PCR應用十分廣泛,並且可通過菌液PcR進行重組克隆的快速篩選。基本方法是從抗性平板上挑取單菌落接種至250μL的LB培養基中,200r/min振蕩培養8h以後,取1μL菌液進行裂解製備模板進行PCR篩選。
(三)核酸雜交篩選法
核酸雜交又叫分子雜交(molecular hybridization), 是鑑定和篩選重組體的一種方法。原理是:兩條具有鹼基互補序列的DNA分子變性後,在溶液中-起進行復性時,可以形成雜種雙鏈DNA分子。同樣,- 條DNA鏈與之具有互補鹼基序列的RNA鏈在一起復性時, 也能形成雙鏈結構(DNA- RNA雜交體)。雜交包括下列過程:①DNA的「熔解」,即變性,目的是使雙螺旋解開成為單鏈,這可將DNA溶液的溫度升高超過Tm值(解鏈溫度)即可:②退火,即DNA的復性,將加熱過的DNA溶液緩慢冷卻即可發生。
雜交的雙方是待測的核苷酸序列及探針。待測核酸序列可以是克隆的基因片段,也可以是未經克隆的基因組DNA或是細胞總RNA。核酸雜交方法的兩個特點是高度特異性及高度靈敏性。
1.菌落雜交
在大量篩選重組的細菌細胞時,需要從中尋找出為數極少的含有目的序列的細胞。另外.在利用插入失活、顯色反應等手段得到含重組質粒的細菌細胞後,還需要證明這些重組質粒是否含所需要的目的序列。若將所得菌落逐個擴大培養,提取質粒DNA,然後用Southern雜交法固然可以鑑定重組質粒。