篇重點闡釋董氏奇穴針灸獨特的理論體系。董公原著《董氏針灸正經奇穴學》僅僅講述了數百奇穴的分布及主治，諸多內容尚未公開，楊師根據董公生前之口授心傳，結合自己多年的臨證參悟，構築了董氏奇穴針灸完整的理論框架。常波參考在臺北跟楊老師隨診學習的心得筆記，將其理論之精華底蘊一一剖析，系統整理如次：
１．暗影及青筋
當某臟腑或經絡有病變時，常常在身體某些特定部位出現暗影（經云：有諸內必形諸外）。一般而言，在手掌及面部較易出現，這種方法除了反映病變，有助於診斷外，尚可在該處施針，產生治療效應。董公於此法甚為精通，並以此形成固定治療穴位，如水金、水通治逆氣咳喘，五虎穴治手腳痛，重子、重仙治肩背痛等等，均為此方法之發揮。青筋即青紫暴張之靜脈血管，亦稱鬱絡。
多見於肘、膝或小腿外側，亦可見於魚際、然谷部位。董公認為許多久病、怪病、頑症痼疾均可見此反應，若不注意此症，其所有患處則永不能根治。據楊老師經驗，有些病刺血治療一次，即有痊癒者，一般經針治一次後即大見減輕，數次後，其病就根治。
2．全息
在中醫天人合一學說中認為：每一個局部均與全體相關，每一個局部均能反映全體，也皆能以之治療全體，這就是全息論的觀點。
董氏奇穴的穴位分布與全息律亦有相似之處，董公強調任一局部皆能治療全身疾病，董公雖將全身區分為十二治療部位，但每一部位均可獨立治療全身疾病。一個組穴本身即常蘊有全息意味。例如靈骨、大白並用為董公溫陽補氣要穴，治病之多，幾乎全身無所不包，療效之高，亦非其它穴位所可比擬。大白位置與三間位置相符，系大腸經俞穴，靈骨穴在一、二掌骨結合部之前，兩穴合用涵蓋俞原所經之處，若以全息律而論，大白、靈骨皆以深針為主，又深透上、中、下三焦，因此不論縱橫，此二針皆涵蓋三焦，效果之大，自是可知。董公的倒馬針法常兩三針並列，雖說因並立加強了治療作用，但何嘗不是憑藉全息作用，全體互應的結果。尤其是八八部位三針並列的臟腑治療系列，更與全息律有著不謀而合的關係。董氏奇穴「全息通應」理論，提出了多元的、立體層次的「全息體」概念。
3． 對應
《標幽賦》說：「交經繆刺，左有病而右邊取，瀉絡遠針，頭有病而腳上針。」董公善用上病下治，下病上治，左病針右，右病針左，絕不在局部針刺，其治病常用對應取穴，效果卓著。董公常用之對應取穴法有下列九種：
（1） 等高對應
即在痛點對側相等部位施針，左側病痛可取右側等高點，例如左曲池痛可針右曲池。推廣應用治療內科病也可不採用雙側同穴針刺，而採用單側或雙側異穴針刺。
（2） 手足順對
將上肢與下肢順向並列，以肘對應膝為中心對應，可有下列對應：即肩對髖、上臂對大腿、肘對膝、下臂對小腿、手對腳。如髖有病可取肩部穴位（例：肩中穴）施治；膝部有病取曲池或尺澤（肘後歌）施治（反之肩部有病也可取髖部穴位施治，肘部有病也可取膝部穴位施治）。楊老師常以小節穴治腳踝痛，即系此一對應之運用。
（3） 手足逆對
將上肢與下肢呈逆向排列，可有如下對應：即肩與足、上臂與小腿、肘與膝、下臂與大腿、手與髖。如足踝部有病可取肩部穴位治療，大腿有病可取下臂穴位治療（反之肩部有病可取足部穴施治，下臂有病也可取大腿穴施治），董公常取手上靈骨、後溪等穴治療坐骨神經痛，均系此一原理之應用。
（4） 手軀順對
上肢除與下肢有對應關係外，與軀幹亦有對應關係，將上肢自然下垂與軀幹呈順向並列對置，則有如下對應：即上臂與胸（或背）脘，肘與（腰），下臂與下腹（腰骶），手與陰部。如腰骶或下腹有病可取下臂穴位治療，陰部病可取手部穴治療（反之下臂病也可去下腹或腰骶部穴位施治）。董公以手上大間等五間穴治疝氣即與此一原理有關。
（5） 手軀逆對
將上肢與軀幹呈逆向並列，可有下列對應關係：即手（腕）與頭（頸），前臂與胸（背）脘，肘與（腰），上臂與下腹（或腰骶），肩與陰部。如胸脘有病，可取前臂穴位施治（如用內關或董氏奇穴火串、火陵治心悸、胸悶等），下腹有病，可取上臂穴位施治（反之前臂及上臂有病，亦可取胸脘及下腹穴位施治）。董公以肩部之天宗、雲白等穴治婦科陰道病都與此一原理有關。
（6） 足軀順對
下肢除與上肢對應關係外，與軀幹亦有對應關係，將下肢與軀幹順向並列對置，則有如下對應：即大腿與胸（背）脘，膝與（腰），小腿與下腹（腰骶），足與陰部。如胸背有病可針大腿，下腹有病可針小腿，反之大腿及小腿有病，亦可在胸腹施治。臨床常以大腿部位之駟馬治肺、三通治心，其運用皆與此一原理相合。
（7） 足軀逆對
將下肢與軀幹呈逆向排列，可有下列對應關係：即足與頭、踝與頭頸、小腿與胸（背）脘、膝與臍（腰）、大腿與下腹（腰骶）如胸脘有病可針小腿，下腹有病可針大腿，反之亦然。董公亦以正筋、正宗治頸項不適，都與此一對應法有關。
（8） 頭骶對應
除了手與腳及腳與軀幹的對應外，頭面與尾骶亦形成一種對應。例如臨床以骶部之長強治癲狂之腦病，董公亦常以衝霄穴治頭痛，也是此一原理之應用。
（9） 頭足對應
頭頂百會與腳底之湧泉也形成對應，即所謂的「天頂封地門」，所以用湧泉治療巔頂痛及腦部病變。
4．體應
體應是董氏奇穴在治療方面最有針對性的發明及應用，掌握此一原則，不僅能將董氏奇穴應用得更深入更有效，以之用於十四經穴方面，也能加強效果。體應之要點即以骨治骨；以筋治筋；以肉治肉；以脈治脈，以皮治皮。
（1） 以骨治骨
治骨刺常用削骨針，即四花中及其下三寸的倒馬針，兩針緊貼骨頭才有作用。本組穴位治療膝蓋骨刺，肥大性、退化性關節炎療效很好。董公扎針，能貼骨就儘量貼骨，例如靈骨、火主、大白等穴貼骨而入，不但針感強而且療效高。又如常用九裡（風市）穴每每深至貼骨，治療各種風病、疼痛以及半身不遂，療效甚好。目前有一派說法強調骨膜傳導，認為骨膜有傳導作用，因此扎針時儘量貼骨或抵骨，療效較佳。
（2） 以筋治筋
貼筋進針可治筋病，例如尺澤在大筋旁，可治全身的筋病，對運動病變效果很好。又如正筋、正宗（跟腱）是一大筋，針刺入正筋、正宗可治療頭頸強硬，小腿筋緊等多種筋病。
（3） 以肉治肉
例如駟馬及肩中皆是肌肉較為豐富的部位，最常用來治肌肉方面的病變，尤其是肌肉萎縮，療效甚好。
（4） 以脈治脈
緊貼脈管的穴位可治脈病，例如針人宗、地宗，因靠近血管，調整血液循環，治心臟病及血管硬化效果很好。