【科技日報】萬種原生生物基因組計劃啟動

2021-01-12 中國科學院

　　近日，全球首個萬種原生生物基因組計劃（Protist 10000 Genomes Project， 簡稱P10K）正式發布，旨在繪製萬種代表性原生生物基因組圖譜，建立一個大規模的原生生物遺傳資源資料庫。

　　原生生物是生物五界（植物界、真菌界、動物界、原生生物界和原核生物界）之一，主要是由單細胞真核生物組成的一大類群，包括單細胞真核藻類和原生動物等，已描述的物種數超過6萬種，未知種類難以估量。

　　據介紹，原生生物分布極為廣泛，只要有水的地方，就有原生生物存在。原生生物是水生態系統重要組分，其中的藻類貢獻了地球上近50%的光合行為，也是水產動物和人類的優良餌料和營養品，另外，部分甲藻和硅藻瘋長會造成河流和海洋有毒藻華，帶來嚴重環境問題。同時，很多原生生物是人、畜禽和水產動物的重要致病性寄生蟲，如造成人瘧疾的瘧原蟲、昏睡病的錐蟲、雞球蟲病的球蟲，造成魚白點病的小瓜蟲等。

　　目前，在基礎生物學研究方面，一些原生生物作為模式生物作出了重要貢獻。例如在嗜熱四膜蟲中發現的核酶以及端粒和端粒酶分別獲得了1989年和2009年諾貝爾獎。然而，已公開發表了基因組數據的原生生物僅400餘種。

　　據悉，該計劃由中科院水生所聯合西藏大學、河南農業大學、中國農科院蘭州獸醫研究所、中科院北京基因組研究所和華中科技大學等單位共同發起。中科院水生生物研究所副所長殷站介紹，萬種原生生物基因組計劃是國際上首次針對原生生物界大規模基因組測序計劃。該計劃將依託各發起單位保藏的3000多種真核藻類和原生動物種質資源，通過持續的樣品採集和宏基因組數據挖掘，在未來3年完成約一萬種原生生物的基因組測序和分析，將包括原生生物全部26個門/類，覆蓋超過85%的綱、60%的目和30%的科屬。

　　開展萬種原生生物基因組計劃，有助於理解生物多樣性形成機制、多細胞生物/有性生殖的起源與演化等重大基礎生命科學問題，促進國家科技資源共享服務平臺信息互聯互通，推動與生態環境保護、營養健康和疾病防治相關原生生物種質傳資源的挖掘與應用實踐。

　　值得注意的是，該計劃將以開放聯盟模式運行，國內外有興趣的研究團隊均可加入。

　　（原載於《科技日報》 2020-01-08 05版）

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