2019新型冠狀病毒資源庫發布

2020-12-11 新京報

新京報快訊 據中國科學院微信公眾號消息，2020年1月22日，國家基因組科學數據中心正式發布2019新型冠狀病毒資源庫。該庫整合了世界衛生組織（WHO）、中國疾病預防控制中心（CDC）、美國國家生物技術信息中心（NCBI）、全球流感序列資料庫（GISAID）等機構公開發布的冠狀病毒基因組序列數據、元信息、學術文獻、新聞動態、科普文章。同時，對不同冠狀病毒株的基因組序列做了變異分析與展示。

2019新型冠狀病毒基因組序列發布動態

2019新型冠狀病毒資源庫收錄了來源於NCBI的GenBank資料庫和GISAID資料庫發布的2019新型冠狀病毒（2019-nCoV）病毒株的株名、採樣日期、採樣地點、樣本提供單位、數據遞交單位等元信息。通過該資源庫還可訪問到國家基因組科學數據中心基因組資料庫GWH從公共資料庫收錄的冠狀病毒科基因組和蛋白序列，用戶可基於Accession號、種名、屬名、採樣日期、採樣地點、宿主、分離源、發布日期等元信息篩選感興趣的冠狀病毒株，個性化選取序列進行下載以開展相關的科學研究。

2019新型冠狀病毒資源庫將持續更新元信息與基因組序列數據，實時監控NCBI的PubMed資料庫中發表的2019新型冠狀病毒和其他冠狀病毒的學術文獻、中新網與新華網發布的新聞，同步更新世界衛生組織與中國疾病預防控制中心發布的科普介紹，為用戶開展學術研究、掌握科研進展、了解新聞動態與科學知識提供資源與窗口。

2019新型冠狀病毒資源庫基於不同參考基因組序列開展2019-nCoV病毒株基因組變異分析，並對結果進行了統計與可視化展示。通過對全基因組序列相似性比較和變異位點分析，獲取2019-nCoV病毒株之間、2019-nCoV病毒株與SARS冠狀病毒以及與類SARS冠狀病毒蝙蝠株之間的變異程度、變異區域、變異鹼基的詳細信息。經數據分析，2019-nCoV與2003年爆發的SARS病毒基因組序列相似度為80%，與2017年2月從國內的蝙蝠中採集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因組序列相似性最高，相似度為88%。對2019-nCoV病毒株的基因組變異分析可為追溯病毒來源、追蹤病毒株變異路徑、防控新型冠狀病毒引發的疫情、治療病毒性肺炎提供重要的數據基礎與決策支持。

編輯 楊利

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