人與自然和諧相處的內涵和本質和諧是指系統中各要素、各部分之間配合得勻稱和得當。一個生態系統，尤論是在全球、地區，還是局部區域，都是複雜的牛物群落與所處的環境(包括水、大氣、土、巖石等)相互依存、相互制約、相對穩定又有自組織功能的一個系統，水是其中最活躍、最重要的控制性要素。在潤澤萬物的同時，水又以其自身的豐枯規律、動力特性，影響著整個自然界的演進和變化。生態系統所有生命要素因水而生，依水而存，對水的量變和質變十分敏感。興水利、除水害，人類社會在與水的相依相伴中，在與水的抗爭中，得到了繁衍和發展。在治水中處理好人與自然的關係已經成為人類持續生存和發展的重要任務。
所謂治水中堅持人與自然和諧相處，就是指以人為本，堅持人與自然關係的平衡與協調。在整個流域生態系統的框架下，處理好人類活動與水利水害的關係，合理地趨利避害，正確對待洪水、乾旱等自然災害，降低水汙染等人為災害，在將水對人類造成危害的程度降低到可以承受的同時，儘可能降低人類活動對水體循環的幹擾，減少人對水的侵害；處理好人類取用水與自然界其他用水的關係，將水資源的開發利用控制在能夠保持水體基本功能、水資源可以持續利用的狀態，使水在為人類造福的同時，能夠為整個自然界造福。
在治水中堅持人與自然和諧相處的觀念，反映出價值取向的變化。由「以人為中心」和人控制自然、統治自然的價值理念，轉變為以人為本、全面、協調、可持續發展的理念，強調人與自然和諧發展，共同進步。在治水中堅持人與自然的和諧相處，體現了思維方式的變化。由孤立的、單目標的思維模式，轉變為系統的、全面的、辯證的思維模式，由以往的經濟增長為唯一目標，轉變為經濟增長與生態系統保護相協調，統籌考慮各種利弊得失，在改造自然滿足人類需要的同時，約束人類自身的行為，兼顧自然界的和諧與穩定。人與自然和諧的理念涉及治水的方方面面，從思路、對策、措施，到規劃、設計、管理，都需要不斷探索，不斷實踐，不斷創新。
二、人與自然和諧相處是經濟社會發展到一定程度、一定階段的必由之路，是人類總結經驗教訓後的必然選擇
在工業革命之前的漫長歷史中，生產力水平相對較低，人類活動對自然界的影響較小，人與自然保持著相對和諧的狀態。在哲學上，強調「天道」和「人道 」、「自然」和「人為」的相通、相類和統一的觀點。莊子認為，「天地與我並生，而萬物與我為一」，人與天本來合一；孔子提倡「天命論」，把「天命」奉為萬物的主宰，要人們「尊天命」「畏天命」；老子主張 「自然無為」，認為人在自然和社會面前是無能為力的。這種樸素的「天人合一」的觀點，造成了中國佔代一種人與自然親近和諧的關係。在對待洪水方面，「擇丘陵而處之」「順水所向，遷城邑以避之」進行避洪，「疏九河」進行分洪，在大河兩旁留出足夠空間使水「有所休息，左右遊波，寬緩而不迫」進行行蓄洪，這些都足這種思想的反映。在水土資源開發上，先秦時期，強調「斧斤以時入山林，林木不可勝用也」，「不樹者無槨」，對於保護植被、植樹育林等起到很好的作用。
隨著時間的推移，人口的急劇增加，人類經驗和知識的積累以及科學技術的發展，尤其是工業革命以後，人類改造自然、影響自然的能力越來越強，「人定勝天」「人是自然界的主宰」的思想日益增強，把自然界逐步看作是取之不盡、用之不竭的寶藏，肆無忌憚地掠奪式開發利用，同時把自然界看成是一個無底的垃圾箱，毫無顧忌地向其中排放廢水、廢渣、廢氣。近幾十年來，我國「改天換地」行動空前，為了負載過多的人口，爭取更多的空間，生產足夠的糧食，人們侵佔河灘，圍湖造田，毀林(草)開荒；為了滿足快速增長的用水需求，人們建起一個又—個蓄引提工程，可以讓黃河斷流，讓海河乾涸，把地下含水層疏幹，利用每一滴水；為了降低生產成本，汙水、廢水不經處理，隨意排人江河湖泊。
一百多年前，恩格斯指出，人類可以通過改變自然來使自然界為自己的目的服務，來支配自然界，但我們每走一步都要記住，人類統治自然界決不是站在自然界之外的。
在可持續發展理念日益深人人心的今天，面對我國水資源領域存在的種種問題，由「改造自然徵服自然」轉變為「人與自然和諧共處」成為治水實踐的必然選擇。當然，這種選擇不是遙遠過去的簡單重複和回歸，而是全面的發展和升華，是基於對治水規律更深的理解和把握，是基於對可持續發展的追求和渴望。
三、堅持人與自然和諧相處，必須在治水中把堅持尊重自然規律和發揮人的主觀能動性緊密結合起來，走可持續發展水利的路子
日月運轉不止，江河奔流不息，大自然有其自身運行的規律；人類取水、用水、排水，水進入了人類社會，治水活動又需要遵循社會規律。只有在治水實踐中不斷發現規律、認識規律，並遵循規律、利用規律，才能取得實實在在的成效。
1．在整個流域生態系統保護和恢復的框架下，統籌考慮解決我國水資源問題的對策
流域是水資源的載體，任何河流、湖泊等水體都與其所在的流域休戚相關。健康的河流、湖泊必須有健康的流域生態系統作為基礎和支撐。治水實踐不能就水論水，要從整個流域生態系統保護和恢復的框架下，考慮水資源問題的解決。
流域生態系統的保護和恢復，既包括湖泊、河流、溼地等水生態系統，也包括森林、草地、農田等陸地生態系統的保護和恢復。主要是指對流域內的水、土地、溼地、植被等自然資源進行合理開發利用，限制或消除引起生態系統退化的各種幹擾，實現水資源的永續利用和生態系統的良性循環。
流域內植被、溼地等保護和修復，對於緩解洪澇、乾旱災害，減輕土壤流失和水汙染問題將發揮一定作用。從水文學的角度看，森林植被及其下面的土壤，就像海綿一樣，當降雨發生時，可以吸納一定數量的雨水(洪水)，然後逐漸釋放出來，流人河流或滲入地下含水層。如果森林植被遭到破壞，土壤涵養水源的能力減弱，雨水匯人河流的速度加快，對於我國降雨在時間上分布極不均勻的現實而言，這無疑加重了汛期洪水和非汛期乾旱缺水的程度。另外，植被的退化，也將使土壤受到雨水侵蝕的程度加重，增加了江河湖庫的淤積，加重了洪災，也對水資源開發利用造成不利影響。溼地具有類似的作用，在雨季涵養洪水，在旱季可以逐步利用。有研究表明，流域每增加1％的溼地面積，河流的洪峰就會減少近4%。同時，植被、沼澤和其他形式的溼地，可以自然地過濾水流中的