農藥標靶肌球蛋白3D結構首次繪製成功—新聞—科學網

2020-12-15 科學網

 

 

鐮刀菌肌球蛋白結構     南京農大供圖

安全性及抗藥性等問題是新農藥開發和應用過程中需要重點解決的問題。近日,南京農業大學殺菌劑生物學團隊揭示了殺菌劑作用靶標——肌球蛋白的三維結構。未來,在該成果基礎上開展新型殺菌劑的設計和生產,有望實現「一把鑰匙開一把鎖」的精準靶向殺菌。國際微生物學期刊美國《公共科學圖書館—病理學》(PLOS Pathogens)在線發表了這一成果。

在近140年的現代殺菌劑發展史上,人類先後研發了400多種殺菌劑用於植物病害的化學防控。這些殺菌劑有的對其他生物產生毒副作用,有的作用位點單一使得有害病原物容易產生抗藥性。

受制於研究手段的不足,目前探明的殺菌劑作用的分子靶標或受體蛋白只有20多種,其中具有重要研發利用價值的殺菌劑分子靶標更是屈指可數。此前,科學家一直沒有在結構層面上闡明任何一個靶標蛋白與藥劑是如何相互作用的,以致新型殺菌劑創製的盲目性大,周期越來越長,成本越來越高,而且難以解決「殺敵一千,自損八百」的問題。

如何解決這個問題,研製出能精確識別「敵友」的智能殺菌手段?論文通訊作者、團隊負責人周明國認為,科研工作「要模擬到生物體內的真實情況」。該團隊經過近20年的不斷探索,發現了一種重要的新靶標——肌球蛋白-5。這種靶標具有「馬達」般的超強活力,在細胞營養運輸中具有提供能量的關鍵作用,是病菌生命活動的馬達蛋白。

論文共同通訊作者、南京農業大學教授張峰介紹,利用結構生物學方法,他們首次獲得小麥赤黴病菌肌球蛋白解析度為2.65 Å的晶體結構,揭示了植物病原絲狀真菌肌球蛋白與其抑制劑的互作特徵,同時揭示了氰烯菌酯抑制肌球蛋白ATP酶活性的分子機制。

基於三維結構,研究還發現了新的與氰烯菌酯結合的胺基酸位點,並證明其中重要的胺基酸位點M375在不同真菌中的遺傳分化決定了肌球蛋白對氰烯菌酯的敏感性。研究提出了針對肌球蛋白K375設計對稻瘟病菌等具有高活性的新型廣譜肌球蛋白抑制劑的可能性。

周明國告訴《中國科學報》,這就相當於給靶標肌球蛋白繪製了一幅3D效果的立體解剖圖,揭示了肌球蛋白的功能位點以及可以與化合物互作的關鍵胺基酸,這將有助於避免農藥創製的盲目性,大幅度提高新型殺菌劑的抗菌活性和安全性。

周明國解釋道,每一種生物的肌球蛋白就像是每個房間的鎖芯,只要探明了需要打開房間的鎖芯結構,就可以有針對性地配上專門的「鑰匙」,這樣既能滿足「解鎖」的需求,又能保證其他門鎖的安全。不僅如此,由於精準掌握了病原菌的這種蛋白與藥劑結合的關鍵胺基酸,就能發現他們的變化規律,提前「預知」產生抗藥性的機制和速度,從而採取預防手段,確保精確武器的長期有效性。現實生產中,一種新型農藥的研發需要合成10多萬個化合物,花費10年的時間,而抗藥性的產生往往三五年就夠了。

該研究成果揭示了殺菌劑作用靶標蛋白與小分子化合物親和互作的精細結構特徵,為快速發展顛覆性靶向殺菌劑,有效解決新農藥創製跟不上抗藥性發展速度的問題提供了新方法。同時,對於推動農業有害生物的農藥受體結構生物學研究和靶向農藥發展具有引領性作用。

相關論文信息:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1008323

 

版權聲明:凡本網註明「來源:中國科學報、科學網、科學新聞雜誌」的所有作品,網站轉載,請在正文上方註明來源和作者,且不得對內容作實質性改動;微信公眾號、頭條號等新媒體平臺,轉載請聯繫授權。郵箱:shouquan@stimes.cn。

相關焦點

  • [論文薦讀]肌紅蛋白血紅素輔基氧化修飾對肌球蛋白結構性質的影響
    以上結果表明,血紅素輔基主要通過影響肌球蛋白頭部S1區活性巰基-SH1影響肌球蛋白結構。不同氧化程度的肌球蛋白在208 nm和222 nm附近均出現2 個負吸收峰,表明二級結構主要為螺旋結構。表明肌球蛋白經過氧化後,α-螺旋逐漸解旋,且部分轉化為更為鬆散的β-摺疊和無規捲曲結構,包埋在分子內部的疏水性殘基暴露,導致表面疏水性上升,肌球蛋白分子間的疏水相互作用增強,發生聚合。由此可知,肌球蛋白氧化可改變胺基酸與肽鏈間的相互作用,特別是氧化過程中胺基酸側鏈間氫鍵的減少,會極大地影響蛋白質的二級結構。
  • 肌球蛋白II(10S)抑制形式的冷凍電鏡結構獲解析
    肌球蛋白II(10S)抑制形式的冷凍電鏡結構獲解析 作者:小柯機器人 發布時間:2020/12/4 13:26:55 美國麻薩諸塞大學醫學院Roger Craig研究小組解析出肌球蛋白II(10S)抑制形式的冷凍電鏡結構。
  • 上海有機所揭示肌球蛋白分子馬達Myosin VI結合Tom1
    Myosin VI是真核細胞內唯一一個沿著微絲反向運輸(從微絲正端向負端運輸)的非經典的肌球蛋白分子馬達,在細胞自噬和內吞途徑等眾多的細胞過程中扮演著重要的角色,其功能的缺失或異常與大量的人類疾病相關聯,例如,肥厚性心肌病、宮頸癌、前列腺癌症、耳聾、腦星形膠質細胞增多症等。
  • 動物所等在非典型肌球蛋白Myo5a調節機制方面取得進展
    肌球蛋白可分為三十多類型,其中II型肌球蛋白又被稱為典型肌球蛋白(conventional myosin),主要參與肌肉收縮,而其它類型的肌球蛋白又被稱為非典型肌球蛋白(unconventional myosin)
  • 《科學》:研究闡明葡萄糖轉運蛋白結構
    《科學》:研究闡明葡萄糖轉運蛋白結構
  • 美研究人員繪製出新冠病毒關鍵蛋白分子的3D結構
    新華社華盛頓2月19日電(記者周舟)美國科研團隊首次繪製出新型冠狀病毒一個關鍵蛋白分子的3D結構,這種蛋白是開發疫苗、治療性抗體和藥物的關鍵靶點。研究成果19日在線發表在美國《科學》雜誌上。美國德克薩斯大學奧斯汀分校和美國國家衛生研究院的研究人員根據中國研究人員提供的病毒基因組序列,利用冷凍電子顯微鏡重建了新冠病毒表面的刺突蛋白在原子尺度上的3D構造,解析度達到0.35納米。
  • 安進啟動新型心肌肌球蛋白激活劑omecamtiv mecarbil...
    2019年2月25日訊 /生物谷BIOON/ --美國生物技術巨頭安進(Amgen)與合作夥伴Cytokinetics及施維雅(Servier)近日聯合宣布啟動心衰藥物omecamtiv mecarbil第2個III期臨床研究METEORIC-HF,該藥是一種新型心肌肌球蛋白激活劑,目前正開發用於治療射血分數降低的心力衰竭(HFrEF)。
  • 安進新型心肌肌球蛋白激活劑omecamtiv mecarbil獲...
    2020年05月09日訊 /生物谷BIOON/ --安進(Amgen)與合作夥伴Cytokinetics近日聯合宣布,美國食品和藥物管理局(FDA)已授予omecamtiv mecarbil快速通道資格(FTD),該藥是一種新型選擇性心肌肌球蛋白激活劑,目前正開發用於治療射血分數降低的慢性心力衰竭(HFrEF)。
  • 安進新型心肌肌球蛋白激活劑omecamtiv mecarbil 3期...
    omecamtiv mecarbil是一種新型選擇性心肌肌球蛋白激活劑,旨在直接靶向心臟的收縮機制。目前,omecamtiv mecarbil正開發用於治療射血分數降低的慢性心力衰竭(HFrEF)。今年5月,美國FDA授予了omecamtiv mecarbil治療HFrEF的快速通道資格(FTD)。
  • Blebbistain肌球蛋白II的抑制劑作為一種調節膀胱梗阻的新策略
    誘導DO的PBOO導致膀胱肌球蛋白II型和同工型組成的改變。Blebbistatin(AbMole)是一種肌球蛋白II抑制劑,最近的研究證實了其可以有效地放鬆正常逼尿肌平滑肌(SM),並且有報告表明,Blebbistatin(AbMole)對非SM肌球蛋白(SMM)同工型和/或SMM與非肌球蛋白(NMM)的療效不同。
  • 科學網—高效低風險才是好農藥
    鄭永權告訴《中國科學報》記者,「高效、低毒、低殘留」的農藥概念主要針對人類而言,但是對生態環境、非標靶生物而言不一定安全,所以已經不能滿足現代社會發展需求。 為此,他們提出了農藥高效低風險理念,創建了以有效成分、劑型設計、施用技術及風險管理為核心的農藥高效低風險技術體系,將風險控制貫穿農藥研發、加工、應用及管理全過程,取得系列創新與突破。
  • 研究探明蜂蜜中新菸鹼類農藥的膳食攝入風險—新聞—科學網
    ,為我國制定該類農藥的使用規範,促進農業綠色發展,保障蜜蜂健康和蜂產品安全提供了數據支撐。然而過量使用或不合理使用農藥可嚴重汙染環境,對非靶標生物的生存造成威脅。 研究首次對源自我國19個省份、15種主要蜜源植物的中蜂蜂蜜和意蜂蜂蜜中新菸鹼類農藥殘留現狀進行全面系統的篩查,利用地理信息系統(GIS)構建我國蜂蜜中新菸鹼類農藥分布的可視化地圖,系統探明了新菸鹼類藥物在我國不同產地、不同蜜源植物和不同蜂種生產蜂蜜中的分布規律。
  • 所謂的「肌球蛋白拖著內啡肽」不過是圖文不符的「強行雞湯」罷了
    這是一個肌球蛋白,拖著一個內啡肽,走在一個單纖維上,然後大搖大擺的走過你的大腦皮層,這是讓你產生快樂的物質,這個小東西為了讓你開心每天辛苦的拖著這個大東西,你還有什麼理由難過呢?
  • 中國科學家破解光合作用最重要「超分子機器」—新聞—科學網
    其中,「光系統II」位於最上遊,極其重要,其結構解析的難度非常大。 5月20日,中國科學院生物物理研究所在北京召開新聞發布會宣布,該所柳振峰研究組、章新政研究組與常文瑞-李梅研究組通力合作,首次解析了菠菜光系統II-捕光複合物II超級膜蛋白複合體(PSII-LHCII supercomplex)的高精度三維結構。
  • Nature:揭示肌球蛋白將受損DNA拖到核孔機制
    肌球蛋白沿著核肌動蛋白絲行走這些研究人員發現在DNA鏈發生斷裂後,細胞會促進一系列線狀物---核肌動蛋白絲(nuclear actin filament)---組裝並創建臨時的高速公路通往細胞核的邊緣。隨後是護理團隊---被稱作肌球蛋白的蛋白---就過來了。「肌球蛋白是作為一種步行分子進行運送的,這是因為它們有兩條腿。
  • 冷凍電鏡首次觀察到單個原子—新聞—科學網
    圖片來源:Paul Emsley/MRC Laboratory of Molecular Biology 冷凍電鏡產生了迄今為止最清晰的圖像,並且首次識別出了蛋白質中的單個原子。據《自然》報導,兩個實驗室5月底報告的這一突破,鞏固了冷凍電鏡作為繪製蛋白質3D形狀的主要工具的地位。 「這是一個裡程碑,這是肯定的。真的沒有什麼可以突破了,這是最後的解析度屏障。」
  • 科學家解析新冠病毒RNA聚合酶三維精細結構—新聞—科學網
    由饒子和院士/婁智勇教授/王權教授等組成的「上海科技大學-清華大學抗新冠病毒聯合攻關團隊」率先在國際上成功解析了新型冠狀病毒轉錄複製機器核心單元「RdRp-nsp7-nsp8」複合體的三維空間結構,整體解析度達到2.9
  • 首個染色體水平大蒜基因組圖譜繪製成功—新聞—科學網
    這項成果由中國農業科學院麻類研究所(以下簡稱麻類所)南方蛋白飼料植物資源開發與利用團隊聯合有關高校和企業,歷時4年完成。 論文通訊作者、麻類所研究員劉頭明介紹,大蒜是重要的蔬菜作物之一,我國大蒜的年播種面積達到1000萬畝以上。大蒜具有膨大的鱗莖,富含大蒜素,不僅可用作蔬菜和調味料食品,也被廣泛用於醫藥產業。但栽培種大蒜一般不育,嚴重阻礙了大蒜生物學研究及大蒜育種工作。
  • 箕星藥業與Cytokinetics公司合作共同開發心肌肌球蛋白抑制劑
    轉自 | 醫藥觀瀾2020年7月14日,RTW Investments宣布,旗下投資設立的一家總部位於上海的生物技術公司——箕星藥業與Cytokinetics公司就新一代心肌肌球蛋白抑制劑CK-274在大中華區的研發和商業化籤訂了獨家許可協議。
  • 心肌肌球蛋白激活劑Omecamtiv mecarbil治療收縮期心力衰竭療效顯著
    心肌肌球蛋白激活劑Omecamtiv mecarbil治療收縮期心力衰竭療效顯著 作者:小柯機器人 發布時間:2020/11/18 13:36:13 美國加州大學舊金山分校John R.