蓮花生大士（蓮師）是密宗和藏傳佛教的奠基者。至尊蓮師先於印度、尼泊爾等地廣弘佛法。公元八世紀，蓮花生大士入藏，創建顯密經院及密宗道場，開創了藏傳佛教。
蓮花生大士以金剛乘的教法，尤其是甚深伏藏的廣大佛行事業影響了無數眾生。這位偉大的上師並非僅是登地菩薩的聖者，而是阿彌陀佛、觀音菩薩、釋迦牟尼佛身、口、意三密的共同化身，他的化現是為利益世間眾生和調伏惡毒天龍鬼神。當今佛法能夠住世，亦仰仗於蓮師之加持。因此，他被藏人尊稱為「咕嚕仁波切」，意為「寶上師」或「珍貴的上師」。蓮花生大士又被藏人尊稱為「第二佛陀」。
一、神變化生
蓮花生大士出生於鄔金國（今巴基斯坦境內），據伏藏法教關於蓮師神變化生方式的記載， 在菩提迦耶西方的鄔金國達納科夏海洲中出現了一朵由諸佛加持力綻放的千瓣蓮花，從阿彌陀佛的心中射出了一隻標記著「舍」字的金色金剛杵，落在這朵蓮花的胚胎上，在彩虹光芒中金剛杵剎時化成一個八歲孩童手握金剛杵和蓮花，相好莊嚴，四周有空行母圍繞。如是，由最具慈悲佛心所生化的蓮花生大士降臨娑婆世界救度眾生。
鄔金國的國王因扎菩提因膝下無子，供養三寶、發願布施眾生。後為了尋得如意寶，前往外海洲。在回程中途徑達納科夏海洲，大臣和因扎菩提王相繼看到了這位端坐巨蓮散發金光的孩童。國王問孩童來自何處，在此處做何事？孩童答道：我無父母，是阿彌陀佛和觀音菩薩的化身，我的使命是來弘揚金剛乘教義，普度眾生。國王認為這是對他祈求子嗣的回應，於是將他迎回王宮，封他為太子，起名為蓮花生。此後，鄔金國風調雨順，國泰民安。
二、修持求學 弘法利眾
王子蓮花生長大後，成為王位繼承人。但他很快意識到若繼續治理王國，將無法完成利他的廣大宏願，便向因扎菩提王請求棄位出家，未獲國王應允。蓮花生堅固無上的菩提心已定，施計促成他棄位去修行。
蓮花生大士先後在寒林、悅林、莎薩洲等屍陀林處專修瑜伽行，並接受了降魔母與喜續母兩位空行母的灌頂加持。經過不斷精進修持，他已能降伏不同屍陀林的所有惡魔時，被稱作「寂護上師」。
之後蓮花生大士返回降生的達納科夏海洲，修習密咒乘和空行母的密語，藉此號令了島上的空行母和海中龍族。隨後他在礫林修行，在一次淨觀中見到金剛瑜伽母而得到灌頂，由所有勇父和空行母賦予其超自然的神力，因此被稱為「金剛威猛力」。
後來，蓮花生大士來到菩提迦耶的金剛座，示現許多神跡，已聲名遠播。人們詢問他是何方神聖，當他回答說他是自生佛陀時，大家都不相信且有謗言。蓮師考慮未來眾生修持佛法必須有所師承的原因，前往薩訶國，從釋迦光尊者剃度為僧，得授法名為「釋迦獅子」。為做示現，他接受了十八次瑜伽部密續，親見到瑜伽諸位本尊。他又拜女性上師昆噶瑪為師（昆噶瑪是智慧空行母密智以尼師身的化現），向她請求外內密三種灌頂，於是昆噶瑪將他變成一個「吽」字從口中吞下，再由密處釋出。在其體內，蓮花生大士被授予外、內、密的灌頂，清淨了身口意三種障。
蓮花生大士週遊古印度，他見到了八大持明，接受八大部的儀軌；從佛密大師接受了《大幻綱》的教授；從師利星哈接受了《大圓滿》法……以此方式，蓮師從印度許多博學、證悟的上師修學、受持了所有經部、續部、五明等法教。他只學過一遍即可精通所學，甚至未須修持即能親見所有本尊。這時他被稱為「愛慧上師」,並示現出圓滿成熟持明果位的行止。
為修持密咒法，蓮花生大士攝受了扎霍國王毘哈達拉之女、具德的空行母曼達拉娃。他以曼達拉娃為修持的所依，在瑪拉提卡的山洞裡共修了三個月，於是阿彌陀佛親臨，授予兩人灌頂，並加持兩人與其無二無別。他們還得到了十億的長壽密續，成就了長壽持明果位。
在證得超越生死的金剛身後，兩人首先到扎霍國傳法，在化緣時被國人抓住施以火焚，他和明妃示現神變，將麻油變成了一座冷湖，兩人毫髮無傷地端坐在湖中間的一株蓮花上，扎霍國人於是生起信心，修持佛法。然後蓮師和明妃回到鄔金國教化臣民，在化緣時被認出而再次施以火刑，這次他們仍涼爽地安住在一株蓮花中，穿戴著一串顱骨飾鬘，代表將一切眾生自輪迴中解脫出來。因此神變，稱蓮花生大士為「蓮花顱鬘力」。蓮師在鄔金國十三年，教化國人修持佛法，將整個王國轉為修持佛法的國度。這期間，他賜予《法海總集》的灌頂和法教，國王、王妃和具緣弟子皆證得了殊勝的持明果位。為此，蓮花生大士又被稱為「蓮花王」。
在密乘經典中，記載有關蓮花生大士集智慧、慈悲、伏惡的力量於一身，擁有無邊法力的事跡非常多。根據《幻識經》中的授記，蓮花生大士曾將自己變身比丘善力，為了調伏阿育王，於一夜之間建了一百萬座安放佛舍利的佛塔，從而引導阿育王皈依佛門。蓮師也曾被一位國王下毒，但絲毫無損。當他被丟進河中時，讓整條河逆流而上，並在空中飛舞。為此，他被稱為「大力金翅鳥孺童」。
此外，蓮花生大士還以取出《喜金剛續》的上師阿闍梨蓮花金剛、婆羅門薩哈拉、多毘黑嚕嘎、毘汝巴、卡拉恰雅等許多大成就者的身形示現。他在大屍林禪修，將密法傳給空行母，並降服外、內的世間鬼神，號令他們護持佛法，這時他被稱為「日光上師」。
當五百外道在菩提迦耶金剛座的無遮辯經大會中，行將辯破佛法時，蓮花生大士出現並挑戰所有外道而獲全勝。當有些外道以神通惡咒猛詛，他以空行母降魔母所授的威猛咒將其擊潰，剩下的外道皆皈順佛法。這時他被稱為「威猛獅吼」。
在蓮花生大士前往位於今印度、尼泊爾交界處的揚列雪山洞時，遇見了尼泊爾王的公主釋迦天女，將她納為修持所依與明妃。當他在修行清淨黑嚕嘎時，發現由龍族製造的魔障，使尼泊爾三年不降雨且疾病、饑荒橫行。蓮師派遣使者去詢問其上師普巴，應用何法來對治這些魔障。兩名使者帶回了普巴的教法，當兩人回返尼泊爾的當刻，這些魔礙就自動銷聲匿跡，空中雨降，疫病、饑荒平息了。蓮師和明妃證得了殊勝的成就，住於大手印持明的果位。
蓮花生大士居住在古印度一千八百年，廣訪密法大師，傳法利眾。他在各地示現、化身種種、說各種語言以引領眾生步入解脫之道的事業，實在是難以計量。蓮師在各地所傳下的《喜金剛》、《密月明點》、《清淨黑嚕嘎》、《馬頭明王》、《普巴》和《本母》等法，至今依舊流傳著。