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stacks基礎:SNP、基因座、等位基因、基因型、單倍型的概念
相關系列第一期請戳:stacks拆包RAD-seq過程中 process_radtags沒有自己需要的限制性內切酶怎麼辦?在stacks運行完畢後,會有*.alleles.tsv.gz, *.snp.tsv.gz, *.matchs.tsv.gz等結果文件生成,如果對SNP、基因座(locus)、等位基因(alleles)、基因型(genotype)和單倍型(haplotypes)的概念沒有深刻的理解的話,要讀懂這些結果文件是非常困難的,本文將以解析這些概念為切入點
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民國生物教科書中「基因」概念的演變
Mendel)在1865年所揭示的兩個遺傳學的基本定律——分離定律和自由組合定律被重新提出並得到了廣泛認可。孟德爾認為遺傳的單位是遺傳因子,生物的性狀是由遺傳因子控制的。孟德爾所說的遺傳因子就是現代遺傳學中「基因」的雛形。1909年,約翰森(W.L.
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等位基因介紹
遺傳方式和公式可以參考公眾號裡的基因介紹貼,裡有詳細介紹。關於基因和染色體應該都理解了吧,那麼接下來就講一下複合基因和等位基因。而等位基因,就是兩條蛇的染色體是在同一對染色體產生變異,就比如你和一個人上樓梯,你在第三個臺階站住,他也在第三個臺階站住,這樣說能理解吧,所以兩個基因組合後並不是疊加,可以理解為融合,重組後的基因可以說它是雙基因也可以說是單基因,因為是同一條染色體變異融合,並不是疊加成為兩條染色體變異,並且每個品系會表現出一半,Ultramel的書寫方式直接可以寫成ab,一半一半,這也是為什麼叫做Het
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CNV解讀-CNV基本概念
主要分享CNV的基本概念,CNV分類,致病類型,變異產生機制和常用檢測平臺等。 CNV是基因組拷貝數變異(Copy Number Variants)的簡稱,是基因組結構變異(structural variation)中最常見的變異類型,是人類遺傳病產生的一大重要原因。
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等位基因在我們體內扮演了什麼角色?!
等位基因等位基因(英語:allele),是染色體內的基因座的可以複製的DNA序列,其在細胞有絲分裂時的染色體上的兩個基因座是對應排列的,故在早期細胞遺傳學裡稱其為等位。等位基因一個生物體裡,某個基因的基因型是由該基因所擁有的一對等位基因所決定。例如在人和其他二倍體生物,也就是每條染色體都有兩套的生物,其等位基因的兩個位點決定了該基因的基因型。等位基因兩個位點來自父輩和母輩的遺傳,其基因型決定了生物的表現型。 生物的表現型由一對等位基因的一個位點決定的,稱顯性基因;而由兩個位點決定的,則稱為隱性基因。
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表觀遺傳學:後基因組時代的領舞者
參加此次雙清論壇的專家之一,清華大學醫學院表觀遺傳學與癌症研究所、教育部長江學者特聘教授孫方霖接受了《科學時報》的專訪,首次通過媒體介紹了表觀遺傳學研究在國內外的現狀和該學科令人激動的無限前景。 《科學時報》:表觀遺傳學作為生命科學研究中一個比較新的研究領域,它的概念和研究範疇應該如何界定?
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遺傳學第二定律——自由組合定律
一提到遺傳學定律,我們首先想到的一位偉大的科學家。格雷戈爾 孟德爾(1822-1884)(Gregor Johann Mendel),奧地利生物學家,在修道院擔任神父,是遺傳學的奠基人,被人們稱為「現代遺傳學之父」。他通過豌豆實驗,於1865年發現了震驚世界的遺傳學三大基本規律中的兩個,分別為分離規律和自由組合規律。
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HLA等位基因特異性表達動態變化
HLA等位基因特異性表達動態變化 作者:小柯機器人 發布時間:2020/2/21 16:26:41 美國哈佛醫學院Soumya Raychaudhuri
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顛覆生物學經典概念:遺傳不僅僅靠基因
在經典遺傳學中,「基因型」(個體攜帶並可傳遞給後代的一組基因)和「表型」(生物體短暫擁有的環境和經驗印記,但這些特徵無法傳遞給後代)之間有著根本區別。在經典遺傳學中,「基因型」(個體攜帶並可傳遞給後代的一組基因)和「表型」(生物體短暫擁有的環境和經驗印記,但這些特徵無法傳遞給後代)之間有著根本區別。
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色彩系列教程(2):色系和色調
首頁 > 教程 > 關鍵詞 > 最新資訊 > 正文 色彩系列教程(2):色系和色調
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科技日曆|他是現代遺傳學奠基人 生前默默無聞,逝世16年後才享譽全球
科技日曆|他是現代遺傳學奠基人 生前默默無聞,逝世16年後才享譽全球 olivia chan • 2020-01-06
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高中生物易錯概念辨析(全文)
高中生物學當中有一些很接近的概念,或者是很容易混淆的概念,將比較常見和容易出錯的概念辨析如下:
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等位基因只存在於同源染色體上嗎?核基因在染色體的存在位置的幾個誤區
在染色體的結構變異中,有時會導致相同基因、等位基因、非等位基因的位置發生變化。其中相同基因、等位基因、非等位基因在染色體上位置關係是理解遺傳學定律、染色體結構變異的關鍵所在。在教學中發現,老師和學生在理解有關這方面的知識上有明顯的幾個誤區。
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現代遺傳學之父——孟德爾 1865年3月8 日
為了解釋這一發現,孟德爾引入了兩個重要的概念,即「隱性因子」和「顯性因子」。經他統計,有「純隱性」表現的概率是 1/4,2/4 是「混合性」,而另 1/4 則表現「純顯性」。經過近 10 年的系列實驗,孟德爾得到了遺傳學的兩個重要的定律,即分離定律和自由組合定律,後人把這兩個定律稱為孟德爾遺傳學定律。
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基因晶片概念 基因晶片概念解析
基因晶片概念解析 基因晶片(又稱DNA晶片、生物晶片)的原型是80年代中期提出的。基因晶片的測序原理是雜交測序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探針。
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影探| Harry Potter裡的遺傳學①
Rowling)於1997-2007年創作的7部《哈利·波特》(Harry Potter)系列小說,也參考了美國華納兄弟電影公司根據這7部小說改編的8部電影,還有部分例子來源於羅琳擔任編劇創作的《神奇動物在哪裡》(Fantastic Beasts and Where to Find Them)系列電影。
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【說人話系列3】基因藝術:CAR-T概念、原理及應用
PD-1簡析暨經典研報、文獻免費贈送》中,我們簡單介紹了PD-1的概念及原理,並談到了腫瘤免疫療法。所謂腫瘤免疫療法,是指利用機體自身的免疫功能,來殺傷和清除腫瘤細胞。本期文章中,我們將帶領大家探索另外一種新型腫瘤免疫療法:CAR-T療法。
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隱性基因嗎?巫師的後代會性狀分離嗎?
他認為,魔法能力是由隱性基因控制和遺傳的(JM. Craig et al, 2005)。根據孟德爾遺傳規律,一種遺傳性狀由一對「等位基因」來控制。等位基因有顯性和隱性之分。在魔法基因問題上,克雷格認為「巫師」等位基因(記作W)是隱性的;「麻瓜」等位基因(記作M)是顯性的。
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《侏羅紀世界2》概念設計圖
在2015年,《侏羅紀公園》系列「重啟版」《侏羅紀世界》上映後,叫好叫座,全球票房達16.7億美元,高居影史第五。登陸中國內地後同樣席捲票房,斬獲14.2億人民幣,位居年度外片票房季軍。2018年也適逢《侏羅紀公園》誕生25周年。這次的《侏羅紀世界2》提早登入內地可謂是來勢洶洶啊!
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《我上遺傳學》系列之十一:基因組印記
(1)賀竹梅.現代遺傳學教程-從基因到表型的剖析(第3版),高等教育出版社,2017.(2)楊文志,張萃,王冠楠,李冬傑,李世傑.基因組印記中的長非編碼RNA.生物化學與生物物理進展,2016,43(5):461-471.(3)陳秀莉,馬利兵.哺乳動物基因組印記的研究進展.生物技術通報,2015, 31(1): 46-50.