Plant Cell | 北京市農林科學院許勇團隊系統解析西瓜果實「甜蜜」基因進化的分子機制

2021-02-23 BioArt植物

責編 | 王一

自然界大多數植物的光合產物從源到庫通過韌皮部運輸碳水化合物以蔗糖為主,但有5%植物如西瓜等葫蘆科作物是以棉籽糖系列寡糖[raffinose (Raf) family oligosaccharides, RFOs] 作為光合產物韌皮部運輸的主要物質。上世紀60-80年代就已發現葫蘆科等作物韌皮部運輸的主要糖分是RFOs,但至今RFOs運輸型植物庫器官果實如何利用RFOs的分子機制這一個古老的科學問題尚不十分清楚。

2021年2月12日,北京市農林科學院許勇研究團隊在植物學國際知名期刊The Plant Cell在線發表了題為Evolutionary gain of oligosaccharide hydrolysis and sugar transport enhanced carbohydrate partitioning in sweet watermelon fruits的研究論文(Ren et al., 2021),解析了西瓜果實分解RFOs並轉運到果肉細胞貯存的進化分子機制。The Plant Cell對該論文進行了評述推薦,高度肯定了團隊在RFOs運輸型植物碳水化合物分配與轉運的分子機制研究上的系列工作。

已有的研究結果表明,RFOs運輸到果實後水解並轉運到果實細胞液泡儲存糖分必須經歷四個關鍵的環節:1)維管束運輸的RFOs在西瓜果實韌皮部水解為蔗糖;2)水解產生的蔗糖在果實韌皮部的卸載到韌皮部外側細胞間隙;3)果肉細胞質膜上糖轉運蛋白將細胞間隙的糖分轉運吸收到果肉細胞內;4)果肉細胞中糖分最終運輸到果肉細胞液泡中完成存儲。2018年許勇團隊在Plant Physiology發表論文 (Ren et al., 2018),揭示了液泡膜糖轉運蛋白TST2積累糖分的分子機制;2020年該團隊又在New Phytologist發文 (Ren et al., 2020),報導了在半野生進化到栽培西瓜過程中,新型糖轉運蛋白ClVST1通過膜定位的改變調節果實韌皮部糖分卸載。結合在The Plant Cell發表的最新成果(Ren et al., 2021),該團隊已全面系統地解析了西瓜果實「甜蜜」基因4個重要節點進化的分子機制。

在該研究中,研究團隊巧妙地設計了野生和栽培西瓜幼嫩果實交互嫁接實驗,首次明確了RFOs運輸型植物西瓜果實是RFOs水解的主要器官,且在野生西瓜果實中存在RFOs「滯留」,通過馴化栽培西瓜莖傷流液中運輸RFOs的能力大大強於野生西瓜。進一步採用GWAS、CRIPSR敲除和生化實驗等技術手段,該研究證實了果實維管束表達的鹼性α-半乳糖甘酶ClAGA2是RFOs水解的關鍵酶,其表達受到了轉錄因子ClNF-YC2調控。α-半乳糖甘酶ClAGA2基因啟動子區間SNPs -159 (C-T)和-170 (C-T) 位點與棉子糖含量高度關聯,這2個SNP打斷了野生西瓜中調控ClAGA2表達的轉錄因子ClNF-YC2識別位點,導致野生西瓜中ClNF-YC2不能激活ClAGA2表達,ClAGA2起到了快速水解果實庫端韌皮部棉子糖系列寡糖為蔗糖的作用。下一步由韌皮部蔗糖轉運蛋白ClVST1將蔗糖從韌皮部卸載下來 (Ren et al., 2020)。ClSWEET3將糖分跨果肉細胞質膜轉運到細胞內,為液泡膜表達的糖轉運蛋白ClTST2提供原料,最終ClTST2將糖分轉運並儲存到液泡中 (Ren et al., 2018)。

圖1. 西瓜果實碳水化合物分配、轉運及糖分積累模式圖

進一步研究發現,西瓜野生祖先種的果實小、不能積累糖分,只有少量光合產物被分配到果實;半野生西瓜果實較大、含糖量中等,相對於祖先種野生西瓜,能更多積累光合產物。進化選擇分析發現,ClAGA2是西瓜野生祖先種馴化到半野生西瓜過程中受到馴化選擇的關鍵基因。半野生西瓜馴化成栽培西瓜過程中,在果實大小和果實糖含量方面進一步馴化和提升;三個糖轉運蛋白ClVST1、ClSWEET3和ClTST2則是這一步馴化過程中受到選擇的關鍵基因,且位於含糖量主效QTLs區域(Ren et al., 2014)。上述結果表明,ClAGA2、ClVST1、ClSWEET3和ClTST2四個關鍵節點基因呈現分步進化與馴化的特徵。其中,ClAGA2和糖轉運蛋白ClVST1、ClTST2在野生、半野生和栽培材料之間均存在關鍵的變異位點,利用這些變異位點,研究團隊進一步建立了利用西瓜野生高效轉育高糖高品質的分子標記輔助育種技術體系(專利號或申請號:ZL201610055412.4, 201911021073.8, 202010945909.X)。結合常規育種技術,該團隊已培育出高品質硬脆果肉耐貯運的「京美」系列西瓜品種,既保持栽培西瓜果實糖含量高的優良品質,又從野生材料引入了抗病、硬脆果肉、抗裂耐儲運等優異基因(圖2)。「京美」系列西瓜品種實現了從東北、黃淮海到雲南、緬甸等東南亞國家跨區域跨國境的生產與長途運輸,累計推廣面積超過400萬畝,推動了我國西瓜新一輪品種更新。


因此,解析西瓜果實「甜蜜」基因進化的分子機制,不僅闡明了RFOs運輸型植物果實碳水化合物分配與轉運分子機制的理論問題,也為野生西瓜資源的高效利用與高品質西瓜選育提供了分子輔助選擇的工具,這一研究成為基礎研究成果成功應用於育種實踐、帶動產業變革的經典案例。

圖2. 利用西瓜野生資源通過分子輔助育種技術選育抗病、硬脆果肉、抗裂耐貯運、高品質西瓜新品種「京美10K」。

北京市農林科學院國家西甜瓜改良中心任毅副研究員為該論文的第一作者,許勇研究員和任毅副研究員為通訊作者。中國農業大學張小蘭教授團隊、德國馬普研究所Alisdair R. Fernie教授團隊和美國加州大學伯克利分校勞倫斯國家實驗室Henrik V. Scheller教授團隊參與了該研究。該項目由國家重點研發計劃、國家自然基金委和北京市自然科學基金等項目的資助。

Ren, Y., McGregor, C., Zhang, Y., Gong, G., Zhang, H., Guo, S., Sun, H., Cai, W., Zhang, J., and Xu, Y. (2014). An integrated genetic map based on four mapping populations and quantitative trait loci associated with economically important traits in watermelon (Citrullus lanatus). BMC Plant Biol 14:33.Ren, Y., Guo, S., Zhang, J., He, H., Sun, H., Tian, S., Gong, G., Zhang, H., Levi, A., Tadmor, Y., et al. (2018). A Tonoplast Sugar Transporter Underlies a Sugar Accumulation QTL in Watermelon. Plant Physiol 176:836-850.Ren, Y., Sun, H., Zong, M., Guo, S., Ren, Z., Zhao, J., Li, M., Zhang, J., Tian, S., Wang, J., et al. (2020). Localization shift of a sugar transporter contributes to phloem unloading in sweet watermelons. New Phytologist DOI:10.1111/nph.16659.

Ren, Y., Li, M., Guo, S., Sun, H., Zhao. J., et al. (2021). Evolutionary gain of oligosaccharide hydrolysis and sugar transport enhanced carbohydrate partitioning in sweet watermelon fruits. The Plant Cell DOI:10.1093/plcell/koab055.

全文連結:

https://academic.oup.com/plcell/advance-article/doi/10.1093/plcell/koab055/6133242


相關焦點

  • 北京市農林科學院蔬菜中心左進華團隊聯合英美科學家揭密蛇瓜基因...
    12月1日,北京市農林科學院蔬菜中心(國家蔬菜工程技術研究中心)左進華副研究員團隊與英國諾丁漢大學Donald Grierson教授 (英國皇家科學院院士、中國工程院外籍院士) 團隊、美國康奈爾大學BTI研究所費章君教授團隊聯合在農林科學Q1區Top期刊Horticulture research(IF:5.404
  • 北京市農林科學院在小白菜基因組及其重要形態性狀進化分子基礎...
    近日,北京市農林科學院蔬菜中心白菜課題組在植物學領域國際知名期刊《Plant Biotechnology Journal》(IF=8.154)在線發表了題為「Assembly of the non-heading pak choi genome forbid comparison with the genomes of heading Chinese cabbage
  • 北京市農林科學院玉米基因組編輯團隊在基因編輯技術方面再獲新進展
    12月16日,北京市農林科學院玉米DNA指紋及分子育種北京市重點實驗室基因組編輯團隊在Frontiers系列新期刊Frontiers in Genome Editing上發表題為「Genome engineering in plant using an efficient CRISPR-xCas9 toolset with an expanded
  • 中國農業科學院柑桔研究所陳善春研究員團隊解析CsPrx25提高柑橘對...
    近日,Nature出版集團旗下TOP期刊Horticulture Research(SCI一區,IF=5.404)在線發表了西南大學/中國農業科學院柑桔研究所陳善春研究員團隊題為CsPrx25, a class III peroxidase in Citrus sinensis, co
  • 歷時15年 西北農林科技大學肉牛基礎研究獲多項創新性成果
    西部網訊(通訊員 李曉春)12月18日,中國農學會組織以中國科學院印遇龍院士為組長的7人專家組,對西北農林科技大學動科學院昝林森教授歷時15年主持完成的「中國肉牛重要經濟性狀功能基因組學研究與應用」,按照科技部科技成果評價標準和程序進行了評價,認為該成果總體達到國際先進水平,其中有關中國黃牛遺傳多樣性與起源進化研究
  • 黃瓜番茄白菜等蔬菜基因組學研究利用國際領先——「十三五」農業...
    找到黃瓜的苦味基因,從而培育了葉片是苦的,可以抗蟲,而果實不苦 品質優質的品種。 利用番茄基因組,構建了番茄分子育種的技術體系。 我國是世界上最早使用第二代測序技術開展蔬菜基因組研究的國家,中國農科院、北京農林科學院、中科院遺傳所和華中農大等優勢團隊合作,先後繪製完成了黃瓜、番茄、西瓜、大白菜、甘藍等蔬菜作物的全基因組序列圖譜和變異圖譜,在國際上處於領跑地位。
  • 福建農林大學科研團隊在《Nature》上發布研究成果
    19日,由福建農林大學張亮生教授團隊主持,南京農業大學、比利時根特大學、美國賓州州立大學等多家單位參與的研究成果《睡蓮基因組和早期開花植物進化》(Thewaterlilygenomeandtheearlyevolutionoffloweringplants),在國際頂級學術期刊《Nature》上在線發表,該成果的發布表明我國在這一研究領域處於國際領先水平
  • 首個山蒼子基因組圖譜:揭秘精油合成分子機制—新聞—科學網
    4月3日,《自然—通訊》在線發表中國林業科學研究院亞熱帶林業研究所(以下簡稱亞林所)研究員汪陽東團隊的重要成果。該團隊成功組裝全球首個染色體級別的高質量山蒼子基因組圖譜,並基於此揭示樟科物種進化及其精油合成分子機制。
  • 第二屆海峽兩岸食品功能分子科學高峰論壇在福建農林大學召開
    12月5日,第二屆「海峽兩岸食品功能分子科學高峰論壇」暨「首屆閩臺海洋科學研究生論壇」在福建農林大學金山校區拉開帷幕。,闡明相關調控機制;研究基於菌劑、酶製劑等嘔吐毒素、鏈格孢毒素等汙染的安全控制新策略,解析相關識別機制。
  • 每日摘要:植物形成層活性的動態調控機制綜述(Annual Review of Plant Biology)
    BhaleraoStem cell populations in meristematic tissues at distinct locations in the plant body provide the potency of continuous plant growth.
  • 中國科學家揭示植物殺手薇甘菊「行兇」機制
    中國青年報客戶端北京1月21日電(中青報·中青網記者 邱晨輝)記者今天從中國農業科學院獲悉,中國科研團隊針對重要外來入侵植物薇甘菊,從多個角度揭示了其在全球入侵過程中的環境適應性進化和快速生長的分子機制,為有效防治和管控薇甘菊進一步入侵提供了理論依據。
  • Cell論文詳解!RNA分子如何「主宰」自己的命運?
    如今,在一項新的研究中,美國懷特海德生物醫學研究所成員、麻省理工學院生物學教授Richard Young及其團隊和麻省理工學院化學工程教授Arup K. Chakraborty及其團隊發現RNA分子通過反饋迴路調節它們自身的形成。RNA分子太少,細胞就會啟動轉錄以產生更多的RNA分子。然後,在某個閾值,過多的RNA分子會導致轉錄停止。
  • Mol Plant|中科院遺發所儲成才團隊揭示硝酸鹽誘導的磷響應機制
    因此,植物在進化過程中產生了複雜的信號調控網絡來整合不同營養元素信號,協調其吸收和利用。長期以來,人們對氮磷信號通路解析大多分開進行,導致對氮磷互作機制的理解非常有限。儲成才研究組長期致力於水稻營養高效吸收利用的分子基礎解析及作物的分子設計育種研究,鑑定到硝酸鹽轉運蛋白NRT1.1B的自然變異是導致水稻秈粳亞群間氮利用效率差異的重要原因 (Hu et al., 2015)。
  • 北中醫與耶魯大學合作在Nature發表文章,免疫系統研究領域又取得...
    人類適應性免疫的關鍵機制是抗體和T細胞受體重排激活基因 (Recombination activating gene, RAG)介導的V(D)J重排機制。該機制是由美籍日裔科學家Susumu Tonegawa (利根川進)團隊在1979年發現, 他因此於1987年獲得諾貝爾生理學或醫學獎。 同時, 利根川進創造性地提出了重排機制的轉座子起源假說。
  • Cell子刊:北大肖瑞平團隊揭示高糖抑制AMPK信號通路的分子機制
    其中,AMPK是調節生物能量代謝的核心分子之一,也是治療代謝疾病的重要靶點。AMPK能感知細胞代謝狀況——在營養和能量水平較低的狀態下,AMPK被激活,從而抑制合成代謝、促進分解代謝,在促進ATP合成的同時抑制細胞的生長,最終維持細胞內能量穩態。另一方面,對於抑制AMPK活性的負調節機制,我們卻知之甚少,也因此缺乏對於AMPK信號通路調控方式的全面認識。
  • Cell:揭開廬山真面目,李蘭娟/李賽首次解析新冠病毒完整分子結構
    該研究使用冷凍電子斷層掃描(cryo-ET)和子斷層掃描圖平均化(STA),解析了真實的新冠病毒的分子組裝。非常詳細地描繪了新冠病毒的完整結構,揭示了新冠病毒是如何在直徑僅80nm的內腔中堆積30kb長的RNA基因組。
  • 山東農大張憲省團隊揭示植物幹細胞發育調控關鍵機制!
    張憲省教授科研團隊部分成員山東農業大學張憲省教授科研團隊歷時近十年,首次揭示了WUS、STM、CLV3三個關鍵因子之間精細的相互作用模式,解析了WUS和STM介導幹細胞形成和維持調控途徑的交叉和協同,為進一步分析植物莖端分生組織幹細胞活性的調控機制提供了新的思路。
  • Nature Comm | 復旦大學董愛武/沈文輝合作揭示組蛋白分子伴侶OsChz1調控染色質結構的分子機制
    真核生物DNA複製、轉錄與修復一直伴隨著核小體的組裝/去組裝過程,該過程需要依賴組蛋白分子伴侶的幫助。已有的研究發現,酵母Chz1是組蛋白變體 H2A.Z特異的組蛋白分子伴侶,系統進化樹分析顯示在酵母、真菌、植物及動物中都存在Chz1同源蛋白,但目前對Chz1蛋白的功能研究僅在酵母中被報導。
  • 進擊2018基因編輯CRISPR系統重磅研究盤點!
    CRISPR/Cpf1基因編輯系統最早出現於2015年,與CRISPR/Cas9基因編輯系統相比,新的CRISPR/Cpf1基因編輯系統具有如下優勢,①只需一個協助RNA分子,Cas9需要2個RNA分子協助,