貝殼、骨骼、牙齒等堅硬的物質形成化石很好理解，但蠕蟲、水母這類軟體的動物是如何形成化石的呢？它們為什麼既沒有腐爛也沒有被巖石壓碎呢？
化石分很多種，動物自身形成的化石叫做實體化石；動物活著的時候留下的痕跡形成的化石叫做遺蹟化石；此外還有化學化石、模鑄化石等。所以，你的問題更確切地描述應該是軟體的動物如何形成實體化石。確實，一般是比較硬的部位才能形成實體化石，不過軟體的動物在某些苛刻的條件下也是可以的。最典型的例子就是位於雲南的澄江軟體動物化石群。它們都是寒武紀時的生物。當時，海洋表面形成周期性的風暴，捲起了大量的泥沙和泥流，將海洋中的生物包裹起來，再加上迅速掩埋，使其與空氣隔絕，免遭腐爛和食腐動物的破壞；而且這種細粒的泥沙也不易毀壞生物的遺體。在後來的地質變遷中，軟泥變成了頁巖或石灰巖。而生物遺體中的有機成分逐漸水裡的礦物質填充和置換，形成與原來形狀相符合的化石形狀。這樣，這些軟體的動物就得以保存下來了。我們現在在澄江動物化石群中能看到雲南蟲、三葉蟲、水母等80多種化石。