進行陰莖超聲檢查時應使用高頻線陣探頭，患者採用仰臥位，經陰莖腹側面通過縱切面和橫切面對其掃描。
①應當在陰莖鬆軟狀態下以及在海綿竇內注射血管活性藥物以後對其進行檢查。對於有性能力的患者注射10µg的前列腺素E1通常就足可以獲得適當的勃起反應，但也有一些作者常規使用20µg。對於年輕患者為了避免其勃起過長以及勃起疼痛，一般推薦應用5µg的初始劑量。
②其他的海綿體內注射的血管活性藥物比如罌粟鹼現在認為僅僅適用於那些被認為存在醫源性勃起延長的病例。
彩色都卜勒檢查和頻譜分析時應當採用低速血流設置，檢查時將PRF調節至最小以免圖像失真，彩色增益調節至剛好低於系統噪聲閾值。通過彩色都卜勒信號的指引在陰莖的基部採集陰莖海綿體動脈的頻譜進行分析，其角度校正光標應與血流的方向一致。可以通過調節Steering來獲取更好的角度校正。
正常的灰階超聲解剖。軸向掃描。A 鬆軟狀態下陰莖表現為中等回聲的均質結構。
B 海綿體注射後的前幾分鐘陰莖海綿體中心部分的海綿體竇開始擴張，表現為比外周部分的回聲低。
C 當陰莖完全勃起時其表現為陰莖海綿體內的細小網格樣結構。
陰莖的不同解剖學特徵可以很好的進行評估鬆軟、腫脹和勃起狀態。
在鬆軟狀態下，陰莖海綿體在超聲上表現為圓柱樣的中等均質回聲。尿道海綿體和陰莖頭要比陰莖海綿體的回聲高。尿道在塌陷狀態下表現為橫線樣。
陰莖海綿體的回聲表現為進行性減低，腫脹時從陰莖海綿體動脈周圍開始，原因是海綿體竇的擴張。
在陰莖處於最大硬度時，陰莖海綿體內可看到纖細的網格樣回聲，是由於有海綿體竇界面。
陰莖根部的海綿體竇間隙正常情況下要比其他陰莖幹部分明顯。海綿體竇內的血液經常表現為點狀回聲。
正常灰階超聲解剖。陰莖背側軸向掃描顯示成對的陰莖海綿體（CC）、尿道海綿體（CS）和陰莖隔膜（空白箭頭）。白膜（短箭頭）表現為圍繞在海綿體外的纖細的線樣回聲。在鄰近尿道海綿體處可看到Buck筋膜（彎曲箭頭），Buck筋膜的其他部分與白膜黏貼在一起。陰莖隔膜表現為後方衰減的回聲結構。
Colles』筋膜在正常人中很少能看到。白膜和Buck’s筋膜黏在一起表現為圍繞在陰莖海綿體周圍的線樣纖細回聲，勃起時會更纖細。只有當兩層間出現滲液積聚或使用超高頻探頭時可以區分這兩層不同的結構。
而血管結構可以能為分辨正常陰莖的一小部分Buck’s筋膜和下方的白膜提供一個合適的界面。
尤其是Buck’s筋膜在超聲上變得可見在接近擴張的旋靜脈，一個精細的線樣回聲表示Buck’s筋膜通常在陰莖背側可以看到，它區分深靜脈面和表淺靜脈以及在接近尿道海綿體。