一、作物真菌病害
真菌寄生於植物並引致的病害叫真菌病害。真菌在營養生長階段的結構叫營養體，主要功能是吸收.輸送和貯存營養，為繁殖生長做準備。真菌的營養體還可以形成菌組織以及菌體的變態結構。已記載的植物病原真菌有8000種以上。真菌可引起3$餘種植物病害，佔植物病害總數的80%，屬第一大病原物。一種作物上可能發生幾種甚至幾十種真菌病害。植物上常見的霜茁病、白粉病、銹病和黑粉病四大病害都是由真菌引起的。歷史上曾流行的楨物病害多數是真菌病害。
常見的作物真菌病害症狀有霜黴、白粉、白鏽、黑粉、鏽粉、煙煤、黑痣、黴狀物、蘑菇狀物、棉絮狀物、顆粒狀物、繩索狀物、黏質粒和小黑點等，許多大的症狀可用肉眼直接觀察到。引起作物真菌病害的病原真菌有綿祗菌、腐黴菌、疫黴菌、白鏽菌、白粉菌、黑星菌、黑粉菌、囊殼菌和半知菌類等。
真菌病害的侵染循環類型最多，許多病菌可形成特殊的組織或孢子越冬。在熱帶和亞熱帶，不少病菌不越冬而越夏。大多數病菌的有性孢子在侵染循環中起重要作用，其無性孢子則起不斷再侵染的作用。真菌病害主要靠氣流、水流傳播，其次為風、雨、昆蟲傳播等。
例如，小麥銹病是由真菌擔子菌綱中幾種鏽菌侵染小麥引起的。受害小麥生長發育期在葉子或杆上出現鮮黃色或紅褐色的粉泡狀病斑。在顯微鏡下可見病斑中有很多單細胞的夏孢子，稱夏孢子堆，是由侵入到小麥植株內的菌絲體產生的。小麥銹病在整個生活史中，除了產生夏孢子卟，還產生其他類型的孢，最多可產生5種孢子，
旦以夏孢子危害嚴重。夏孢侵害和蔓延很快，它從侵到產生出新的夏孢子只需12天。因此只要條件適合，就會出現流行，造成的嚴重減產。小麥銹病有3種：一為小麥條銹病，是由專性寄生的條形柄鏽（小左條銹病菌）引起的病害，主要發生在葉片上，也可發生在葉鞘和穗上，裡孢堆小。沿葉脈縱向排列成虛線狀，鮮黃色。該病主要發生在華北、西北、西南和淮北等地的冬麥區。二為小麥稈銹病，是由禾柄鏽菌引起的病害，主要發生在葉鞘、莖稈和葉片基部。嚴重時也發生在麥穗的穎片和芒上。
有時在短期內造成較大損失。夏孢子堆紅褐色，長橢圓形。散生，不排列成條。該菌是一種轉主寄生菌，生活史中有兩個寄主。先是小麥，在其上產生夏孢子和冬孢子，冬孢子萌發產生擔孢子，再侵害另一類植物，即小檗，在其上產生性孢子和鏽孢。以後鏽孢子再侵染小麥，進行新的循環。三為小麥葉銹病，是由小麥隱匿柄鏽菌引起的病害。主要發生在葉片上，也能侵害葉鞘，很少發生在莖稈或穗部。夏孢子堆圓形或近圓形，橘紅色。俗話說「條鏽成行葉鏽亂，杆鏽是個大紅斑」，是對三種銹病的形象描述。
二、作物病毒病害
作物病毒病是由病毒寄生引起的病害。病毒包被在蛋白或脂蛋白保護性外殼中。病毒區別於其他生物的主要特徵是個體微小、結構簡單：主要由核酸及保護性衣殼組成，它是只能在適合的寄主細胞內完成自身複製的一個或多個基因組的核酸分子，又稱分子寄生物。病毒的複製依賴於寄主的核酸和蛋白質合成系統，需要寄主提供原材料。病毒是嚴格寄生性的一種專性寄生物，離開生物活體不能生存，也不能在人工培養基上培養。植物病毒作為植物的一種病原，主要由機械摩擦和介體昆蟲傳毒，植物病毒病害的數量和危害，僅次於真菌病害，列第二位。植物病毒對植物的生長發育構成了很大的威脅。
作物病毒病常有如下症狀：一是變色。葉片上產生花葉、斑點、環斑、條紋、脈帶和黃化等，有的花色變成綠色或雜色。二是壞死。病毒寄生會導致細胞或組織死亡，變成枯黃色至褐色，有時出現凹陷。葉片上常呈現壞死斑、壞死環或壞死條等。三是畸形。如莖間縮短，植株矮化，叢枝或叢簇，葉片變形、捲曲等。
病毒除借帶毒的繁殖材料如接穗、塊根等傳播外，主要通過昆蟲、蟎類、土壤中的真菌等介體傳播。傳毒昆蟲以具刺吸式口器者為主，如蚜蟲、葉蟬、飛蝨等，蚜蟲是作物病毒的主要傳播者。例如，主米粗縮病是由灰飛蝨傳播的病毒病。病株嚴重矮化，僅為健株髙的1/2~1/3。葉色深綠，寬短質硬，呈對生狀，葉背面側脈上出現蠟白色突起物，粗糙明顯。有時葉鞘、果穗苞葉上具蠟白色條斑。病株分叉多，根系不發達易拔出。輕者雖抽雄，但半包被在喇叭口裡，雄穗敗育或發育不良，花絲不發達，結實少，重癇株提早枯死或無收成。該病除危害玉米外，還可危害大麥、小麥、燕麥、卨梁、穀子等禾本科作物。病原為玉米粗縮病毒。玉米粗縮病主要靠灰飛蝨傳毒，據報導，雲南麗江地區傳毒昆蟲為白背飛蝨。
大麥、小麥和禾本科雜草看麥娘、狗尾草等是粗縮病毒越冬的主要寄主。粗縮病毒在灰飛蝨體內可增殖和越冬，但不能經卵傳給下一代。灰飛蝨主要在麥田、綠肥田和雜草根際越冬，春季在大麥、小麥、雜草上，隨後部分轉移到水稻上繁殖，在玉米上不能繁殖。灰飛蝨成蟲和若蟲在田埂地邊雜草叢中越冬，第二年春季遷入玉米田。冬小麥也是該病毒越冬場所之一。春季帶毒的灰飛蝨把病毒傳播到返青的小麥上，然後再傳到玉米上。玉米5葉期前易感病，10葉期抗性增強。該病發生與帶毒灰飛蝨數量及栽培條件相關。玉米出苗至5葉期如與傳#昆蟲遷飛高峰期吻合易發病，套種田、早播田及雜草多的玉米田發病重，玉米苗期是玉米粗縮病的敏感期。冬卷氣候溫暖乾燥季少雨有利灰飛蝨病毒發生。
20世紀6070年代，該病曾在我國部分地區嚴重發生，近年北方冀、獸、陝、晉、遼、津等省市暴發成災，嚴重威脅玉米生產的發展。究其原因，一是玉米品種不抗病。二是玉米與小麥套種或與棉花、蔬菜等插花種植，粗縮病向棉區和菜區、玉米田擴展。三是玉米感病生育期與灰飛蝨成發期相吻合，是當前玉米種植制度有利於粗縮病流行的重要原因。四是冬季溫暖乾燥、春季少雨為該病流行的有利氣候條件。