1．要寫好科研論文，必須先養成讀英文文章的習慣，爭取每天30-60分鐘。剛開始可以選擇以讀英文報紙、英文新聞為主，逐漸轉為讀專業雜誌。我會在近期專門寫一篇博客文章介紹一套行之有效的增強讀專業雜誌能力的辦法。
2．寫科研論文，最重要的是邏輯。邏輯的形成來自對實驗數據的總體分析。必須先討論出一套清晰的思路，然後按照思路來做圖(Figures)，最後才能執筆。
3．具體寫作時，先按照思路（即Figures）寫一個以subheading為主的框架，然後開始具體寫作。第一稿，切忌追求每一句話的完美，更不要追求詞語的華麗，而主要留心邏輯（logic flow），注意前後句的邏輯關係、相鄰兩段的邏輯關係。寫作時，全力以赴，儘可能不受外界事情幹擾（關閉手機、座機），爭取在最短時間內拿出第一稿。還要注意：一句話不可太長。
4．學會照葫蘆畫瓢。沒有人天生會寫優秀的科研論文，都是從別人那裡學來的。學習別人的文章要注意專業領域的不同，有些領域（包括我所在的結構生物學）有它內在的寫作規律。科研文章裡的一些話是定式，比如 「To investigate the mechanism of …, we performed …」, 「These results support the former, but not the latter, hypothesis …」, 「Despite recent progress, how … remains to be elucidated …」 等等。用兩次以後，就逐漸學會靈活運用了。在向別人學習時，切忌抄襲。在美國一些機構，連續7個英文單詞在一起和別人的完全一樣，原則上就被認為抄襲（plagiarism）。
5．第一稿寫完後，給自己不要超過一天的休息時間，開始修改第二稿。修改時，還是以邏輯為主，但對每一句話都要推敲一下，對abstract和正文中的關鍵語句要字斟句酌。學會用「Thesaurus」（同義詞替換）以避免過多重複。第二稿的修改極為關鍵，再往後就不會大改了。
6．第二稿以後的修改，主要注重具體的字句，不會改變整體邏輯了。投稿前，一定要整體讀一遍，對個別詞句略作改動。記住：學術期刊一般不會因為具體的語法錯誤拒絕一篇文章，但一定會因為邏輯混亂而拒絕一篇文章。
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