華大科技生物信息培訓班RNA分析專題(山東 · 泰安)

2021-01-11 生物探索

人類基因組計劃完成後生物科學進入了人類後基因組時代，即大規模開展基因組生物學功能研究和應用研究的時代。基因組、轉錄組水平的遺傳數據得以迅速積累和利用，在生物、醫學、農業和工業領域得到越發重要的應用。例如為一些疾病提供新的診斷、治療方法；為農業重要物種提供新的育種、改良方法……

本課程將從圍繞RNA分析為您介紹最前沿的生物信息研究方法、實驗技術原理、數據分析軟體、作圖軟體等，為您解析近年來發表的經典文獻，在科研道路上竭力為您提供更多思路與策略！

主辦單位：深圳華大基因科技服務有限公司

舉辦地點：中國 山東 泰安 山東農業大學

舉辦時間：2014年6月23日-6月26日

課程內容

RNA分析專題培訓班課程表時間課題6月23日9:00-12:001、RNA研究進展介紹  1.1 成熟的分析方法  1.2 近年的熱門研究課題  1.3 面臨的問題和挑戰14:00-18:002、RNA定量分析（RNA-Seq）  2.1 定量分析的方法  2.2 篩選差異表達基因  2.3 功能富集分析  2.4 應用案例3、上機實踐  3.1 聚類分析（cluster、Genesis）;基於DAVID進行GO功能分析;KO注釋和pathway注釋軟體KOBAS 2.0等6月24日9:00-12:004、轉錄組學分析——沒有參考序列（de novo）  4.1 詳細介紹轉錄組組裝（Trinity）  4.2 unigene功能注釋、GO分類、代謝通路分析等  4.3 應用案例14:00-18:005、上機實踐  5.1  linux系統基本操作；組裝軟體Trinity；比對軟體Blast/Blast2GO等6月25日9:00-12:006、轉錄組學分析——有參考序列（ref）  6.1 定量分析  6.2 結構變異檢測（AS、SNP、fusion等）  6.3 應用案例14:00-18:007、上機實踐  7.1 序列比對軟體BWA；SNP 分析軟體SOAPsnp；可變剪切位分析軟體TopHat/SOAPsplice；融合基因分析軟體SOAPfuse等6月26日9:00-12:008、非編碼RNA研究  8.1 Small RNA分析    A) 幾種主要的sRNA生源概述    B) miRNA鑑定及表達譜構建（基於mirbase數據）    C) miRNA表達模式分析（差異分析和聚類分析）    D) 其他種類ncRNA的鑑定    E) novelmiRNA預測方法原理    F) miRNA靶基因預測    G) lncRNA研究進展，分析思路14:00-18:00  8.2miRNA綜合研究思路    A) miRNA靶基因與降解組研究    B) miRNA表達與mRNA表達聯合分析    C) miRNA研究與lncRNA研究9、上機實踐  9.1 介紹miRNA預測軟體Mireap、靶基因預測軟體psRNATarget等10、RNA經典案例解析（貫穿分析、項目設計等）

講師團隊

RNA專題——首席講師： 韓祖晶

華大科技生物醫藥信息分析部負責人，mRNA分析團隊首席信息分析工程師。致力於RNA信息分析技術研發，負責和參與多個重大RNA項目設計與信息分析。2011年主導「基因表達的RNA測序質控方法及裝置」專利申請並通過認證。

培訓授課經驗豐富，在華大曆屆RNA專題培訓班中受到學員的高度評價。

轉錄組學——講師：陳超

華大基因高級生物信息工程師，從事生物信息分析工作5年，主要工作內容為轉錄組和基因組相關研究，期間負責並參與大量轉錄組、全外顯子組和全基因組項目的信息分析工作。曾參與前列腺癌轉錄組研究、鴨基因組&轉錄組研究、四倍體擬南芥轉錄組研究、雪貂轉錄組等項目，並主導華大lncRNA-seq產品和DGE產品的研發升級工作。有豐富的生物信息分析經驗和項目實戰經驗。

主要文章：

1. Leon,...,Chao Chen,...Kelvin.Sequencing, Annotation, and Characterization of the Influenza Ferret Infectome.J. Virol 2013,87:1957-1966.

2. Shancheng Ren , ..., Chao Chen ..., Yinghao Sun. RNA-seq analysis of prostate cancer in the Chinese population identifies recurrent gene fusions,cancer-associated long noncoding RNAs and aberrant alternative splicings. Cell Res 2012,22:806–821.

3. Liu xinxing,Chen Chao.De novo assembly of allotetraploid arabidopsis suecica transcriptome using short reads for gene discovery and marker identification. China Biotechnology, 2011,31:45-53.

small RNA--講師：劉宇峰

華大基因高級項目經理，從事生物信息分析工作5年，主要工作內容為全轉錄組和免疫組相關研究，期間負責並參與大量轉錄組、small RNA、降解組、免疫組的信息分析工作,如黃鱔基因組、螞蟻基因組、黃瓜基因組的miRNA部分。另外參與了30餘種miRNA的分析工作，如人、大鼠、小鼠、果蠅、蜜蜂、擬南芥、水稻、玉米、葡萄、三七、田黃等。期間負責華大SmallRNA-seq產品、降解組以及免疫組庫產品的研發升級工作。有豐富的生物信息分析經驗和項目實戰經驗。

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電子郵箱：c-training@service.genomics.cn

電話： 0755-25273808　何老師（諮詢時間：周一至周五9:00-18:00）

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