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在線網站繪製基因結構圖!
運用它能夠繪製清晰的基因結構，清晰明了地展示外顯子、內含子及UTR的位置。還可以聯合其他數據繪製進化樹-基因結構圖，展現基因結構與系統進化關係。打開這個工具，它的界面如下：UTR，第四列是注釋信息，第四列可以不要GenBank Accession Number or GI：可以從GenBank獲得，要注意的是你輸入的Accession Number or GI必須包含有mRNA序列GTF/GFF3：基因注釋文件（包含基因的結構信息，具體信息可以自行百度，有詳細解釋），可以在資料庫中下載基因組的GFF文件，篩選出你的基因注釋信息
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ENCODE相關30篇論文摘要 聚焦人基因組功能研究(一)
人細胞轉錄全景圖RNA是基因組編碼的遺傳信息的直接輸出。細胞的大部分調節功能都集中在RNA的合成、加工和運輸、修飾和翻譯之中。研究人員證實，75%的人基因組能夠發生轉錄，並且觀察到幾乎所有當前已標註的RNA和上千個之前未標註的RNA的表達範圍與水平、定位、加工命運、調節區和修飾。總之，這些觀察結果表明人們需要重新定義基因的概念。
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新的基因組資料庫為調控DNA尋找靶基因
史丹福大學（Stanford University，位於加利福尼亞州帕羅阿爾託）的遺傳學家Jonathan Pritchard指出，多虧了這四項研究工作，「我們目前正在熱火朝天地深入了解基因組的功能。」然而，並不是每一個人都相信：這些海量數據的收集工作能夠為生物學家提供很多實際幫助。
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前瞻基因產業全球周報第84期:華大基因回應「試劑盒缺陷」,求臻...
據了解，該方案與求臻醫學自主研發的涵蓋泛癌種、肺癌等九大系統腫瘤的20餘項腫瘤檢測產品一起，構建起了精準腫瘤基因檢測服務。中國六大廣布蜱種首獲基因身份證，為研究蜱媒傳染病提供依據軍事科學院軍事醫學研究院曹務春團隊與中國科學院北京生命科學研究院趙方慶團隊合作，首次闡明了我國6大蜱種的基因組多樣性、
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轉錄調控必知資料庫:ENCODE
按照上圖的展示，目前的ENCODE通過多種測序數據來反應基因組變化的過程，分別是通過類似很多轉錄調控資料庫也是在ENCODE資料庫獲得目標原始數據後，進行分析後構建的自己資料庫。ENCODE默認的是UCSC的基因瀏覽器，可以點擊 Visualize來進行查看。
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百邁客雲平臺——助您輕鬆搞定GO、 KEGG富集圖繪製
GO、KEGG分類富集圖繪製工具對給定的基因集結合注釋信息繪製GO分類富集圖、KEGG分類富集及通路富集圖。
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破譯油桐基因組,揭示油桐進化和油脂合成機制
滿載桐油以及桐油相關產品的大船溝通了南北兩岸的貿易，這種塗有桐油的船舶是十六世紀大航海時代西方航海家最為熱衷的探險工具，中國特有的優質桐油也因此遠銷世界各地。船帆上標註有油桐基因表達譜，藍紫色至綠色代表基因表達水平由高到低的差異性。圖片左下方的牆面和傘面上的圓形圈圖，代表著油桐基因組結構景觀圖。封面設計體現了科學與藝術的完美融合。
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農科院蜜蜂所解析中華蜜蜂基因組和轉錄組
近日，中國農業科學院蜜蜂研究所解析了中國本土保護蜂種—中華蜜蜂的基因組和轉錄組數據，揭示了中華蜜蜂的抗蟎機制。 據悉，中華蜜蜂主要分布在亞洲，是目前我國飼養最多，具有顯著經濟價值的兩個蜂種之一，2006年被列為國家級畜禽遺傳資源保護品種。
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Briefings in Bioinformatics:微生物基因組學和功能基因組學相關軟體和資料庫的研究進展
in microbial genomics and functional genomicshttps://doi.org/10.1093/bib/bby013作者：Feng Gao作者簡介：https://scholar.google.co.jp/citations?
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【合作文章】花生蛋白基因組研究
儘管轉錄組學可以檢測基因的表達，但是，蛋白質作為生命活動的最直接參與者，其表達量與RNA表達量相關性並不高。此外，雖然目前NGS技術廣泛應用，但是基因組的注釋上仍然有漏洞。蛋白基因組（Proteogenomics）技術，旨在利用蛋白質譜數據，探索常規基因表達量外，在蛋白層次上挖掘和驗證新蛋白編碼區域、新轉錄本、胺基酸突變事件。
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人類基因組時代的泛基因組學
當時這樣定義有其合理之處，因為，在原核生物中，絕大部分的 DNA 序列其實就是有功能的基因序列，而且不同菌株間基因的差異還比較大。在某些已經發現的細菌基因組中，菌株間基因的差異甚至可以達到20%-40%，而這些差異通常就和菌株它們在人群中的致病性、耐藥性等密切相關。
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我國完成鯉魚全基因組序列圖譜繪製
2009年底，中國水產科學研究院水產生物應用基因組研究中心、黑龍江水產研究所攜手中科院北京基因組研究所啟動了「鯉魚基因組計劃」，目前完成了鯉魚基因組框架圖譜、鯉魚基因組物理圖譜和高密度連鎖圖譜等結果。
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科學網—再探獼猴桃基因奧秘
獼猴桃起源於中國，大約100年前引入紐西蘭開始馴化和栽培。目前已在中國、紐西蘭、義大利、智利等10多個國家大規模種植，成為風靡全球的營養最為豐富的水果之一。在科學界，獼猴桃基因組學和功能基因組學備受關注。
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中國啟動世界首個驢基因組測序項目:通過基因圖譜測序繁育優質驢
數十名基因學、畜牧學專家10日在北京啟動了世界首個驢基因組測序研究項目，通過基因圖譜測序繁育優質驢。 「驢基因測序項目的啟動意味著中國將在全球率先掌握驢基因資源，這是科學界繼牛、雞、豬、馬基因組測序之後，對畜禽生命科學又一裡程碑式的貢獻。」知名基因研究專家、中國科學院院士楊煥明這樣評價此次驢基因組測序工程。
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農科院(深圳)基因組所構建高雜合二倍體馬鈴薯...
9月28日，國際權威學術期刊《自然·遺傳學（Nature Genetics）》在線發表了由中國農科院（深圳）基因組所（以下簡稱「基因組所」）關於「優薯計劃」的最新研究成果。在此基礎上，揭示了雜合馬鈴薯基因組內部等位基因的序列差異和表達調控差異，為研究二倍體馬鈴薯自交衰退分子機制和培育二倍體自交系提供了數據基礎，也為其它雜合基因組的組裝和分析提供了借鑑。雜合馬鈴薯RH據介紹，馬鈴薯作為世界第三大主糧作物，推動馬鈴薯產業發展對保障國家糧食安全有著極其重要的意義。
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我國科學家完成鯉魚全基因組序列圖譜繪製
在國家「863」計劃、「973」計劃和國家自然科學基金、公益性行業科研專項等資助下，中國水產科學研究院聯合中國科學院、哈佛大學、奧本大學等單位組建的國際合作團隊完成了鯉魚全基因組序列圖譜繪製，並揭示其獨特的全基因組複製事件，這是國際上首個完成全面解析的異源四倍體硬骨魚類基因組圖譜
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植物科學常用資料庫和生物信息學工具
http://magen.whu.edu.cn/ 錦葵科比較基因組資料庫 http://structuralbiology.cau.edu.cn/gossypium/ 二倍體和多倍體棉花基因網絡與功能模塊比較分析平臺 http
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植物科學常用資料庫和生物信息學工具 2020正式版
/GraP/棉花功能基因組學數據分析平臺 http://magen.whu.edu.cn/ 錦葵科比較基因組資料庫 http://structuralbiology.cau.edu.cn/gossypium/ 二倍體和多倍體棉花基因網絡與功能模塊比較分析平臺
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Genome Research | DNA甲基化和組蛋白乙醯化對轉錄因子的基因組佔有的不同貢獻
儘管基因組中60％至80％的CpG被甲基化，但在轉錄因子結合的區域（如CpG島，基因啟動子和遠端調控元件）中，DNA甲基化卻不存在或減少。 該觀察結果提出了DNA甲基化可能限制轉錄因子佔有的提議。為了支持該模型，體外實驗表明5mC可以影響大多數在其結合基序中包含CpG二核苷酸的DNA結合蛋白的親和力。
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基於RNA-seq的銀線草轉錄組分析
最新研究利用二代高通量測序技術解析銀線草葉綠體基因組，為該植物的系統進化及藥材分子鑑定提供基礎數據[11]。轉錄組測序技術即RNA-seq，是功能基因組研究的一個重要組成部分，能夠在基因組序列未知的前提下，研究特定條件下細胞中所有基因的轉錄本豐度、可變剪接等全局信息，結果準確、分析可靠且重複性較高，有助於從整體水平上揭示生物體生長發育、次生代謝及生理適應的轉錄調控規律[12]。