【產品速遞】話說Pan-genome你要知道的事情!

2021-03-01 諾禾科服

2014年9月,一篇關於大豆泛基因組的文章現身Nature Biotechnology轟動了大豆界,也讓泛基因組再一次回到了討論的話題榜,該篇文章主要是通過運用高通量測序及生物信息分析手段,針對不同亞種/個體材料進行文庫構建及低深度測序,並進行泛組裝,構建泛基因組圖譜,從而獲得該物種完整的遺傳信息,其研究路線如下:

圖1 Pan-genome技術流程圖

泛基因組包括核心基因組(Core genome)和非必須基因組(Dispensable genome)。其中,核心基因組由所有樣本中都存在的序列組成,一般與物種生物學功能和主要表型特徵相關,反映了物種的穩定性;非必須基因組由僅在單個樣本或部分樣本中存在的序列組成,一般與樣本對特定環境的適應性或特有的生物學特徵相關,反映了樣本的特性。

產品優勢:

1. 方案設計新穎

2. 分析內容多元化

• 基因組de novo分析內容:基因家族分析、系統進化等等

• 比較基因組學分析、基因組SNP、InDel、SV 、CNV

• Novel sequence檢測等

適用範圍:

• 選擇不同亞種材料進行泛基因組測序,可以研究物種的起源及演化等重要生物學問題;

• 選擇野生種和栽培種等不同特性的種質資源進行泛基因組測序,可以發掘重要性狀相關的基因資源,為科學育種提供指導;

• 選擇不同生態地理類型的種質資源進行泛基因組測序,可以開展物種的適應性進化,外來物種入侵性等熱門科學問題的研究,為分子生態學等學科提供新的研究手段。

諾禾致源基因組測序以嚴謹的科學態度,專業的分析團隊,全力為您提供最合理的基因組方案,竭誠為您提供最優質的服務!

相關焦點

  • 年終盤點丨2020必讀的10篇經典泛基因組 (pan-genome) 文章
    Eight high-quality genomes reveal pan-genome architecture and ecotype differentiation of Brassica napus[J]. Nature plants, 2020, 6(1): 34-45.[2] Liu Y, Du H, Li P, et al.
  • 人肉速遞48小時奇遇記——中國中堅力量-職業菁英關懷計劃頒獎全記錄
    第一財經領導與菁英計劃導師登門派送活動獎盃,一財小編全程參與人肉獎盃速遞,48小時內環遊大上海,遍尋獲獎菁英!既然你點開了這條連結,那就隨一財小編一起體驗這次精彩又驚豔的人肉速遞之旅吧!話說小編戴上安全帽那一刻內心所想的竟然不是「耶,我要去上海中心了!」,小編想的竟然是「我要去工地了,公司有買意外險麼?」帶著頒獎領導和小編深入上海中心的正是獲得「年度菁英代表人物」獎、來自錦江酒店資產管理的菁英傅美惠。
  • a flash in the pan可不是指「鍋裡的一道閃光」那是什麼意思呢?
    a flash in the pan可不是指「鍋裡的一道閃光」,它在美國口語裡指的是「曇花一現,轉瞬即逝」,多用來形容某人「紅極一時」或者某事「持續時間短」。aflash in the pan英語解釋為a person or thing that attracts attention for a short time but is soon forgotten我們看下例句:A:He was a great singer in his day.His songs were heard in all the streets
  • Genome Biology基因編緝系列精選 | 你身邊的團隊
    utm_source=other&utm_medium=other&utm_content=null&utm_campaign=BSCN_1_DD_GB_GeneEdit_SciNet 微信連結:https://mp.weixin.qq.com/s/JkGyv57A8CWX3iJUhVqTKg Genome Biology
  • ZigBee全面對比6LoWPAN_物聯網最佳拍檔花落誰家?
    6Lowpan是IPv6 over Low-power wireless Personal Area Networks的首字母縮寫。這個名字起源於IETF的6LoWPAN工作組。6Lowpan的物理層和MAC層採用802.15.4標準。 與乙太網、802.11等傳統鏈路層不同,標準的IPv6協議不能直接構建在IEEE802.15.4MAC層之上。
  • 「物聯網」時代郵政速遞物流生產運營的思考
    對於新興的電子商務速遞業務,商品一經發貨,消費者便可通過「物聯網」全面了解商品的屬性,電子商務速遞系統可與商家銷售並寄遞的實際商品相比對,避免錯發及欺騙消費者的行為發生。對於代收貨款業務,商品一經訂貨,就會給客戶提供一個詳細的商品編號,包含該產品的多種信息,避免客戶上當受騙。
  • 《愛回家之開心速遞》第1112集:終於知道Ivan和May的中文名
    在TVB的處境劇《愛回家之開心速遞》裡,IT部主管Ivan(鄧永健)雖然不是主角。但從開播直至現在,Ivan一直作為常駐角色擔任接龍公司的IT部主管。《愛回家之開心速遞》在最開始,Ivan還和「愛回家最可愛的秘書」侯蔡欣(邵佩詩)處CP。而在欣欣離開「愛回家」後,Ivan的人物關係也做了一定的改動。
  • 人類基因組計劃(genome project)的「非官方」延續
    在裡程碑式的人類基因組計劃(genome project)結束10多年後,研究人員6月2日宣布將於今年籌資1億美元啟動人類基因組編寫計劃
  • Estimate genome size
    參考資料1. http://www.genome.umd.edu/docs/JellyfishUserGuide.pdf2. https://github.com/josephryan/estimate_genome_size.pl 3. https://github.com/yihui/r-ninja
  • Genome Biology | 七月內容更新
    HUPAN: a pan-genome analysis pipeline for human genomes HUPAN:人類基因組的泛基因組分析pipeline DOI:10.1186/s13059-019-1751-y Zhongqu Duan et
  • PK順豐 郵政速遞:同城6小時送達
    從2016年1月1日起,中國郵政速遞上海分公司將率先啟動「同城當日遞」業務。承諾中午12:00前攬收,當天18:00前送達。而業內的服務標準是:中午11:00前攬收,當天20:00前送達。
  • 讓人出乎意料的英語詞 你知道嗎?
    要說漂亮,我們公司新來的秘書可算是個相貌出眾的女孩子了。   Talking about being pretty, our company’s new secretary is indeed a lulu.
  • 青春之旅:其實你知道的,甜甜的戀愛一直都存在少女時代
    文/速遞君 即便是有著滿滿當當的課程,和緊張的考試,但是這也絲毫不會影響在青春時期的我們年少時期對那個人的心動。每一個人的青春幾乎都會有一個人的身影,ta可能是你的同學,你的朋友,你的喜歡的人,你的年少情深。
  • TVB小花謝芷倫入行6年終靠《開心速遞》走紅,曾參選港姐才藝過人
    TVB的處境劇《愛回家之開心速遞》(以下簡稱《開心速遞》)絕對是很多不知名演員最佳的上位劇集,這麼說可一點都不誇張。事實上,安排進《開心速遞》劇組的大多都不是什麼名氣、人氣都特別大的演員,更多的都是在常規劇集中做綠葉又或是新人,當然這並不意味著這部劇是閒人回收站,專門收留這些不知名的藝人,反而這部劇能夠給這些平日不太出名的演員很多表現的空間,而這些演員要借著這些劇集引起關注也不是不可能的事情,好比在劇中飾演大小姐的林淑敏、飾演雷珍妮的陳瑋琪等等演員都已經借著這部劇開始為人所熟知,甚至走紅,這當中也包括飾演大小姐秘書林美香
  • Genome Biology 新文速遞:小鼠神經系統的RNA甲基化
  • 最難得的高情商,是聽人把話說完
    雖然知道母親年紀大了,思維方式很難改變,要多去理解,但她心裡還是感覺委屈、憋氣。她和老公傾訴,老公說:「想開點,媽年紀都那麼大了。」她和朋友說,朋友也沒有耐心聽她講那些雞毛蒜皮。直到我說:「這些年你肯定很不容易。」朋友的眼淚一下就流出來了,把這些年她和母親之間的衝突和委屈都講了出來。
  • 10款你必須要知道的頂級軟體
    好了今天我要向大家推薦十款顛覆你想像的牛比軟體解說順序是。軟體的特色軟體的能力軟體清單:微PE工具箱(最好的PE啟動盤沒有之一。)ScreenToGif(免費開源的gif製作神器。)FastStoneCapture中文版(電腦錄屏和截長圖神器。)
  • 即時速遞領域新星誕生,創業中國人見證六年閃送之路
    即時速遞領域新星誕生,創業中國人見證六年閃送之路蜂鳥即配、達達、美團眾包的背後,有阿里、京東和美團這些巨頭的身影。似乎此時的即時速遞領域,已再無入局的可能,但在這個硝煙無形瀰漫的戰場,一位選手卻用一套獨特的打法搶佔了市場,它就是閃送。
  • 帳單諸多「疑點」,圓通速遞卻稱數據沒問題
    蔡女士介紹,平時圓通速遞新埠島分公司將快遞取走並稱重寄送,每月根據網點的結算清單進行統一的結算,由於業務量比較大,因此之前他們並沒有仔細的核算過每個月的物流總重量。可在7月3日他們結算完6月份的物流帳單之後,圓通速遞又發來一份不同的帳單,要求蔡女士按照新的帳單進行結算。