生物信息分析系統 ≠ 硬體+軟體堆砌

2020-12-04 榮聯科技集團

還在手動的將數據在不同的存儲中存來存去?

海量數據中查找某數據耗時耗力?

分析數據過程中內存超配,機器宕機?

......

如果上述問題還在佔用您的時間和精力,說明您的生物信息分析系統亟待更新完善。一個好的生物信息分析系統,可以解放您的雙手,您只需專注科學研究,其他問題交由生物信息分析系統來做。

生物信息分析系統並不是簡單的硬體存儲加上分析軟體的堆疊,而是為滿足生物信息分析對於速度、規模和智能化等苛刻需求建立的一體化解決方案。榮之聯為生物信息專門設計了自底向上的完整的數據系統——榮之聯BioStack私有雲,可一次性解決生物信息數據的存儲、數據管理、分析計算和特徵數據挖掘。是高度垂直的、全棧的、更專業的生物信息分析系統。

- 存管算察 四位一體 -

數據儲—理解生物信息應用,極致性能優化;

隨著分析算法和工具的不斷豐富,不同分析階段訪問數據的模式也越來越多樣化,對於存儲的帶寬、IOPS 和延遲等性能指標都有不同的需求,所以無法通過單的存儲系統來解決生物信息分析面對的所有問題。針對不同的需求我們推出多套不同存儲系統組合在一起來解決生物信息不同分析模式要求的帶寬和IOPS的性能。

不同存儲系統組合出擊

Alamo-D:針對高帶寬應用場景;Annapurna:針對高IO、低延遲應用場景;Alamo:針對冷數據存儲需求。

感知應用

存儲系統感知應用特徵,調度合適的存儲資源。

感知數據

存儲系統具備數據感知能力。

數據理—數據感知,秒級反饋;

管理系統能夠感知數據特徵,解決數據複雜性問題。

數據發現

海量數據中實現秒級數據查找。

數據溯源

幫助用戶構建整個數據的族源關係,例如可追溯VCF文件的基因文件來源以及分析流程中工具版本等。

數據多維有序

幫助客戶多維度理解、分析數據。可幫助管理員查找空間使用最大的用戶、重複冗餘的數據等。

數據重組

無需手動將有關聯的數據複製到同一目錄,通過數據重組可以得到一個具有相同特徵的數據集,作為大規模生物信息分析計算的輸入。

數據—分布式調度、應用感知融合多計算框架;

按需動態構建計算框架,簡化流程編排,靈活高效的組織生物信息分析流程、調度生物信息作業 。

流程編寫簡單

流程編寫難度較比傳統SGE、LSF的方式難度大大降低。

應用感知,智能調度

可以感知應用的IO類型,不僅可以調度計算資源,也可以將數據調度到合適的存儲位置上。

靈活省心

將程序(工具)封裝進Docker,規避軟體版本依賴關係和衝突的問題。

融合多計算框架

動態構建批量計算、Spark等多種計算集群。

突破集群規模瓶頸

分布式計算環境,多集群統一調度,多調度器之間相互協作,規模無限。

數據—數據可視化,基因分析更直觀。

根據多維度數據特徵,利用網絡可視化算法和工具,通過對可視化數據特徵之間的關係進行關聯,定性指導生物信息,基因分析的研究方向。

基因分析解讀

基因組注釋解讀軟體,用於解讀人類基因變異;支持30+常用生物醫藥資料庫,整合生物醫藥資料庫>200GB;變異解讀引擎可以隨時動態開關不同的解讀功能,深度挖掘變異結果所包含的意義。

基因組瀏覽器

高性能基因組瀏覽器軟體用於對多個基因組的基因數據進行可視化處理;多重定製的視窗角度去挖掘變異數據;網頁式運行模式,多平臺支持,無需額外安裝。

榮之聯BioStack私有雲可貼合醫學檢驗所、測序公司、科研機構等用戶需求進行定製化部署。既可滿足日常計算、存儲需求,也可實現平臺級全流程搭建(含IDC)。

- 按需部署 各節點打通 -

相關焦點

  • 硬體會議系統與軟體會議系統的區別是什麼
    那麼在選擇視頻會議系統時,應該選軟體還是硬體呢? 相比較硬體視頻會議系統,它的市場進入門檻相對較低,軟體視頻會議系統因為在硬體設備上投入少,維護量小,而使其成為「物美價廉」的解決方案。但傳統軟體視頻會議系統音頻一直飽受詬病,存在失真、回音等問題。
  • 基因組所生物信息高性能計算機投入使用
    2009年2月下旬,基因組所生物信息高性能計算機到位,經過緊張的安裝調試,已正式投入使用。這次選用的浪潮伺服器,屬於國產自主品牌高性能計算系統,其運算分析能力達到每秒10萬億次,數據存儲能力達到400TB,隨著高性能計算系統的投入使用,加之2008年,3臺SOLiDTM系統基因分析儀的安裝運行,基因組所在硬體環境系統實施了更新換代,全力搭建的基因組測序和生物信息處理平臺初步完成。
  • APP軟體開發與系統開發的區別
    APP軟體開發與系統開發有什麼區別?APP軟體開發是根據用戶要求建造出軟體系統或者系統中的軟體部分的過程。軟體開發是一項包括需求捕捉、需求分析、設計、實現和測試的系統工程。軟體一般是用某種程序設計語言來實現的。通常採用軟體開發工具可以進行開發。
  • 電子工程師:做硬體、軟體哪個好?
    本人從事電子工程師工作已有七八年,設計硬體也編寫過軟體,包括單片機、DSP、ARM等系統軟體編寫,以及HIM人機互動軟體。本人嘗試分析一下這個問題吧。其實,以目前來看,做硬體和軟體都非常有前途的,硬體更需要專業的理論知識和經驗積累相結合,入門較難,需要掌握的知識較多,不單需要電路、模電、數電等理論知識,還需要掌握結構、工藝、元器件的參數性能、材料、廠家、標準、線路等知識,很多都需要多年的經驗積累,一個優秀的硬體工程師可以為公司節約很多成本,包括設計成本、時間成本等,在市場上也很搶手。
  • 強大的防盜定位追蹤系統方案,硬體原理、結構框圖、軟體流程、源碼...
    系統實施原則的確立將對系統的軟體、硬體和無線通信作方法起到指導作用。考慮到以上眾多因素,本方案設計原則可扼要概括為:完備性、普適性、開放性、容錯性、可靠性、安全性、經濟性七大原則。2.1.7 經濟性系統設計應充分考慮實際投產成本,力求少花錢、多辦事,能通過成本較低的軟體方案解決的不應通過加大硬體投入解決,對現有投資考慮最大可能的保護。
  • 視覺檢測系統硬體設計方案解析
    AOI,也稱為自動視覺檢測,是基於光學原理,綜合採用圖像分析、計算機和自動控制等多種技術,對生產中遇到的缺陷進行檢測和處理,是較新的確認製造缺陷的方法。AOI系統按技術劃分為精密機械、電氣控制、視覺系統、軟體系統4大部分組成,其核心是一套基於CMOS或CCD的圖像採集系統、交流伺服控制x、y工作檯及圖像處理軟體系統。
  • 生物信息百Jia軟體(十三):clustalw
    是一款需要掌握的生物信息工具。一、功能分類: 多序列比對二、軟體官網: http://www.clustal.org/clustal2/三、軟體介紹: Clustal 系列軟體廣泛用於分子生物學的研究中。涉及的核酸、蛋白質的全局多序列比對,為進一步構建分子進化樹等進化分析提供了基礎。
  • 華大科技生物信息培訓班RNA分析專題(山東 · 泰安)
    例如為一些疾病提供新的診斷、治療方法;為農業重要物種提供新的育種、改良方法……本課程將從圍繞RNA分析為您介紹最前沿的生物信息研究方法、實驗技術原理、數據分析軟體、作圖軟體等,為您解析近年來發表的經典文獻,在科研道路上竭力為您提供更多思路與策略!
  • Bootloader中LCD硬體初始化和軟體驅動程序設計
    Bootloader中LCD硬體初始化和軟體驅動程序設計 鄧佳佳 發表於 2018-03-07 14:05:06 前言
  • 計算機信息系統安全專用產品分類原則
    3.2 計算機信息系統安全專用產品 Security Products for Computer Information Systems是指用於保護計算機信息系統安全的專用硬體和軟體產品。
  • RFID射頻讀寫器軟硬體系統設計
    在RFID系統中,射頻讀寫器是識別標籤後將採集信息送人後臺信息處理系統的關鍵設備,對保證RFID系統的可靠工作具有重要作用。本文將以Philips公司的MF RC500晶片為核心設計一種以AT-MEGA162 MCU為控制器的RFID射頻讀寫器。它能完成對Mifare one卡所有讀寫及控制的操作,並且還可以方便地嵌人到其他系統(如門禁、收費)中,成為用戶系統的一部分。
  • 序列比對綜合分析軟體
    ProSeq 3.5PROcessor of SEQuences的縮寫,是一個核酸序列編輯與種群遺傳學分析軟體。SMS 2為Sequence Manipulation Suite的縮寫,是DNA與蛋白序列分析與格式化在線工具的集合。Staden 2.0.0b9Staden軟體包是UNIX系統下的非常有名的綜合序列裝配、編輯、分析軟體包,此為最新開發的WINDOWS版。
  • AMAN系統終端完成硬體更新
    中國民用航空網通訊員 鄭旭楊 報導:近日,中南空管局通信網絡中心區管通信樞紐室完成了區管管制二樓大廳5臺AMAN系統終端硬體更新升級工作,為管制用戶提供性能更為優越的硬體平臺,有利於管制中心終端室AMAN系統試運行工作的順利開展。   此次終端更新,是在充分收集用戶意見和深入調查的基礎上進行的。
  • 一文看懂硬體環境和軟體環境是什麼
    什麼是硬體   一個完整的電腦系統包括硬體和軟體兩部分。顧名思義,硬體,就是電腦中那些看得見摸得著的實物設備,如主機、顯示器。而軟體則是相對硬體所說的,它是指電腦上運行所需的各種程序及其有關的文檔材料,如一個繪圖軟體或者一個五子棋小遊戲。電腦的硬體和軟體缺一不可。硬體是軟體能夠工作的物質基礎,是「身體」;而軟體是電腦的靈魂,是控制和操作電腦的核心。它們相輔相成,共同構成完整的電腦系統。從外觀上看,電腦包括:顯示器、主機、鍵盤、滑鼠和音箱。
  • 生物信息學相關網站
    研究領域主要涵蓋序列分析,蛋白質組學和基因組學等。該網站提供了資料庫,電子論壇,教育,新聞,軟體,招聘啟事等。該網站還提供了相關連結,包括歐洲分子生物學以色列國家網點,以色列國家基因組基礎設施實驗室以及國際生物信息學合作中心。
  • 軟體看門狗和硬體看門狗的作用和區別
    工作原理:在系統運行以後也就啟動了看門狗的計數器,看門狗就開始自動計數,如果到了一定的時間還不去清看門狗,那麼看門狗計數器就會溢出從而引起看門狗中斷,造成系統復位。所以在使用有看門狗的晶片時要注意清看門狗。  硬體看門狗是利用了一個定時器,來監控主程序的運行,也就是說在主程序的運行過程中,我們要在定時時間到之前對定時器進行復位如果出現死循環,或者說PC指針不能回來。
  • MIT機械工程學院研究人員們正致力於開發新的軟體,通過與硬體協作...
    在這種環境中,軟體和硬體需要完美配合統一來協同工作。相機,觸覺傳感器,計算機和光探測設備需要將信號反饋給計算機,算法需要處理這些信息並作出決定。為了將這些強大的能力更廣泛地應用於我們的日常生活造福人類,MIT機械工程學院研究人員們正致力於開發新的軟體,通過與硬體協作創造出真正的日常智能設備。
  • 億晟ETV信息發布系統的功能及特點分析
    打開APP 億晟ETV信息發布系統的功能及特點分析 億晟科技 發表於 2021-01-14 16:55:25 億晟科技的ETV信息發布系統融合網絡技術
  • 生物信息百Jia軟體(十五):rnammer
    通哥點評rnammer是用來預測原核與真核生物核糖體序列的程序,使用起來非常簡單,直接給基因組序列即可。
  • 2020年中國地理信息系統(GIS)行業現狀研究分析與發展趨勢預測報告
    第一章 GIS的概述  第一節 GIS的概念    一、GIS定義      1、信息、地理信息      2、信息系統      3、地理信息系統    二、GIS的分類    三、GIS的應用  第二節 GIS的構成    一、計算機硬體系統    二、計算機軟體系統    三、地理空間數據    四、系統使用管理和維護人員  第三節 GIS與相關行業的關係分析    一、GIS和MIS的關係