準確性對測序結果有重要影響，比對資料庫的規模直接影響數據分析結果的準確性。
  • 單細胞測序揭開「作物遺傳分析和產量基因挖掘」新篇章
    然而重要調控基因的遺傳分析常受制於基因的冗餘性和多效性。為突破這一瓶頸，來自美國冷泉港實驗室的David Jackson 課題組及多個合作團隊的研究者們利用玉米這一糧食農作物作為研究對象，聚焦花序器官早期發育這一決定性階段，運用時下先進的單細胞轉錄組測序 (scRNA-seq) 技術， 構建單細胞水平基因共表達網絡並準確預測基因冗餘，進而整合特異性細胞群體染色質開放數據，鑑定關鍵轉錄因子調控位點，最終結合全基因組關聯分析挖掘產量性狀相關基因。
  • 中國基因測序專利分析
    基因測序（檢測）技術是指通過血液、體液、細胞等對DNA進行分析、檢測的技術。從技術的演變升級來看，國際基因測序技術主要歷經三代：第一代測序技術基於Sanger和Coulson在1975年發明的雙脫氧終止法的測序原理，並結合螢光標記以及毛細管陣列電泳技術來實現自動測序。第二代測序技術共同的特點是以捨棄讀長為代價實現了高通量。
  • AI技術運用基因測序 助力基因組計劃
    記者從有關渠道獲悉,近一年多來我國地方政府也紛紛啟動基因組測序計劃:江蘇、福建已經啟動百萬基因組測序計劃,而在北京更大範圍的基因測序也在進行。有關預計顯示,2020年我國基因測序市場規模將達到180億元,約佔世界基因測序市場總規模的1/5。不少科技公司看準基因大數據行業爆發性增長趨勢,開始積極布局搶佔基因測序市場。除了華大基因之外,人工智慧企業也在躍躍欲試。
  • 基因測序行業前景及趨勢分析（附報告目錄）
    在基因測序過程中得到基因序列僅僅是第一步，下一步的工作即生物信息分析，主要包括收集、整理、檢索和分析序列中表達的基因序列與功能的信息，找出規律，因此生物信息技術是基因測序的核心環節。隨著二代測序技術產生的數據量越來越龐大，數據解讀技術的不斷提升推動了行業的持續發展。
  • 這裡有10G的生物信息學中個層次的分析技術匯總
    生物信息學（Bioinformatics）是研究生物信息的採集、處理、存儲、傳播，分析和解釋等各方面的學科，也是隨著生命科學和計算機科學的迅速發展，生命科學和計算機科學相結合形成的一門新學科。它通過綜合利用生物學，計算機科學和信息技術揭示大量而複雜的生物數據所賦有的生物學奧秘。
  • 「基因組與轉錄組高通量測序應用最新技術與數據分析」高級實操...
    由此不斷產生出巨量的分子生物學數據，這些數據有著數量巨大、關係複雜的特點，以至於不利用計算機根本無法實現數據的存儲和分析。隨著生物信息學作為新興學科迅速蓬勃發展，正在改變人們研究生物醫學的傳統方式，高通量測序技術以及數據分析技術已成為探索生物學底層機制和研究人類複雜疾病診斷、治療及預後的重要工具，廣泛應用於生命科學各個領域，是21世紀生命科學與生物技術的重要戰略前沿和主要突破口。
  • 基因測序實驗室信息化管理
    同時,生命科學研究對分析測試的要求無論在樣品數量、分析周期、分析項目和數據準確性等方面都提出了更高的標準和要求,生物實驗室產出的信息呈幾何級數增長。在傳統的生物實驗室中,由於數據管理分散、類型多樣、格式不一,使對數據的保存、交換、查詢、分析、維護都很不方便,也嚴重阻礙了研究人員之間的信息交流。
  • 「基因組與轉錄組高通量測序應用最新技術與數據分析」高級實操班...
    由此不斷產生出巨量的分子生物學數據，這些數據有著數量巨大、關係複雜的特點，以至於不利用計算機根本無法實現數據的存儲和分析。隨著生物信息學作為新興學科迅速蓬勃發展，正在改變人們研究生物醫學的傳統方式，高通量測序技術以及數據分析技術已成為探索生物學底層機制和研究人類複雜疾病診斷、治療及預後的重要工具，廣泛應用於生命科學各個領域，是21世紀生命科學與生物技術的重要戰略前沿和主要突破口。
  • 美格基因引入Nanopore平臺助力宏基因組三代測序!
    1、更真實反映菌群實際組成美格基因三代宏基因組採用「三+二」測序策略，三代宏基因組測序策略解決了二代讀長短的限制，能輕鬆覆蓋基因間區或基因特異性區域，長讀長Reads能夠更為精準地鑑定水體、土壤、腸道等生境中微生物的種類，有效提高微生物群落鑑定的解析度，更加真實的反映菌群的實際組成。
  • 基因測序行業專題報告——NGS引領測序行業黃金十年,納米孔突破...
    在某種程度上這是由於基因組數據集缺乏多樣性，目前的數據組成嚴重偏向來自於歐洲的樣本，但是整個歐洲的人口卻整體開始走上負增長的道路，因此收集和分析來源更多、更多樣的基因組學數據將是精確醫療真正落地的關鍵因素。在美國以外（Outside the United States，OUS）的其他國家，出現了許多初創基因組公司有望促成基因數據多樣性的最後閉環，嗅到了趨勢的資本紛紛跟進。
  • 下一代測序技術臨床應用現狀和發展趨勢
    例如某些針對表皮生長因子受體靶向藥基因突變檢測、鉑類藥物相關敏感性基因檢測和細胞色素P450家族基因如CYP2D6分型檢測等。影響藥物代謝或敏感性基因很多，應用NGS技術可以得到單個患者成百上千個基因分型結果，全面指導其用藥。二、NGS技術臨床應用質控問題的現狀和解決辦法初探NGS檢測比常規分子檢測複雜，實驗操作部分和生物信息分析部分包括眾多實驗處理和分析程序。
  • 科學家提出基因測序數據分類新標準
    科學家提出基因測序數據分類新標準有助於開發出更有效的疫苗；更迅速應對潛在公共衛生突發事件  最近，美國洛斯阿拉莫斯國家實驗室（LANL）的一個遺傳學小組和一國際財團聯合提出了一套旨在闡明可公開獲取的基因測序數據信息的質量標準
  • 淺談基因測序領域的創新和定位
    雖然說技術本身還不完美，但開闢了潛在的遺傳病的基因治療、物種改造的新市場，並使得基因技術向個人化掌握成為了可能。目前高通量測序只有Hiseq X10有這個可能，因為它的低廉成本加速了大量數據的產生，可能創造新市場。NGS技術帶來測序成本下降後，如何更快、更簡便地獲取更可靠的數據，成為了市場中的一個穩定需求。由於生物信息人才的缺乏，也出現了專門從事生物信息數據解讀處理的公司。
  • 精於數據處理:自動化單細胞分析軟體——CeleScope
    你是否還在為單細胞數據分析而發愁？是否還在為重新學習各種分析軟體而苦惱？今天給大家介紹一個單細胞數據分析軟體——CeleScope™，簡單易上手，結果準確可靠，讓你的研究更進一步！CeleScope™是一系列用於分析新格元GEXSCOPE®單細胞測序數據的生物信息流程。可從二代測序下機的原始fastq數據開始處理，包含數據拆分、比對、定量、生成表達矩陣、分群等功能。
  • 基因測序概念是什麼意思?基因測序概念股有哪些?
    綜投網（www.zt5.com）08月17日訊　　定義：基因測序是一種新型基因檢測技術，能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列 健康中國，醫藥 3 002642 榮之聯 8.52 -1.05% 依託華大基因布局「生物雲」，基因測序能力位居全球第一。