慕容垂起兵了，其他慕容氏貴族也蠢蠢欲動。這次是慕容泓和慕容衝。
慕容泓是慕容暐的弟弟，前燕滅亡後，他被封為北地（陝西耀縣）長史。公元384年，三月慕容垂起兵後，他立即亡奔關東，收集了數千鮮卑人起兵。考慮到大多數慕容鮮卑貴族被強遷到關中，乃進屯華陰（陝西華陰東南），企圖號召關中鮮卑。困居長安的慕容暐立即密遣兄弟子侄和家人四處聯繫（苻堅沒有看住這些人真是大錯），被逼遷徙的鮮卑人紛紛來投，慕容泓勢力一時暴漲。他擊敗秦將強永後，自稱都督陝西諸軍事、大將軍、雍州牧、濟北王（是為西燕始年），推慕容垂尾丞相、都督陝東諸軍事、領大司馬、冀州牧、吳王。禍亂終於發展到了關中。
▲公元392年的西燕與後燕版圖，圖/網絡。
慕容衝也是慕容暐的弟弟，前燕時為中山王。其姐清河公主美貌，燕亡後為苻堅所納，慕容衝也很俊俏，姐弟倆都得到了苻堅的寵幸（苻堅這一點頗為後人詬病）。在秦諸官百般勸諫之下，苻堅將慕容衝送出長安任平陽（山西臨汾西南）太守。他同樣在公元384年三月起兵，聚眾2萬，進逼蒲坂（山西永濟蒲州鎮）。河東也是硝煙驟起。
▲影視劇中的慕容衝劇照，圖/網絡。
值此危難之際，苻堅意識到問題的嚴重性，對其謀臣權翼說：「吾不從卿言，鮮卑至是。關東之地，吾不復與之爭，將若泓何？」翼曰：「寇不可長。慕容垂正可據山東為亂，不暇近逼。今暐及宗族種類盡在京師，鮮卑之眾布於畿甸，實社稷之元憂，宜遣重將討之。」堅乃以廣平公苻熙為使持節、都督雍州雜戎諸軍事、鎮東大將軍、雍州刺史，鎮蒲坂。徵苻睿為都督中外諸軍事、衛大將軍、司隸校尉、錄尚書事，配兵五萬以左將軍竇衝為長史，龍驤姚萇為司馬，討泓於華澤。命竇衝討慕容衝。
慕容泓本無久佔關中之心，只不過來召集被逼遷關中的族人。聽說秦軍來剿，便計劃撤往關東。不料苻睿年輕氣盛，為求全功竟然截斷慕容泓退路求戰，姚萇勸他：「鮮卑有思歸之心，宜驅令出關，不可遏也。」這個建議也很難講是真心還是假意，反正對於姚萇來說關東大亂對於他來說不是壞事。苻睿不聽，與慕容泓戰於華澤（華陰境內），兵敗被殺。苻睿死後，姚萇派人向苻堅報信，苻堅大怒，立殺姚萇使者，姚萇遂叛，逃往渭（河）北的官牧場，糾集羌族豪酋反秦自立。苻堅此舉又增新敵，自然大謬。不過讓苻睿這種沒有經驗的年輕小子帶著姚萇這種老奸巨猾的人去平叛，恐怕本來就不是什麼好事。另一方面在四月，慕容衝被竇衝擊敗，只得帥騎兵八千與慕容泓匯合。
▲圖/網絡。
姚萇建立後秦（這廝實在無賴，建國連名字都懶得起新的），得到北地（陝西耀縣）、華陰（陝西華陰東南）、新平（陝西彬縣）、安定（甘肅涇川北）等地10餘萬羌胡的支持。聲勢漸起，他很精明的結好慕容泓，讓慕容氏去攻打長安。不過苻堅並不傻，知道羌族也是在關中經營多年的，而且姚萇在北地郡對長安威脅很大。苻堅立即率領2萬御林軍親徵，紮營趙氏塢（北地境內）。先以護軍將軍楊璧以騎兵三千斷姚萇歸路，然後以右將軍徐成、左將軍竇衝、鎮軍將軍毛當輪番進攻，屢敗姚萇，姚萇被困。苻堅又於同官水（陝西銅川一帶）築堰，截斷姚萇軍水源。姚萇軍於高地，難以挖井，饑渴異常。無奈之下，命其弟姚尹買統領兩萬精銳拼死一搏，企圖挖堰放水，結果大敗，死1萬3千餘，姚尹買被竇衝陣斬。兩軍交戰近一月，姚萇部渴死多人，士氣低落。不料天降大雨，後秦軍營中水漲三尺。營外卻只有細雨靡靡。苻堅正在吃飯，見此撤案而嘆：「天其無心，何故降澤賊營！」結果雙方士氣逆轉，姚萇乘勢反擊，一舉擊破苻堅，俘獲楊璧、毛盛、徐成、齊午等高級將領數十人。後秦諸將都主張乘勝追擊直搗鹹陽（陝西鹹陽東北），奪取長安。但是姚萇深知，此刻奪取長安就要擋住慕容泓回關中的路，並不是上策。他教導諸將說：「兵不血刃，坐定天下，此卞莊得二之義也。」於是客客氣氣停止追擊，禮送前秦被俘諸將回長安，然後調整部署，佔領了新平（陝西彬縣）。此人確有全局觀念。
慕容泓戰勝後，眾至十餘萬，遣使對苻堅說：「泓當率關中燕人，翼衛皇帝，還返鄴都，與秦以武牢為界，分王天下，永為鄰好，不復為秦之患也。」堅大怒，召慕容暐大罵，暐叩頭流血，哭著謝罪。苻堅想了很久說：「《書》雲，父子兄弟無相及也。卿之忠誠，實簡朕心，此自三豎之罪，非卿之過。」赦免了他。命暐以書招喻垂及泓、衝退兵歸降，以前既往不咎。但慕容暐私下派人對慕容泓說：「昔不能保守宗廟，致令傾喪若斯，吾罪人也，不足復顧吾之存亡。社稷不輕，勉建大業，以興復為務。」泓於是進向長安。
▲圖/網絡。
苻堅不殺慕容暐，大約還是想利用其身份作作文章，其實慕容暐倒也識趣，馬上跟風，說讓慕容垂作相國，慕容衝這個小白臉掌握軍權，給慕容泓一個繼承人的身份。而且有趣的是，說讓慕容泓等自己死後再繼承大位。這裡面有幾層意思，首先指出雖然自己犯了錯，但現在還是大燕國皇帝，慕容泓要等自己死後才能即位；其次，雖然眼下慕容垂被認為是慕容族的希望，但慕容暐顯然不喜歡他，所以只任命他為相國，軍權都不給他。其實慕容暐此時還心存幻想能逃出生天作皇帝，不然直接讓慕容泓或慕容垂即位不就完了，所以可見慕容族內部仍是矛盾重重。苻堅既然真的覺得關東不可守，還不如把慕容暐放出去讓他去「說降」慕容垂，然後讓慕容垂做蠟。
不過慕容泓確實沒有皇帝命，其人威望不足，且執法苛峻，部下多有不滿。公元384年6月，西燕內訌，慕容泓被殺，慕容衝被推出作首領，7月，西燕的烏合之眾推進到距長安200來裡處，苻堅不得不集中力量先對付這個肘腋之患了。卻白白給了姚萇以機會發展壯大。
▲圖/網絡。
秦軍和西燕軍會戰於鄭（陝西華縣）西。西燕軍歸家心切，戰鬥力激增，秦軍數敗，前將軍姜寧被陣斬，苻堅少子苻琳身中流矢而死。前秦的武將似乎都是衝鋒在前，結果總是戰死率奇高，由此而敗北也很多，可見前秦氐族的軍事鬥爭藝術比較落後。這時慕容暐也忍耐不住，準備利用兒子新婚為藉口殺行刺苻堅，卻因為下雨苻堅沒有去而失敗，長安城內密謀的鮮卑人進退失措結果敗露。苻堅驚怒之下終於對鮮卑人失去信心，下令屠殺全城的鮮卑人，西燕方面也開始殺人破壞，在關中開展了兩個民族之間的瘋狂仇殺。總的來講，由於西燕集團不準備留在關中，四處燒殺搶掠，所以關中人心大都傾向苻堅。但雙方激戰年餘，關中損失極大，前秦帝國的根據地逐漸被破壞殆盡。
淝水之戰結束，強大的前秦被一鼓而破，東晉舉國歡騰，隨即開始了大反攻，首先動手的是西線的桓衝。公元384年（東晉太元九年，秦建元二十年）正月，桓衝命上庸（郡治今湖北竹山西南）太守郭寶攻拔魏興（陝西安康西北）、上庸、新城（湖北房縣）三郡，竟陵（湖北鍾祥）太守趙統攻襄陽（湖北襄樊）。不過桓衝沒有等到勝利果實，他死了。四月，趙統在繼任荊州刺史桓石民的支援下，擊敗秦荊州刺史都貴，都貴退魯陽（河南魯山），襄陽重新歸晉。同時，晉廣威將軍、河南太守楊佺期進據成固（今屬陝西），擊敗秦梁州刺史潘猛，楊佺期乘勝而進，再敗秦將竇衝等。五月，秦洛州刺史張五虎以豐陽（陝西山陽）降晉。七月，桓石民命將軍劉春進軍魯陽，都貴不戰而走。
▲圖/網絡。
同年五月，晉梁州刺史楊亮也開始進攻巴蜀，率軍5萬，以巴西太守費統水陸軍3萬為前鋒進逼成都。秦益州刺史王廣遣巴西太守康回領兵拒之，七月，康回敗歸成都，梓潼太守壘襲以涪城（四川綿陽東北）降晉。十二月，秦梁州刺史潘猛棄漢中退奔長安，成都秦軍退路被截。次年公元385年二月，王廣以蜀人李丕為益州刺史，鎮成都，自領所部裹脅蜀人三萬奔竄隴西，四月晉蜀郡太守任權攻入成都，殺李丕。至此，梁、益二州復歸晉。西線東晉攻勢基本結束，只有楊佺期一軍偶然遊弋關、洛間，不久退回。
東線劉牢之乘淝水之勢進佔譙城（安徽縣）,但真正的較有部署的反攻直到公元384年8月才開始。晉廷以謝安為揚、江、司、荊等十五周都督，節制北伐事宜。謝玄為前鋒都督，統軍推進。謝玄受命後即與冠軍將軍桓石虔等經略河、洛、冀州。晉軍兵抵下邳（江蘇睢寧西北），秦徐州刺史趙遷棄彭城而走。謝玄隨即兵分兩路：劉牢之兵進兗州（州治今山東鄄城北），高素攻青州（州治今山東益都西北）。九月，劉牢之兵臨鄄城（山東鄄城北），秦兗州刺史張崇棄城投奔建國不久的後燕。青州一路則因漕運困難而進展緩慢，謝玄接受建議堰遏呂梁水，沿河立埭，解決水源。晉軍隨即抵達琅邪（山東膠南縣琅邪臺西北），秦兗州刺史苻朗據州投降。奪取兗、青後，謝玄調整部署，又進伐冀州，遣龍驤將軍劉牢之、濟北太守丁匡據碻磝，濟陽太守郭滿據滑臺，奮武將軍顏雄渡河立營。苻丕遣將桑據屯黎陽。又遣晉陵太守滕恬之渡河守黎陽，三魏皆降。公元385年，劉牢之兵達坊頭（河南濬縣西南），一度進入鄴城（河北臨漳西南）。但終以驕傲輕敵，為慕容垂所敗，晉軍東線攻勢遂終。
晉軍北伐之所以緩慢，沒有更大戰果，主要是隨著外來威脅解除，內部矛盾上升。淝水大捷，謝安聲望激增，史載晉室為其加黃鉞，其本官如故，置從事中郎二人。安上疏讓太保及爵，不許。是時桓衝既卒，荊、江二州並缺，物論以玄勳望，宜以授之。安以父子皆著大勳，恐為朝廷所疑，又懼桓氏失職，桓石虔復有沔陽之功，慮其驍猛，在形勝之地，終或難制，乃以桓石民為荊州，改桓伊於中流，石虔為豫州。既以三桓據三州，彼此無恐，各得所任。其北伐原本是出於矛盾漩渦之外，並無太多舉措。很快隨著劉牢之受挫，北伐所得相繼又失陷，益州也為譙縱所佔。
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