研究首次對新冠病毒6大毒株進行跟蹤分析：G株佔主導，L型和V型正在逐漸消失

科學家們目前已經從新冠病毒中分離出至少6個不同的毒株。他們表示，儘管病毒發生了變異，但幾乎沒有變化，這對正在研製可行疫苗的研究人員來說是個好消息。

這些是對新冠病毒測序進行的最廣泛的研究的結果。博洛尼亞大學（the University of Bologna）的研究人員對48,635個病毒基因組進行了分析，這些基因組是由世界各地實驗室的研究人員分離出來的。這項研究發表在《微生物學前沿》（Frontiers in Microbiology）雜誌上，題為「Geographic and Genomic Distribution of SARS-CoV-2 Mutations」。

在這些基礎上，研究人員就有可能繪製出病毒傳播到各大洲期間發生的傳播和變異。初步結果令人鼓舞：新冠病毒幾乎沒有變化，每個樣本大約有7個突變。普通流感的變異性率則達到了新冠病毒變異率的兩倍多。

「新冠病毒可能已經優化到可以影響人類，這就解釋了它的低進化變化，」尤尼博研究員、這項研究的協調員費德裡科·喬吉(Federico Giorgi)解釋說：「這意味著我們正在開發的治療方法——包括疫苗，可能對所有的病毒毒株都有效。」

目前，新冠病毒共有六種毒株。最早的是L型菌株，於2019年12月在武漢出現。它的第一個突變株S株出現在2020年初。而從2020年1月中旬開始，我們已經有了V株和G株。到目前為止，G株是最廣泛的：它在2020年2月底突變為GR株和GH株。

「到目前為止，G株及其相關的GR和GH株傳播最廣，佔我們分析的所有基因序列的74%，」Giorgi說。「他們出現了四種突變，其中兩種能夠改變病毒的RNA聚合酶和刺突蛋白的序列。這一特徵可能促進了病毒的傳播。」

如果我們看看冠狀病毒分布圖，就會發現菌株G和GR在歐洲和義大利最常見。根據現有的數據，生長突變在義大利幾乎不存在，而在法國和德國出現的頻率更高。這似乎證實了上個月採取的控制措施的有效性。

在北美，最廣泛的毒株是GH；而在南美洲，GR毒株更常見。在武漢L菌株最初出現的亞洲地區，G、GH和GR的傳播呈上升趨勢。這些病毒在歐洲傳播一個多月後，於3月初才登陸亞洲。

從全球範圍來看，菌株G、GH和GR不斷增加。在美國和西班牙的一些限制地區可以發現S菌株。而L型和V型菌株正在逐漸消失。

除了這6種主要的新冠病毒毒株之外，研究人員還發現了一些不常見的突變，這些突變目前並不令人擔憂，但仍應加以監測。

具體而言，在測序完整病毒基因組數量最高的前40個國家中（圖1C），與世界平均水平相比，以下國家的每個樣本中觀察到的突變數量略有但明顯更高：印度（8.40），剛果（8.30），孟加拉國（9.83）和哈薩克斯坦（9.47）。另一方面，來自以下國家或地區的序列顯示出較低的突變負擔：德國（6.09），日本（4.55），義大利（5.92），希臘（5.91），中國香港（5.00）和肯亞（5.38）。必須注意的一點是，一些抽樣偏差可能會影響這一比較：例如，一些國家在大流行的早期階段產生了最高數量的序列（如義大利），因此可能只觀察到了較少的突變。

圖1：（A）所有SARS-CoV-2基因組樣本的突變事件數量分布。（B）每個樣本的突變數分布，按大陸劃分。（C）標誌了在全國範圍內進行分層，使用40個測序基因組最多的國家。

「罕見的基因組突變不到全部測序基因組的1%，」Giorgi證實。「然而，我們對它們進行研究和分析是最基本的，這樣我們就可以確定它們的功能並監測它們的傳播。所有國家都應該通過提供有關病毒基因組序列的數據，為這一領域做出貢獻。」

編譯/前瞻經濟學人APP資訊組

參考來源：https://scitechdaily.com/the-six-strains-of-sars-cov-2-despite-its-mutations-the-virus-shows-little-variability/

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2020.01800/full