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今天我們來科普一下,盒形圖是什麼東東。我們在讀文章的時候經常見到盒形圖。一般來說盒形圖展示若干組值(例如不同基因家族差異表達倍數)的均值,四分位數和分布情況。利用盒形圖,可以直觀展現某組值(某轉錄組因子,某些人群)的均值和分布不同於其他值。
我們先來看看盒形圖是有哪幾部分組成的
盒形圖的計算過程:
1、計算上四分位數,中位數,下四分位數
2、計算上四分位數和下四分位數之間的差值,即四分位數差(IQR,interquartile range)
3、繪製箱線圖的上下範圍,上限為上四分位數,下限為下四分位數。在箱子內部中位數的位置繪製橫線。
4、大於上四分位數1.5倍四分位數差的值,或者小於下四分位數1.5倍四分位數差的值,劃為異常值(outliers)。
5、異常值之外,最靠近上邊緣和下邊緣的兩個值處,畫橫線,作為箱線圖的觸鬚。
6、極端異常值,即超出四分位數差3倍距離的異常值,用實心點表示;較為溫和的異常值,即處於1.5倍-3倍四分位數差之間的異常值,用空心點表示。
7、為盒形圖添加名稱,數軸等。
下面我們舉一個例子,
比如上面這張圖展示的是幾內亞豬牙齒中Vc含量變化的,圖中空心的圓點即為異常值~
盒形圖中間黑線即為中位數,中位數上方的面積越大, 表示這組數據更多的分布大於中位數~
繪製盒形圖的工具
SPSS、SigmaPlot、R,SPlus、Origin都可以繪製盒形圖~另外基迪奧將在4月中旬將推出常用圖形在線繪製工具網站,這些盒形圖都可以在我們網站實現,敬請期待咯~
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