1.已開發票作廢
（1）點擊「發票管理/發票作廢」模塊，系統彈出「選擇發票號碼作廢」窗口；
（2）選中需要作廢發票信息後，點擊「作廢」按鈕；系統會彈出發票作廢確認提示框；在作廢確認提示框中點擊「確認」後，出現作廢成功提示。
注意：
①已經抄稅的發票不能作廢，只能填開負數發票衝銷。
②發票作廢狀態記入金稅盤，無法恢復到作廢前狀態。
③誰開的發票誰作廢，管理員身份可以作廢其他操作員開具的發票。
2.未開發票作廢
（1）點擊「發票管理/發票管理/未開發票作廢」選擇需要作廢的發票種類；
（2）在「未開發票號作廢，發票號碼確認」頁面輸入需要作廢發票份數，點擊【確定】按鈕。
注意：
①未開發票作廢需徵得稅局同意，有的主管分局不允許企業進行未開發票作廢；
②系統自動給出的發票號碼是金稅盤中待開的同種類發票的當前號碼，無法選擇；
③為避免誤操作建議注意查看當前作廢的發票種類和發票號碼；
④作廢成功的發票在已開發票查詢中能查詢到，其金額稅額值顯示為零。
⑤已經作廢的發票不能取消作廢。
3.增值稅普通發票衝紅方法
點擊發票管理-發票填開-增值稅普通發票填開，選擇「紅字」輸入需要衝紅的藍字發票的代碼和號碼，自動帶出與藍字發票一致的信息，核實無誤後列印，此操作需要佔用一張紙質發票。
4.增值稅電子普通發票衝紅方法
點擊發票管理-發票填開-增值稅電子普通發票填開，選擇「紅字」輸入需要衝紅的藍字發票的代碼和號碼，自動帶出與藍字發票一致的信息，核實無誤後列印，此操作需要佔用一張紙質發票。
5.增值稅專用發票衝紅方法
（1）點擊「發票管理/紅字發票信息表/紅字增值稅專用發票信息表填開」；
（2）根據實際情況選擇「銷售方申請或購方申請」，（未認證由銷方申請，已認證由購方申請）將需要紅衝的藍字發票代碼、號碼進行填寫（已認證購方無需填寫），再點擊「下一步；
（3）彈出的對應藍字發票信息，核對無誤後點擊「列印」按鈕，系統自動保存此張紅字發票信息表，並彈出列印界面，點擊「不列印」，彈出的提示框再次點擊「取消」按鈕；（購方申請需手動填寫發票信息）
（4）點擊「發票管理/紅字發票信息表/紅字增值稅專用發票信息表查詢導出」，選中需要上傳的信息表，點擊「上傳」，上傳完畢後，可看到該條紅字發票信息表的信息表描述已更新為「審核通過」；
（5）點擊「發票管理/發票填開/增值稅專用發票填開」，打開一張專用發票；
（6）在專用發票填開界面中，點擊「紅字/導入網絡下載紅字發票信息表」；
（7）查看上傳並審核通過的信息表，選中該信息後點擊「選擇」按鈕，核對信息無誤後點擊「列印」按鈕，並且用對應的紙質發票列印出來即可。
6.成品油增值稅專用發票衝紅方法
成品油管理模塊，點擊「信息表/紅字增值稅專用發票信息表」。彈出紅字增值稅專用發票信息表信息選擇窗口，進行成品油專用發票信息選擇。
（1）成品油專用發票信息選擇中選擇「涉及銷售數量變更（銷售退回、開票有誤等原因）」單位和數量必填；
（2）成品油專用發票信息選擇「僅涉及銷售金額變更（銷售折讓）」系統屏蔽單位、數量和單價的錄入功能。選擇銷方申請還是購方申請（未認證由銷方申請，已認證由購方申請），信息表填寫後上傳審核。開具負數發票時：開具成品油紅字增值稅專用發票時，只能通過「導入網絡下載紅字發票信息表」的方式進行開具。不支持自行錄入紅字發票信息表方式開具紅字發票。系統提取信息表信息到填開票面，並且不允許修改。