乾貨:FlowJo流式數據分析常見術語整理!

2021-03-01 MDL科研助手

FlowJo是美國史丹福大學Leonard Herzenberg（FACS機器的發明者）實驗室在90年代研發的一款流式數據分析軟體。FlowJo由於功能強大，簡單易用，已經被領域內的科學家、實驗室廣泛引用；同時FlowJo也是各高影響力核心期刊引用最多的流式數據分析軟體。但是在使用FlowJo進行流式數據分析的時候，有些術語的含義非常常見，但是其具體含義又是什麼呢？在這裡簡單做一些總結，總結一些常見術語，供大家參考。

每一個細胞單參數的測量數據可以整理成統計分布，以直方圖的方式來顯示。在圖中，橫坐標表示螢光信號或散射光信號相對強度的值，其單位是道數，可以是線形（line）或者對數（log）。縱坐標一般是細胞數（count）。  

在二維圖的中，橫坐標/縱坐標都表示螢光信號或散射光信號相對強度的值，可以是線形（line）或者對數（log）。雙參數圖可以將樣品細胞群分開，常用來分析多參數數據。 

(1）門的3種組合：and; or; not(eg.Gate4=Gate1 or Gate2 or Gate3) 

（2）Convert Marker To Gate(eg.M1=Gate 5) 

（3）Convert Quads To Gates 

數據統計

統計方式：百分比（%）&螢光強度（MFI）

（1）百分比（%）：一種細胞佔樣本中所有細胞的比例 

（2）螢光強度（MFI）：Median=164.74所對應的值跟細胞表面受體個數正相關。

Mean：平均螢光強度；Median：螢光強度的中位數；Mode：眾數，是一組數據中出現次數最多的數值；Geometric mean：幾何平均數，是指n個觀察值連乘積的n次方根，計算公式為： 

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