Watanabe等研究者開發了一套評估系統,通過繩紋等位基因得分(Jomon allele score, JAS)來評估現代日本人的繩紋人混血比例,這一方法不依賴於繩紋的直接古DNA數據。研究者以【繩紋等位基因得分】檢測兩例真實的繩紋人古DNA,結果發現繩紋人樣本的確得分顯著更高,證明這一方法的可靠性。
分析結果發現,繩紋祖先與大陸東亞人之間的分化年代在1200代前,也即約30,000年前。而彌生人從東亞大陸遷徙到日本列島的年代在120到80代前,即3,000〜2,000年前。現代大陸日本人中繩紋人的總混血比例為12%,而日本列島的南北兩端人口比中部地區人口攜帶更高比例繩紋人血統信號。

參考文獻:
Yusuke Watanabe, Jun Ohashi. Comprehensive analysis of Japanese population history by detecting ancestry-marker polymorphisms without using ancestral genomic information. bioRxiv 2020.12.07.414037; doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.07.414037