眾所周知，毒品對人體造成傷害非常巨大，首當其衝是重要器官，例如大腦、心臟、肝、肺等。至於吸毒對哪些器官傷害最大，這需要根據毒品的種類來區分。
大腦和中樞神經的傷害
對應毒品：冰毒、麻古、搖頭丸、甲卡西酮（浴鹽）
上述毒品給人體帶來的興奮快感，本質是強烈刺激大腦和中樞神經系統而來的。因此，它們對人體的大腦和中樞神經傷害最大。
長期吸食此類興奮作用的毒品，對大腦和中樞神經系統是一種惡性刺激，不可避免地會產生直接毒性作用，導致神經細胞或組織不可逆的病理性改變。
久而久之，就會使吸食者判斷能力下降、注意力分散，出現多疑、猜忌、記憶力衰退、失眠、焦慮症、大腦中風、認知功能損害等一系列大症狀。
而吸食者產生的幻覺、幻聽、產生被害妄想、暴力傾向，實質是大腦和中樞神經系統受損導致的苯丙胺精神病。
口腔牙齒的傷害
對應毒品：冰毒、麻古
冰毒、麻古本身具有大量酸類成分（蓄電池酸，肥料和家用清潔劑），必然會腐蝕牙齒。
另外，由於冰毒、麻古的藥效較長，在此期間吸食者會渴望吃甜食（如碳酸飲料和糖果），同樣也會影響到牙齒。
因此吸食冰毒、麻古會對口腔黏膜和牙齒會造成多重損害，出現口腔潰瘍、牙齒發黃及脫落，最主要的是還會影響顳頜關節的功能，並可出現三叉神經痛的症狀。
心臟的傷害
對應毒品：海洛因、古柯鹼、冰毒、麻古、搖頭丸
毒品可以對心血管系統產生直接毒性，吸毒經常引起各種心律失常和缺血性改變，其表現與不同毒品的藥理作用有關。
毒品成癮者在吸毒後24小時內，55%有異常心電圖表現，而注射古柯鹼短期內即出現心動過速，此外，還可出現心動過緩、室性期前收縮、室性心動過速和室顫及心肌收縮不全，引發心梗猝死和腦血管意外。
肺部的傷害
對應毒品：海洛因、冰毒、麻古、大麻
鼻吸毒煙會使毒素沉積在肺中，對肺臟造成進一步破壞，引起肺部感染，肺部感染也可繼發於敗血症和心內膜炎。肺結核在海洛因吸毒的人群中有較高的發生率，嚴重者甚至可導致肺炎肺空洞和肺癌。
有些毒品可造成特異性呼吸系統損害，海洛因過量或中毒時可發生海洛因性肺水腫。此病起病較急 ，一般於海洛因過量後立即出現。如搶救不及時往往引起死亡。
肝臟的傷害
對應毒品：海洛因、古柯鹼、K粉、搖頭丸
吸毒導致的肝臟疾病常見的是急、慢性肝炎，嚴重的甚至出現肝硬化；肝腎功能的破壞經常導致吸毒者面部或下肢出現水腫，嚴重的會出現全身的中毒症狀。腎衰或肝硬化的預後也很差，吸毒者可能因此而死亡。
此外，因為吸毒者體質的不同，而導致的肝臟受到不同程度的損害，可能會造成急重症肝炎，主要症狀表現為發熱、皮疹、嗜酸性粒細胞增多，並伴有關節炎、腎炎等反應。質變性。
胃部的傷害
對應毒品：海洛因、古柯鹼、K粉、搖頭丸
以K粉為例，因其有擬交感神經作用，麻醉狀態唾液和胃液均分泌旺盛，麻醉過程中咽反射不消失，常吞進大量氣體和液體，造成急性胃擴張、胃黏膜出血，並出現噁心嘔吐、腹脹、胃出血等。
絕大多數毒品均有抑制食慾作用，不僅可引起身體消瘦，還可引起某些人體必需的維生素和礦物質缺乏，從而引起一系列營養不良症候群。
維生素B族缺乏會損傷中樞神經系統引起記憶力、注意力、學習能力顯著下降，甚至引起意識障礙。
維生素B族缺乏還會引起末梢神經炎和各種皮炎。鐵元素缺乏可引起缺鐵性貧血，故而吸毒者中缺鐵性貧血非常常見。
腎臟的傷害
對應毒品：海洛因、古柯鹼、K粉
這些毒品所致腎損害的特點是：大量蛋白尿及腎病症候群伴進行性腎小球硬化，早期可出現腎炎改變或單純尿常規異常。其中最典型的是海洛因。
據調查報告，在269名海洛因吸毒者人員，從吸毒到症狀出現為6個月-24年，平均6.2年。
一般吸毒1-2年以上即可出現症狀；2/3出現水腫伴腎病症候群，1/1有尿常規異常包括鏡下血尿及膿尿，但來診時80％已出現腎功能減退，其中10 ％為尿毒症終末期。
約10％有高血壓並多伴有腎功能不全。應用皮質激素及免疫抑制劑治療均無效，最終導致尿毒症終末期。