「土木堡之變」之中，明朝京營主力幾乎全軍覆沒、皇帝朱祁鎮陷入敵手，這可以說是明朝立國以來遭遇的最為嚴重危機，應對不好便有亡國之危。同時，瓦剌太師也先的野心極大，在被俘太監喜寧的唆使下，的確產生了以送還明英宗為名，趁機南下、奪取京師的想法。而也先之所以最終失敗，其實有內部原因，也有外部原因。
原因之一：明朝應對及時，局勢迅速穩固
當「土木堡之變」的消息傳入京城後，迅速引發了明廷的震動，為穩固局勢，皇天后於正統十四年（1449年）八月十八日任命明英宗之弟郕王朱祁鈺監國，召集朝臣商議戰守大計，徐有貞等人甚至主張還都南京。
經過兵部侍郎于謙等人的據理力爭，經過皇太后的首肯，明廷最終決定固守北京。于謙等人結合當時現狀，迅速制定了相應的應對措施：
1、擁立新君，穩定局勢。八月二十九日，在文武百官的奏請和皇太后的首肯之下，朱祁鈺被擁立為帝，史稱明代宗，遙尊被俘的明英宗朱祁鎮為太上皇，並將導致「土木堡之變」的罪魁禍首王振被抄家滅族。如此一來，深陷敵營的明英宗，很大程度上喪失了利用價值，一定程度上瓦解了瓦剌利用明英宗瓦解北部邊防的可能性，同時也使得朝廷內部得以迅速穩定。
2、調兵遣將，固守邊防。由於當時明朝北部守將多有私通外敵的情況，例如大同指揮李讓，因此明廷改以名將擔任京城、大同、宣府、居庸關、紫荊關等重要地區守將，並對玩忽職守、貪生怕死者予以了嚴懲。而且，這次調整首重能力，例如原大同副將石亨因在「土木堡之變」中戰敗，本已被貶官下獄，但于謙還是將其重新起用，並被任命為京師總兵官。
3、徵調援軍，籌備物資。由於「土木堡之變」導致京營遭遇重大損失，于謙緊急抽調南北兩京、河南的備操軍，山東和南京沿海的備倭軍，江北和北京所屬各府的運糧軍，立即奔赴順天府，令其分守九城，使得京城兵力迅速由數萬人增加到22萬多人。並派監察御史白圭等15名重要官員，前往京畿、山東、山西、河南等地招募兵員，進行應急訓練，以備補充。同時，命令工部加緊趕製武器裝備，並將南京庫存兵器共126萬件調入北京，還派出人員到土木堡收集明軍潰敗時丟棄的頭盔9000餘項、甲5000餘件、火槍1.1萬餘杆、火銃2萬多隻、火箭44萬枚、火炮800餘門。
4、整軍備戰，鞏固京防。京城百姓也被充分發動了起來，木土、瓦匠、石匠等被統一編成工程隊進行訓練，先後加固北京周邊45裡的城牆，並增修了京城的崇文、正陽、宣武、東直、朝陽、西直、阜成、德勝、安定9門，不斷加強城防。同時，傳檄京城周圍的州縣和山西、河北等地民眾，拿起武器，視情況打擊瓦剌軍隊，切斷其後路。
經過一個多月的充分準備，明廷迅速從「土木堡之變」的陰影中走了出來，不僅朝野局勢穩定，而且軍隊士氣大振，這為之後北京保衛戰的勝利打下了基礎。
原因之二：瓦剌統治區域廣闊，但也先實力極為有限
瓦剌主要生活於蒙古草原西部，在蒙元時期瓦剌貴族與成吉思汗的黃金家族長期保持著通婚關係，男尚公主，女適皇胃，可謂「世聯戚碗」，因而權勢極為顯赫。元朝敗退草原之後，由於北元殘餘勢力在捕魚兒海一戰徹底被摧毀，瓦剌這才逐漸脫離黃金家族的控制。
蒙古分裂之後，瓦剌和韃靼常年爭戰不休，直到朱棣五次北伐，由於其中四次主要針對韃靼，導致韃靼元氣大傷，這給了瓦剌崛起的機會。朱棣去世之後，由於仁宣年間明朝戰略收縮，瓦剌趁機奉奉孛兒只斤·脫脫不花為汗，開始向韃靼不斷用兵，最終一統蒙古草原。
不過，瓦剌雖然徵服了蒙古草原，但卻沒有號令蒙古各部的聲望和血統，更多是通過武力徵服。為了解決血統問題，瓦剌又攻打並擊敗了黃金家族後裔察合臺汗國，強娶了衛思汗的妹妹哈尼木公主。
因此，「土木堡之變」前後的瓦剌雖然極度強大，但內部卻存在著各種各樣的矛盾。
1、瓦剌與蒙古各部的矛盾。瓦剌雖然通過武力徵服和強行聯姻的方式，一定程度解決了統治蒙古各部的問題，但由於瓦剌崛起時間太短，再加上蒙古草原部落聯盟式的統治方式，蒙古各部真心臣服瓦剌者，其實極為有限。這便導致瓦剌雖然統治範圍極廣，但其實真正能夠調用的力量極為有限。事實上，就在也先被殺之後，瓦剌便喪失了對蒙古各部的統治。
2、瓦剌內部同樣存在矛盾。在瓦剌內部，脫脫不花雖然被奉為了可汗，但大權卻全部操持於太師也先手中，這使得兩人之間的矛盾極深。而在北京保衛戰之後，隨著也先的戰敗，脫脫不花更是單獨向明朝遣使進貢，與明廷議和，而此後雙方矛盾不斷加深，更是發生了一場火併，也先之後則是殺死脫脫不花自立為汗，然而也先也在隨後的政變中被殺。
如上所述，此時的瓦剌雖然極為強大，但其實也先本人所能調用的力量其實極為有限，北京保衛戰時他所率領的主力也不過三萬人而已，面對明朝迅速集結的二十餘萬大軍，也先就算想有所作為，也是極為困難。
原因之三：明朝統治較為穩定，也先難有可趁之機
明朝雖然在「土木堡之變」中損失慘重，但此時距離明朝立國才短短八十餘年，距離朱棣五徵蒙古更是僅僅過去了二十五年，此時的明朝不僅統治穩定，且人才儲備、朝政運轉、軍隊戰力等方面仍然極有保證，具有極強的糾錯能力。
此時的明朝，歷經洪武之治、永樂盛世和仁宣之治，國力極為強大，雖然明英宗朱祁鎮繼位時年僅八歲，但彼時由於內有太皇太后張氏管教，外有楊士奇、楊榮、楊溥「三楊」輔佐，初期仍然延續了「仁宣之治」的繁榮，直到太皇太后張氏和「三楊」先後去世或隱退，宦官王振才開始崛起。
然而，從宦官王振的崛起，到「土木堡之變」的爆發，不過短短幾年時間，還不足以動搖大明的統治根基。尤其是在朝政仍然較為清明的情況下，普通百姓的生活此時仍有保證，大明的統治仍然相對穩固。
綜上所述，在瓦剌和大明實力本就不對等的情況下，大明統治又較為穩固，應對又較為及時，瓦剌想要憑藉一己之力徹底瓦解、擊潰大明，可以說根本沒有一絲機會。事實上，北京保衛戰後不久，瓦剌便由於自身內亂而迅速衰敗，再也沒能對明朝形成威脅。
不過，「土木堡之變」雖然沒有對大明造成毀滅性打擊，但由於開國功勳集團和靖難功勳集團損失殆盡，導致文官崛起速度加快，而皇帝只能通過內廷宦官來對抗文官集團，一定程度影響了明朝中後期的朝政格局。