中國有句老話叫「擒賊先擒王」，意思是說作戰時如果抓住了對方的主帥，或者攻佔了最關鍵的地方，就能瓦解對方的軍心，取勝也會輕鬆很多。按照這樣的邏輯推算，當年那兩顆分別被命名為「小男孩」與「胖子」的原子彈，似乎應該被丟在東京？
「小男孩」於1945年8月6日在廣島上空9千米多的高度被投下，它的原爆使大約7萬人迅速死去，差不多同等數量的人因此而受傷。困獸猶鬥，日本仍然寄希望於將「小男孩」的到來解釋成隕石墜落，3天後，「胖子」又在長崎上空9千米的高度被投下，城市變成廢墟。
眼看著傷亡不斷加重，日本再也坐不住了，8月15日，廣播裡傳來了天皇宣告接受《波茨坦公告》、宣布無條件投降的聲音，飽受戰爭侵襲傷害的人們歡呼雀躍，慶祝勝利，但日本不少想法激進的士兵卻痛哭流涕，難以接受，甚至揚言要切腹。
可見原子彈的威力夠大，看著盟友倒下還想繼續垂死掙扎的日本，也只能選擇投降。而美國的兩顆原子彈丟在廣島和長崎兩地也不是隨機選擇的，先說廣島，既然美國是要用轟炸造成威懾，必然得選人口密集的城市，不可能把原子彈丟在荒野，製造響聲讓對方嚇到那麼簡單。
廣島當時常住人口大約35萬，最關鍵的是，這35萬人裡面有數萬的日軍，廣島還有日本「兵都」之稱，有兵就有軍工廠，廣島軍工廠數量繁多，炸一炸也能給日本帶來重大損失。至於長崎，原本是作為備選城市，因為雲層密布看不清原來的地點小倉，轟炸機就轉頭去了長崎。
原子彈沒有丟在東京，一是因為沒有繼續轟炸東京的必要，因為東京在此之前已經遭遇過連番的轟炸。B-29超級空中堡壘式轟炸機問世後，美國可以對日本進行戰略意義上造成實際損失的轟炸了，而當時美國的轟炸機從成都起飛，先只是炸了一些次要的目標，後來才轉向對日本本州島的大規模轟炸。
光1945年3月9日晚上對東京實行的地毯式轟炸就已經讓東京死亡了近9萬人，重傷者更多，上百萬人流離失所。火攻東京讓日本花了將近1個月時間才將屍首清理乾淨，連續的大火讓東京城變成了廢墟，22個工業目標被摧毀。
因此，當時的東京已經不需要再添上一把火來讓日本頭疼了。更何況東京遇襲比原子彈投放的時間早多了，日本也沒有因此早投降，甚至寄希望於拖延時間，投放原子彈是為了儘早結束戰爭、減少己方的傷亡，而不是為了將日本的實力一掃而空，而且美國不想炸死天皇。
天皇對日本的精神象徵意義不用多說，如果炸死了天皇可能會迎來新一輪的反撲，傷敵一千自損八百；只要震懾了天皇讓他儘早宣布投降，原子彈的目的就達到了。另外，原子彈在當時也屬於「新產品」，美軍需要用其他之前沒大規模遇襲的城市來試驗其威力，這也是東京沒有跟原子彈相遇的原因。