From DNA to Discovery – The Steps of SMRT Sequencing
SMRT 技術原理
理想的測序起始是獲得高分子量DNA。市面上有很多提取試劑盒可以幫助您解決此問題,PacBio還提供DNA提取方案網址,以協助您完成此工作。
您也可以隨時將項目外包給PacBio的認證服務商。
PacBio使用SMRTbell啞鈴型結構文庫,DNA片段的兩端連接接頭,測序引物結合在接頭上,形成環狀DNA模板,供聚合酶進行合成反應。 根據應用方向,確定DNA 片段化最佳長度,插入長度可以從250 bp到>25,000 bp。樣品也可以使用獨特的標籤序列(barcode),進行混樣從而提升測序通量。
SMRTCell 8M
準備好文庫後,PacBio測序系統將開始工作。SMRT技術核心是晶片,其中包含數百萬個稱為零模波導(ZMW)納米孔 。DNA單個分子被錨定在這些孔中,隨著聚合酶合成每個核苷酸,並實時檢測核苷酸螢光信息,最終通過軟體進行分析結果。
一級分析完成後,即可得到序列信息。之後使用SMRT Link用戶界面和SMRT Analysis(具有一套分析應用程式和可視化工具)進行二級分析。
SMRT測序的獨特之處在於能夠對同一DNA分子進行多次測序,從而產生高精確的長讀長或HiFi reads。
根據您的不同需求,可以使用一系列的三級分析工具,其中許多是由用戶開發的。您可深入研究案例庫,了解SMRT測序數據特性,同時可輕鬆訪問PacBio DevNet 社區開發的分析工具和其他資源,以便幫助進一步完成分析和數據解釋。
所有測序項目最令人興奮的部分是,通過測序增進對生物學的了解,將研究數據轉化為最終的新發現。SMRT社區的成員已經在很多領域得到了大量新發現。您可以訪問我們的博客和SMRT資源庫,查找有關如何將SMRT測序應用於生物學問題,例如:從確認疾病的致病變異,確定蘆筍植物的性別,或確定哪種微生物最適合奶酪生產……
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基因有限公司作為PacBio公司在中國區的獨家代理商,自2011年以來將PacBio第三代單分子實時測序技術引入國內,一直為國內用戶提供專業的三代測序系統的安裝培訓,技術支持,應用培訓與售後維護工作,贏得客戶的一致好評與信任。基因有限公司將一如既往的支持越來越多的PacBio用戶。