小腸位於腹中，其上口與胃在幽門相接，下口與大腸在闌門相連，是一個比較長的、呈迂曲迴環迭積狀的管狀器官。小腸與心由手太陽小腸經與手少陰心經相互屬絡面成表裡關係。小腸的主要生理機能是主受盛化物，泌別清濁，主液。
小腸主受盛化物，指小腸接受盛納食糜並對食糜作進一步消化的機能。主要表現於以下兩個方面:一是小腸接受由胃腑下傳的食糜而盛納之，即受盛作用:二是食糜在小腸內必須停留一定時間，由脾氣與小腸的共同作用對其進一步消化，化為精微和糟粕兩部分，即化物作用。小腸受盛化物機能失調，表現為腹脹、腹瀉、便溏等。
小腸主泌別清濁，指小腸對食糜作進一步消化， 並將其分為清濁兩部分的生理機能。飲食入胃，經胃腐熟而成食糜，下傳小腸。小腸受盛，並在膽汁的參與下，泌別清濁，水谷精微由脾臟轉輸以養全身；食物殘渣則下傳大腸。
其中清者，即谷精和津液，由小腸吸收，經脾氣轉輸至全身，灌溉四旁；濁者，即食物殘渣和部分津液，在胃與小腸之氣的作用下經闌門傳送到大腸。小腸泌別清濁的機能正常，則精微與糟粕各走其道而二便正常。若小腸泌別清濁的機能失常，清濁不分，就會出現便溏洩瀉等症。
小腸主液，指小腸在吸收谷精的同時，吸收了大量津液的生理機能。小腸吸收的津液與谷精合為水谷之精，由脾氣轉輸到全身，其中部分津液經三焦下滲膀胱，成為尿液生成之源。如《類經.藏象類》說:「小腸居胃之下，受盛胃中水谷而分清濁，水液由此而滲於前，糟粕由此而歸於後，脾氣化而上升，小腸化而下降，故曰化物出焉。」故可以「利小便所以實大便"的方法治療洩瀉，就是「小腸主液」理論的具體應用。
心與小腸通過經脈相互屬絡構成了表裡關係。
生理上，心主血脈，心陽之溫煦，心血之濡養，有助於小腸的化物等機能；小腸化物，泌別清濁，清者經脾上輸心肺，化赤為血，以養心脈。
病理上，心經實火，可移熱於小腸，引起尿少、尿赤澀刺痛、尿血等小腸實熱的症狀。反之，小腸有熱，亦可循經上燻於心，可見心煩、舌赤糜爛等症狀。此外，小腸虛寒，化物失職，水谷精微不生，日久可出現心血不足的病證。
小腸主受盛化物，接受由胃初步消化的飲食，故飲食上同養胃一樣，多注意三餐的飲食控制，飲食應以溫、軟、淡、素、鮮為宜，要注意忌嘴，不吃過冷、過燙、過硬、過辣的食物。
神闕：在臍中部，臍中央。有培元固本、和胃理腸的功效。禁針刺，宜用灸法。
小腸俞：是足太陽膀胱經的常用腧穴之一，位於骶正中嵴旁開1.5寸，平第1骶後孔。可推拿腰骶部，也是兩個手掌心搓熱，放在腰骶部的方向往下擦，擦到我們的腰骶部覺得發熱為止。
保持精神愉快和情緒穩定很重要，避免焦慮、恐懼、緊張、憂傷等不良情緒的刺激。同時注意勞逸結合，防止過度疲勞而殃及腸胃。