有「南美洲脊梁」之稱的安第斯山脈是重要的物種馴化搖籃之一，許多馴養動物起源於此，其中包括羊駝（Vicugna pacos）和美洲駝（Lama glama）這兩個具有經濟價值的駱駝科馴化物種。然而，科學界對羊駝和美洲駝的起源和演變仍知之甚少。
國際上也存在爭議，基於考古或形態學的研究認為，羊駝馴化自原駝（L. g. guanicoe）、駱馬（V. v. vicugna）、或美洲駝和駱馬的雜交，美洲駝則馴化自原駝；而基於少量分子標記的一些研究表明羊駝馴化自駱馬，美洲駝馴化自原駝。
近日，基因組學領域權威雜誌《基因組生物學》（Genome Biology）在線發表了由中國、英國、智利、秘魯、丹麥等國家的科學家合作完成的一項研究，題為「Genomic analysis of the domestication and post-Spanish conquest evolution of the llama and alpaca」。研究發現羊駝和美洲鴕兩個物種之間存在大範圍的不對稱基因漸滲現象。通過對漸滲發生時間及近期有效種群大小波動進行推斷，研究揭示發生於16世紀30年代的西班牙殖民南美洲事件對當地傳統畜牧業所造成的可能影響。
中國科學院動物研究所詹祥江研究員、英國卡迪夫大學Michael W. Bruford教授和山西農業大學董常生教授為該論文共同通訊作者。山西農業大學範瑞文教授、中國科學院動物研究所博士研究生谷中如、華大基因光宣敏工程師和智利比奧比奧大學的Juan C. Marin教授為共同第一作者。
研究團隊採集了安第斯山脈4個相關物種28個個體的血液樣品，通過對全基因組序列分析和系統發生樹構建，發現羊駝起源於駱馬，而美洲駝則馴化自原駝。
通過對遺傳結構和局部祖先推斷（Local Ancestry Inference）分析，研究團隊發現兩個物種之間存在大範圍的不對稱基因漸滲現象：羊駝的基因漸滲率遠高於美洲駝，羊駝中高達36%的基因組成分來自於美洲駝的漸滲，而羊駝滲入到美洲駝的基因組比例僅為5%。
強大的全基因組漸滲特徵包括兩個物種的嗅覺受體複合物、羊駝的高血壓抗性、美洲駝的羊毛/纖維特徵。美洲駝的馴化基因組特徵包括雄性生殖特徵，而羊駝的馴化基因組特徵包括羊毛特徵、嗅覺相關和缺氧適應特徵。
研究指出，這應該是造成以往相關研究存在爭議的主要原因，因為線粒體DNA、微衛星或Y染色體上的分子標記無法從全基因組水平上揭示這一現象。
研究人員通過對兩個方向的滲入片段構建「重組-衰減」模型，進一步發現，漸滲發生的時間大約為500年之前，與1530年代西班牙殖民南美洲時期相吻合。
值得一提的是，羊駝和美洲駝對於安第斯地區的經濟和生活十分重要，羊駝毛可作為優質毛織品的原料，美洲駝是當地的主要馱畜之一。
來源：澎湃新聞