新冠病毒的來源：由蝙蝠和穿山甲的病毒重組而來

2020-08-27 李雷博士

近日，國際頂級期刊《Nature》發表了一篇題為Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins的研究論文。文章指出新冠病毒的中間宿主是穿山甲可能性較大。

文章的團隊是之前介紹過的華南農業大學的沈永義團隊，他們曾經開發布會指出新冠病毒可能來自穿山甲，並發表了相關論文

如何評價鍾南山稱「疫情首先出現在中國，不一定發源在中國」？​www.zhihu.com

在這次研究中，從馬來穿山甲中分離出的一種冠狀病毒，該病毒的E，M，N和S基因中與SARS-CoV-2的胺基酸相似性分別是100％，98.6％，97.8％和90.7％

比較有意思的是，基因組序列和胺基酸序列之間的相似度有時候還存在相左的結果。

比如，對於S蛋白，如果是看基因組序列的話，蝙蝠的RaTG13比新冠的WHCV相似度更高（88.5% vs 84.5%），但是如果看胺基酸序列的話，蝙蝠的RaTG13比新冠的WHCV相似度要低（89.8% vs 90.7%）。

而最為關鍵的是，對於新冠病毒最核心的S蛋白受體結構域來說，胺基酸角度上，新冠和穿山甲病毒只有1個不重要的胺基酸差異。

同樣，用比較基因組來研究，發現，新冠病毒可能是穿山甲病毒和蝙蝠病毒的重組。

Further comparative analysis of the S gene sequences suggests that there were recombination events among some of the SARSr-CoV analyzed.

在新冠s基因的1-914位置，穿山甲的病毒和蝙蝠病毒相似度高（Bat SARSr-CoV ZXC21 and Bat SARSr-CoV ZC45），而在其他位置，穿山甲的病毒和新冠相似性更高（SARS-CoV-2 and Bat-CoV-RaTG13）

如上圖所示，左側的灰色區域和右邊的橙色區域，明顯可以看出比對率的差異，左右是反過來了。

換個圖，從進化角度也可以看出

而出現這種交叉的情況，很大可能是發生了基因重組，也就是說，新冠病毒可能是來自於蝙蝠病毒和穿山甲病毒的重組（說明，不一定是現在那個病毒，嚴謹的說，叫做類似病毒，因為我們看到的其實已經是進化後的結果了， recombination of a Pangolin-CoV-like virus with a Bat-CoV-RaTG13-like virus ）

當然了，文中還有組織檢測實驗，證實穿山甲病毒可以引發感染症狀。

—————保護穿山甲—————

這次發現攜帶病毒的是馬來穿山甲，是一種哺乳動物，下圖是它的分類

下圖黃色區域是馬來穿山甲的生活地方，他們被走私後進入了中國，最後到了武漢。

為什麼要走私呢？因為中華穿山甲被人們幹的瀕危了，屬於國際保護上的極危動物，幾乎就要野外徹底滅絕了（CR，Critically Endangered表示該物種所面對的威脅及危機等級為極高，是僅次於滅絕及野外滅絕的評級）。

滅絕原因中，藥用是一個重要的部分

但是，這裡有個問題難以解釋，就是，為什麼沿途沒有爆發，到了武漢爆發了呢？

而從這個病毒的序列和武漢病毒的一些差別來看，極有可能是，它們在武漢那個地方發生了變異。這也是為什麼我們看到武漢病毒擴散的時候有個mv1

不管如何，個人覺得，對於穿山甲，是時候整理一下我們的看法了，該不該吃？

———為什麼要尋找中間宿主———

如果我們無法找到中間宿主，那麼這意味著潛在的風險仍然存在，說不定在某個地方還存在感染病毒的中間宿主，隨時可能來一次引爆，因此必須尋找中間宿主。

當然，為什麼判定有中間宿主，主要是因為病毒直接從蝙蝠到人身上，那難度太高了，畢竟相差太遠，病毒感染也為難，且序列存在較大差異。一定有個中間宿主在發揮作用，讓整個病毒在中間宿主上繼續發生進化，直到其更容易感染人類。事實上，中間宿主是蝙蝠感染的常見歷史，SARS，MERS都是蝙蝠通過中間宿主感染了人

所以這次大家也紛紛尋找新型冠狀病毒的中間宿主。而從目前的研究來看，穿山甲是中間宿主的可能性較大，這提示我們要對穿山甲本身加強管理，無論是走私還是藥用等。​

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