基礎研究 | 我區省部共建國家重點實驗室取得最新科研成果：開發分析RNA端帽表觀轉錄組新方法並發現了新端帽

2020-09-21 創新內蒙古

近日，省部共建草原家畜生殖調控與繁育國家重點實驗室王進研究員課題組與麻省理工學院Peter Dedon研究組聯合在國際頂級期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上發表了題為「定量分析RNA 端帽（cap）表觀轉錄組揭示了細胞和病毒RNA中的新端帽」（Quantifying the RNA cap epitranscriptome reveals novel caps in cellular and viral RNA）的最新科研成果。該研究成果開發了能靈敏而準確地定量分析5』端帽表觀轉錄組的新方法− CapQuant。該方法結合離線HPLC富集、同位素稀釋和LC-MS/MS分析，能夠準確、特異而靈敏地量化所有類型的RNA端帽結構。

此項研究還聯合了新加坡南洋理工大學、新加坡癌症科學研究所（CSI）、新加坡國立大學、德克薩斯大學醫學分校、聖路易斯大學、康奈爾大學和麻省理工學院的科研人員，並得到新加坡國立研究基金會、內蒙古大學「駿馬計劃」高層次人才科研啟動金、美國國立衛生研究院（ES022858，CA186702）以及南洋理工大學校長研究生獎學金等項目的支持。

該科研團隊開發了能夠準確、靈敏地量化生物體內的RNA端帽表觀轉錄組的RNA 5』端帽分析的新方法－CapQuant，實現了阿摩爾水平（低至600納克RNA）以上廣闊的動態響應範圍內端帽分析的高覆蓋和絕對定量。

科研團隊通過定量分析人類細胞、細菌、酵母、老鼠組織及病毒等樣本的26種不同端帽結構，成功檢測到了其中14種不同的端帽結構，並且在人類細胞和老鼠組織中首次發現了4種新端帽結構(m7Gpppm6A、FAD、UDP-Glc、UDP-GlcNAc)，揭示RNA端帽甲基化修飾的組織特異性。

同時，科研團隊還首次發現哺乳動物和登革熱病毒中均存在佔比高的不含2』-O甲基化的端帽（m7Gpppm6A或m7GpppA），這表明可能在特定細胞環境中2』-O甲基化不是抑制先天宿主抗病毒應答所必需的。該研究還揭示CapQuant技術還可用來分析轉錄起始位點，並初步探討了端帽圖譜的調控機制。

論文連結：

https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz751/5558129?guestAccessKey=dd94f991-9ad2-4fb4-9ab2-be3bdd0fc52a

（基礎研究處 內蒙古大學宣傳處）

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