屋久島是位於日本九州大隅半島南方60公裡的一個島嶼，位於鹿兒島南邊，鄰近的島是種子島，與鹿兒島中間則有大隅海峽，與種子島和口永良部島同屬大隅群島。島上約有14000位居民，行政區劃屬於鹿兒島縣熊毛郡屋久島町。
屋久島位於北緯30度。島的形狀很完整，屬於圓菱形。是一個多山之島，山地佔有整島約75%，平均高度超過1000米。屋久島山構成中九州山脈的一部分，最高點宮之浦嶽海拔為1935米，高過九州境內的其他山脈，是日本南部最高的山脈，另有幾個山峰超過1800米，自海濱到山巔的地勢非常陡峭，巖床巨大，較小的沙石和頁巖在山腳也可見到。
1000米以上山峰有30多處，從濱海到山顛垂直分布著從亞熱帶到亞寒帶的各種各樣的植被。氣候上，屋久島是以日本降雨最多的地方聞名，當地有一句俗語「一個月下35天的雨」，在日本降雨紀錄上，屋久島一天的降雨量曾與北海道全年的降雨量相同。
並非整個屋久島都屬於世界遺產範圍，而是中央的宮之浦嶽和西邊的神木林區（1000年以上）共約107.47平方公裡地區被列入世界遺產範圍。世界遺產區佔地10747畝，屋久島野生保護區佔地1219畝，森林生態區佔地14600畝。該區海拔從海平面到935米不等。植被與大陸截然不同，垂直分布明顯，亞熱帶植物頒在海邊，溫帶、中溫帶、寒溫帶和亞苔原帶的隨地勢上升而依次分布。
屋久島森林生態保護系統、自然和生態保護區與九州島的南端以一條寬60公裡、深120米的海峽隔開。此地邊界曲折、複雜，有些地區只有1公裡寬。保護區位於島的中央，向東、西、南三個方向伸展，其中西面延伸至海。屋久島國家公園據國家公園法於1964年成立，1975年野生保護區據自然保護法成立。
與島嶼的面積相比，這裡的植物物種顯得格外豐富，約有1900個種和亞種分布於此，94種是本地特有的，200多種植物是處於其分布地域的最南界；該區動物多種多樣，有16種哺乳動物，4個亞種是此地特有的。