用鹽水漱口可以暫時減少口腔細菌的數量，因此，有些人有用鹽水漱口的習慣，雖然鹽水漱口好處不少，但是卻不宜長期使用。
鹽水漱口的好處：
漱喉的理論認為，漱喉可以阻斷引起上呼吸道感染的病毒的傳播。然而，病毒是結合在細胞表面的受體上的也就是說，漱喉有可能減少病毒感染。此外，還有科學家對用茶水漱喉進行研究，同樣未能證實茶水以及茶水中含有的兒茶素對流感有預防作用。
鹽水漱口在化學上可抑制細菌，在物理上可減少炎症。例如，人每一側的扁桃體上有8~20個隱窩，分泌物、食物殘渣等容易堵在這些隱窩裡產生慢性炎症，鹽水可起到衝洗扁桃體隱窩的作用。宋文光說：「用自來水漱口也可以有物理衝洗作用。鹽水最好用濃度為0.9%的生理鹽水，發生了炎症後可以用濃一點的鹽水，但要小心吸收過多鹽水中的鈉離子而升高血壓。當然，專科醫生會讓病人用抑菌效果更好的複方硼砂溶液漱口。」
牙痛可由很多原因引起，鹽水對牙齦炎、冠周炎、口腔潰瘍等軟組織炎症也許有點用，但對齲齒等牙體疾病引發的炎症性疼痛就無能為力了——這些情況下往往要由牙科醫生用器械鑽開引流膿液，或者用3%的雙氧水強力殺菌化膿，甚至還要同時治療全身基礎疾病如高血糖、高血脂等代謝紊亂，才能奏效。
鹽水漱口是有不少的好處，但是如果長期使用的話，就會有以下的危害了：
不管是用清水，還是用鹽水漱口，對暫時減少口腔細菌的數量是有效的，二者的功效沒有哪些差異。問題是用鹽水漱口後20分鐘時，口腔內的細菌數量開始恢復，一個小時後細菌數量便恢復到漱口前的水平，而用清水漱口，儘管剛過10分鐘細菌就開始恢復，卻要到85分鐘後才恢復到初始水平。為什麼用鹽水漱口後，細菌反而要比用清水漱口更易繁殖呢？原來，鹽水殺滅口腔中細菌的同時，也破壞了起防禦作用的口腔黏膜，為細菌的迅速恢復創造了條件。
一般來講，健康人的口腔裡有一些正常的菌群，而藥物性漱口水都含有消炎、殺菌的成分，如長期使用，會造 成口腔內正常菌群的失調，反而不利於口腔健康。只有在發生牙齦膿腫、牙周炎、口腔潰瘍等急性炎症時，才能在醫生的指導下使用藥物性漱口水。
此外，食鹽太多還和胃癌與口腔癌的發生有著一定的關係。用鹽水漱口無疑加大了對身體的危害。