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科學網— 創建新型糖基化酶鹼基編輯器
本報訊(記者閆潔)中科院天津工業生物所研究員張學禮和畢昌昊帶領的團隊聯合攻關,創建出新型糖基化酶鹼基編輯器(GBE),
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新型鹼基編輯器在微生物中實現任意鹼基編輯
開發新型鹼基編輯技術實現鹼基轉換甚至任意鹼基變換,在合成生物體系構建、遺傳疾病的基因治療、生物性狀修飾等領域具有重要意義。中國科學院天津工業生物技術研究所張學禮研究員帶領的微生物代謝工程研究團隊和畢昌昊研究員帶領的合成生物技術研究團隊聯合攻關,設計構建了胞嘧啶脫氨酶-nCas9-Ung蛋白複合物,創建出新型糖基化酶鹼基編輯器(GBE),開發了可實現嘧啶和嘌呤間轉換的單鹼基基因編輯系統。基於該系統,國際上首次在微生物中實現任意鹼基編輯、在哺乳動物細胞中實現胞嘧啶(C)與鳥嘌呤(G)的特異性轉換。
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新型鹼基編輯器首次在微生物中實現任意鹼基編輯
作為基因組編輯前沿技術,無需產生DNA雙鏈斷裂,也無需供體DNA的參與,可實現靶位點的精準點突變,已成為基因編輯的重要研究方向。開發新型鹼基編輯技術實現鹼基顛換甚至任意鹼基變換,在合成生物體系構建、遺傳疾病的基因治療、生物性狀修飾等領域具有重要意義。
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新型鹼基編輯技術開發取得突破
作為基因組編輯前沿技術,鹼基編輯(BE)無需產生DNA雙鏈斷裂,也無需供體DNA的參與,可實現靶位點的精準點突變,已成為基因編輯的重要研究方向。現有鹼基編輯器只能實現嘧啶間(胞嘧啶鹼基編輯器)和嘌呤間(腺嘌呤鹼基編輯器)的鹼基轉換,尚沒有鹼基編輯器實現嘧啶與嘌呤間的特異性鹼基顛換。
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一文讀懂所有的鹼基編輯器技術!
很少有科學技術發現能像CRISPR基因編輯技術這樣,在一夜之間改變了整個生命學科領域的進程。CRISPR基因編輯技術可以說是百年不遇的顛覆性技術之一,打個比方,就相當於人類從泥板刻字的年代突然飛躍到了使用Word編輯的年代。因此,一經發現就引來全球的強勢圍觀,且研發熱度不減。
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張學禮/畢昌昊聯合團隊在新型鹼基編輯技術開發中取得重大突破
現有鹼基編輯器只能實現嘧啶間(胞嘧啶鹼基編輯器)和嘌呤間(腺嘌呤鹼基編輯器)的鹼基轉換,尚沒有鹼基編輯器實現嘧啶與嘌呤間的特異性鹼基顛換。開發新型鹼基編輯技術實現鹼基顛換甚至任意鹼基變換,在合成生物體系構建、遺傳疾病的基因治療、生物性狀修飾等領域具有重要意義。
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中科院天津工業生物所在新型鹼基編輯技術開發中取得重大突破
現有鹼基編輯器只能實現嘧啶間(胞嘧啶鹼基編輯器)和嘌呤間(腺嘌呤鹼基編輯器)的鹼基轉換,尚沒有鹼基編輯器實現嘧啶與嘌呤間的特異性鹼基顛換。開發新型鹼基編輯技術實現鹼基顛換甚至任意鹼基變換,在合成生物體系構建、遺傳疾病的基因治療、生物性狀修飾等領域具有重要意義。
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「雙劍合璧」——李大力組開發新型雙鹼基基因編輯器
該研究將人類胞嘧啶脫氨酶hAID-腺嘌呤脫氨酶-Cas9n(SpCas9 D10A突變體)融合在一起,開發了一種新型雙功能高活性鹼基編輯器-A&C-BEmax,它可以在同一等位基因的靶序列上實現C>T和A>G的高效轉換。
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新型胞嘧啶鹼基編輯器拓展C/G-T/A單鹼基編輯適用範圍研究獲進展
8月9日,《自然-通訊》雜誌在線發表了題為《多種胞苷脫氨酶為基礎擴展的C-T單鹼基編輯工具》的研究論文。該研究由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心/神經科學研究所、上海腦科學與類腦研究中心、神經科學國家重點實驗室仇子龍研究組與復旦大學中山醫院教授王小林實驗室合作完成。
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...和Science同日打擂臺發表新型DNA/RNA鹼基編輯器,可校正點突變
本周發表在Science期刊和Nature期刊上的兩項研究進一步擴大了CRISPR的使用範圍,開發出一種更加微妙的被稱作鹼基編輯(base editing)的方法來修復遺傳物質:一項研究擴展了一種編輯DNA的策略[1],而另一項研究通過對RNA進行鹼基編輯而開闢了新的領域[2]。圖片來自 C. BICKEL/SCIENCE; (DATA) D. B. T.
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Nature和Science同日打擂臺發表新型DNA/RNA鹼基編輯器,可...
CRISPR很難高效地和乾淨利落地校正這些所謂的點突變,因此鹼基突變可能提供一種更加有效的方法。在Liu的初次報導之後,中國的一個研究小組利用DNA鹼基編輯技術校正從一名患有遺傳性血液疾病的病人中克隆出的人胚胎內的一種致病性突變(參見新聞報導:Science:基因編輯療法在中國已佔先機,在癌症、遺傳病治療等領域 9 項試驗值得關注)[4]。
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新型APOBEC3G鹼基編輯器提高context特異性
CC context偏好性傳統的單鹼基編輯系統(rA1-BE)由於所用的大鼠胞嘧啶脫氨酶窗口較大,其對多個C位點的編輯精確性仍有待提高。基於人APOBEC3G(hA3G)具有天然的CCcontext偏好性,研究者將hA3G的C端催化結構域與單鹼基系統融合,構建了新型eA3G-BE鹼基編輯系統。該系統在HEK293T細胞和家兔胚胎中分別獲得了高達18.3–58.0% 和54.5–92.2%的編輯效率。
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Nat Biotech 導讀 | 雙鹼基編輯器、編輯器定向優化等
華東師範大學李大力研究組發文題為Dual base editor catalyzes both cytosine and adenine base conversions in human cells,開發了一種新型雙鹼基編輯器催化胞嘧啶和腺嘌呤鹼基在人類細胞的轉化
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Nature Biotechnology:新的CRISPR C-G DNA鹼基編輯器
新的鹼基編輯器也被設計成最低化可能導致不良副作用的意外(「偏離目標」)突變。新的CRISPR引導的DNA鹼基編輯技術旨在有效地誘導DNA鹼基的「易位」改變,同時最小化不需要的「看熱鬧的」突變水平。這篇發表在《Nature Biotechnology》的文章描述了這款名為CGBE1和一個更小的版本miniCGBE1的概念驗證,Ibrahim C.
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從同源重組到鹼基編輯器 看基因編輯72變
上海科技大學與中科院馬普計算生物學研究所的研究人員在19日出版的《自然·生物技術》發表論文稱,他們開發出一系列基於CRISPR/Cpf1(Cas12a)的新型鹼基編輯器(dCpf1-BE),理論上可對數百種引起人類疾病的基因突變進行定點矯正,因此擁有巨大的臨床應用潛力。
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張鋒升級CRISPR新系統「REPAIR」!新型鹼基編輯器精準轉換鹼基對!
知名華人學者張鋒教授的團隊在Scinece上在線發表了一篇重磅論文——帶來一款全新CRISPR系統「REPAIR」,能有效地對RNA中的腺嘌呤(A)進行單鹼基編輯。有望在不修改基因組的前提下,精準地矯正致病的遺傳突變。由麻省理工學院廣泛研究所和麻薩諸塞州劍橋的哈佛分校David Liu教授實驗室主導開發的新基因編輯系統——腺嘌呤鹼基編輯器(ABE),能將A-T鹼基對轉換為G-C鹼基對。
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中美學者各自開發新型雙鹼基編輯器,同時實現兩種單鹼基編輯
單鹼基編輯器依據 Cas9 nickase(D10A)融合不同的鹼基修飾酶,分為胞嘧啶鹼基編輯器(CBE)和腺嘌呤鹼基編輯器(ABE),可分別在實現精準的CG到TA或AT到GC 的替換,由於其高效、精準和低脫靶性,以及不依賴DNA雙鏈斷裂的優點,得到了廣泛的關注和快速發展。
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Science子刊:新型鹼基編輯器A3G-BE可將基因編輯準確度提高高達...
論文通訊作者為中國農業科學院農業基因組研究所的左二偉(Erwei Zuo)博士和萊斯大學生物分子工程師Xue Sherry Gao博士。圖片來自Science Advances, 2020, doi:10.1126/sciadv.aba1773。胞嘧啶鹼基編輯器能夠將人類基因組中的胞嘧啶(C)轉化為胸腺嘧啶(T)。人類基因組由30億個鹼基組成。
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上海科學家研發雙鹼基編輯工具助力基因治療
這四個相近成果來自國內外四個課題組(實驗室),華東師範大學生命科學學院、上海市調控生物學重點實驗室李大力和劉明耀課題組開發的基因編輯新工具A&C-BEmax,美國麻省總醫院基因編輯權威Keith Joung實驗室開發的SPACE,日本東京大學Nozomu Yachie實驗室開發的Target-ACEmax以及中國科學院遺傳與發育生物學研究所開發的STEME。
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新型鹼基編輯器橫空出世:人體細胞中效率為50%—新聞—科學網
保證DNA雙鏈不斷裂的同時,高效地替換DNA特定的鹼基——過去,這是基因編輯技術CRISPR-Cas9所無法完成的任務。如今,美國科學家已經開發出一種新型「鹼基編輯器」,使其成為可能。 由於多數遺傳病的根源在於單核苷酸突變,這一鹼基編輯器的出現,有助於人類對抗遺傳頑疾。