做生信分析還在自己寫軟體?

2021-01-10 深圳南博屹生物科技

隨著生信分析的熱門程度與日俱增,不少做科研的朋友紛紛表示,想換個高大上薪酬高的生物信息工程師做做。可是一聽說,生信分析需要編程,就打退堂鼓了。

其實做生物信息的人並不是都在自己寫軟體,只有少部分研究模型算法的人才需要自己寫軟體。

大部分生信分析只需要用現有的軟體,利用好手頭的數據,解決想要解決的生物學問題就行了。相對寫軟體而言,得到數據後,編好故事,發文章才是最重要的。

下面小博給大家分享幾個常用的生信分析軟體。

KEGG

進行基因的代謝通路注釋

http://www.kegg.jp/blastkoala/

UCSC

進行基因組可視化

http://genome.ucsc.edu/index.html

IBS

進行序列結構示意圖繪製

http://ibs.biocuckoo.org/online.php

趕緊收藏吧,說不準什麼時候就需要了。更多精彩內容下期繼續~~

相關焦點

  • 為什麼要做生信分析,你知道嗎?
    為什麼寫文章還做生物信息學分析?生物信息學主要是對DNA和胺基酸序列中所含有的信息進行分析。可以對多個序列進行比對,分析他們的相似度,可以對基因結構進行預測可以對蛋白質的一級二級三級結構進行預測。回到為什麼做生信分析這個問題上,很多時候,我們學生信都抱著發文章會更容易的目的。比如,我們想找一個好點子,關於性狀,疾病相關的關鍵分子,正常就需要設計實驗,做大量的分子篩選的工作。
  • 文獻解讀︱單靠數據挖掘做生信分析也能發6分SCI(免費領取軟體大...
    -19患者肺組織和外周血單核細胞(PBMC)樣本基因表達的影響,通過差異表達基因分析確定與新冠病毒感染相關的重要通路,再應用WGCNA分析方法進一步確定與新冠肺炎患者的臨床特徵呈高相關性的基因模塊,最後採取三種先進手段預測潛在治療藥物。
  • rboAnalyzer丨有了它,做生信分析更容易了
    在今年7月來自捷克的Schwarz課題組在Frontiers in Genetics發表了著作,他們開發了rboAnalyzer軟體,主要針對非編碼RNA,以自動化工作流程取代手動工作,可有助於解釋序列搜索結果。
  • 軟體天地丨厲害了,三大有限元分析軟體集體亮相
    國內的整個高性能計算生態鏈,已經全權掌握在我們自己手上了,包括定製處理器,包括定製網絡,甚至包括軟體開發升級。按照「立足深圳、面向全國,服務華南、港、澳、臺及東南亞地區」的服務目標,超算中心建成了強大的基礎設施,並部署了國內最多最全的高性能計算軟體,廣泛覆蓋了化學、生物、材料、工業仿真、流體計算、動漫渲染、氣象預報等多個學科,為穩定高性能計算生態鏈不斷完善設施。
  • 序列比對綜合分析軟體
    Geneious 8.0.3序列綜合分析軟體;MACAW 2.05多序列構建與分析軟體。Clustal W 2.1用來對核酸與蛋白序列進行多序列比對(multiple sequence alignment)的軟體。FASTA 36.3.6f。將一條序列與另一條序列進行比較或在資料庫中查找同源序列並輸出。
  • 軟體工程師除了寫代碼,還能做什麼工作?
    當我籤下第一個客戶時,還沒覺得技術寫作可以像許多職業道路一樣成為前軟體工程師的新職業,但沒過多久我就意識到了這確實是可能的。 軟體開發人員還能做什麼? 這一發現令我陷入沉思:「除了寫軟體,軟體工程師還能做什麼?」答案之多令人咋舌。
  • 生物信息分析系統 ≠ 硬體+軟體堆砌
    還在手動的將數據在不同的存儲中存來存去?海量數據中查找某數據耗時耗力?分析數據過程中內存超配,機器宕機?......如果上述問題還在佔用您的時間和精力,說明您的生物信息分析系統亟待更新完善。一個好的生物信息分析系統,可以解放您的雙手,您只需專注科學研究,其他問題交由生物信息分析系統來做。生物信息分析系統並不是簡單的硬體存儲加上分析軟體的堆疊,而是為滿足生物信息分析對於速度、規模和智能化等苛刻需求建立的一體化解決方案。
  • 精於數據處理:自動化單細胞分析軟體——CeleScope
    你是否還在為單細胞數據分析而發愁?是否還在為重新學習各種分析軟體而苦惱?今天給大家介紹一個單細胞數據分析軟體——CeleScope™,簡單易上手,結果準確可靠,讓你的研究更進一步!CeleScope™是一系列用於分析新格元GEXSCOPE®單細胞測序數據的生物信息流程。可從二代測序下機的原始fastq數據開始處理,包含數據拆分、比對、定量、生成表達矩陣、分群等功能。
  • DOT模型助力大數據分析軟體開發
    ,來指導大數據分析軟體的開發,DOT模型就是在這樣的背景下誕生的。  主持人:那如果開發者就是想用這個模型做一些大數據軟體的開發的話,他應該怎麼去做呢,能說一下嗎?  嘉賓:我們這個模型主要是給予指導意義的,就是如果他在設計這個軟體的時候,在不去做軟體寫程序之前就可以把他的框架通過我們的模型表現出來。
  • 目前國內最為專業的xrd分析軟體
    [名稱]:jade 5[大小]:6 MB   [語言]:簡體中文 [安裝環境]:Win7/Win8/Win10[64/32位下載連結]:[下載連結]:pan.baidu.com/s/1vDPQPgcUrp3Xsyayofxsrg[提取碼]:flut Jade5軟體是一款專門用於
  • 【科研軟體】全球最受歡迎的細胞流式分析軟體——FlowJo 10破解版及其全套教程
    歡迎分享本文到朋友圈,文章轉載、投稿、業務合作請聯繫微信Research_Dog~~有句老話說的好:寫論文
  • 澳大學將引進分析軟體鑑別代寫論文
    為打擊這種行為,澳大利亞多所大學計劃在今年內引進高技術分析軟體鑑別代寫,屆時,可能一個標點符號就會讓作弊行為曝光。軟體名為「作者調查」,由美國Turnitin公司推出,其工作模式類似法醫語言學家,可以幫助確認構成個人獨特寫作風格的70個不同因素。這些因素包括逗號、括號、破折號的使用以及作者如何舉例、是否會在句號後留兩個空格。
  • 軟體是用編程軟體編寫的,那麼編程軟體又怎麼來的?
    舉個例子哈,IntelliJ IDEA和Eclipse都是Java的IDE,用這兩個IDE可以寫非常多的軟體,比如Android Studio先後分別基於這兩個軟體,Android上所有的軟體都是用這玩意兒開發的,但是這兩個IDE本身也都是Java語言開發的,這兩個IDE呢最初肯定是在Vim/Emacs+Java開發的,咱就先說到這裡,不然要喋喋不休了。
  • 你還在為找不到俄語學習軟體發愁嗎?
    走在俄語求學路上的你會不會感慨,為什麼人家英語學習軟體那麼多!俄語這麼難搞,學習資料怎麼如此匱乏呢?別擔心,今天我們就為小夥伴們整理出一系列學習俄語的網站和app!從零基礎到進階一應俱全,讓大家下載到手軟!
  • JADE — 智能化XRD分析軟體
    Materials Data (MDI)總部位於美國加利福尼亞州,幾十年來專注於開發XRD分析軟體。
  • Minitab(統計數據分析軟體)
    Minitab(統計數據分析軟體)提供了統計分析、可視化分析、預測式分析和改進分析來支持數據驅動型功能。使用這款軟體可以幫助統計專家們更好地預測結果、設計更出色的產品並創造更專業的數據。
  • 如何使用SPICE軟體進行RLC電路的時域分析
    打開APP 如何使用SPICE軟體進行RLC電路的時域分析 與非網 發表於 2019-10-16 11:52:06 如果您不是那種喜歡解微分方程的人
  • Crystal Ball | 風險分析軟體
    它可以幫助你分析與你的電子表格模型相關的風險和不確定性。 這個軟體包括蒙特卡洛模擬(水晶球)、時間序列預測(水晶球預言家)、最優選擇(優化查詢)和用來構造定製界面和程序的開發工具箱。由於電子表格缺乏設計和分析可選方案的能力,所以僅用電子表格來估算一個事件發生的概率是不合適的。
  • 這國技校生寫的飛控軟體不靠譜,其實栽在了控制率上
    早在30年前,三哥的軟體外包服務業就已經開始嶄露頭角。到後來甚至發展成為該國出口創匯的第一大項目。每年的該項目獲得的對外貿易順差都有幾百億美元,而三哥的整體國際收支平衡基本是常年弱順差。因為三哥到目前石油資源匱乏,原油90%以上需要常年進口;成為外匯消耗的第一大項。
  • 他一本小說成神,改成遊戲寫了十年還在寫!讀者:已經等到哭
    他一本小說成神,小說都改成遊戲,寫了十年還在寫,讀者:已經等到哭了!這本書就是傳說中的《暗黑破壞神之毀滅》了,從2008年開始寫的,那個時候剛好在舉辦奧運會,如今,奧運會又舉辦了兩屆了,這本書還沒完,昨天才更新了一張。