2014年9月,一篇關於大豆泛基因組的文章現身Nature Biotechnology轟動了大豆界,也讓泛基因組再一次回到了討論的話題榜,該篇文章主要是通過運用高通量測序及生物信息分析手段,針對不同亞種/個體材料進行文庫構建及低深度測序,並進行泛組裝,構建泛基因組圖譜,從而獲得該物種完整的遺傳信息,其研究路線如下:
圖1 Pan-genome技術流程圖
泛基因組包括核心基因組(Core genome)和非必須基因組(Dispensable genome)。其中,核心基因組由所有樣本中都存在的序列組成,一般與物種生物學功能和主要表型特徵相關,反映了物種的穩定性;非必須基因組由僅在單個樣本或部分樣本中存在的序列組成,一般與樣本對特定環境的適應性或特有的生物學特徵相關,反映了樣本的特性。
產品優勢:
1. 方案設計新穎
2. 分析內容多元化
• 基因組de novo分析內容:基因家族分析、系統進化等等
• 比較基因組學分析、基因組SNP、InDel、SV 、CNV
• Novel sequence檢測等
適用範圍:
• 選擇不同亞種材料進行泛基因組測序,可以研究物種的起源及演化等重要生物學問題;
• 選擇野生種和栽培種等不同特性的種質資源進行泛基因組測序,可以發掘重要性狀相關的基因資源,為科學育種提供指導;
• 選擇不同生態地理類型的種質資源進行泛基因組測序,可以開展物種的適應性進化,外來物種入侵性等熱門科學問題的研究,為分子生態學等學科提供新的研究手段。
諾禾致源基因組測序以嚴謹的科學態度,專業的分析團隊,全力為您提供最合理的基因組方案,竭誠為您提供最優質的服務!