量子計算機的工作原理和傳統計算機的根本區別在於，
傳統計算機的運行是對bit（位）的操作，從一串二進位數變成另一串二進位數；決定兩串二進位數如何轉化的是邏輯門。
量子計算機的運行是對qubit（量子位）的操作，從一個量子態演化到另一個量子態，決定兩個量子態如何演化的是量子門，其實質是一個遵循量子力學的Unitary Operator（么正算符）。
以上特質決定了兩種計算機的算法有根本不同。
其一，qubit是可疊加態（這意味著量子計算機可以進行真正意義上的並行計算），而bit必須只能取0或1之一；
其二，qubit的演化必須是么正的，而bit之間如何變化沒什麼具體約束（一個簡單的例子：量子態的演化必須是可逆的，而傳統計算機裡很多邏輯門都是不可逆的，例如與非門）。
作為量子算法的兩個經典例子，傅立葉變換的Shor算法和最短路徑的Grover算法，就應用了量子計算機的獨有特性。兩者的計算複雜度分別是和，而相應傳統計算機算法的計算複雜度分別是和，差距一目了然。
一些補充論述：
任意一個傳統計算機算法，均有其相應量子計算機算法可模擬；
存在不能被傳統計算機算法模擬的量子計算機算法（可以稱為「真正」的量子計算機算法），如上述兩例。
因此，只要造出了位數和現有計算機相近的量子計算機，那麼傳統計算機算法被取代是必然的事情。
直白來說，量子計算機的算法包括了傳統計算機的算法，而且更快捷，
比如，10000+1000的算法過程，
在傳統計算機中，採用的就是， 把10000和1000的數轉化成二進位，再進行相加，也可以在10000 的基礎上進加法運算1000次，也可以編程做成一個基礎的資料庫，進行調用。
而量子計算機對這個算式的運算，首先會做一個狀態判斷，萬位數和千位數的相加，然後在後面的數位狀態相加，再進行一個狀態判斷，這種運算，接近人類的思考模式和運算過程。
最基本的一種量子計算機模型，就是一個太極圖，
用這個模型來處理，狀態判斷程序，會很完美。
進一步複雜點的量子計算機模型，可以模擬四象運行，
從四個維度，四個狀態來建立模型，考慮到糾纏狀態，過度階段還有系統封閉性問題，這個模型會結合五行系統來處理。
隨著模型的複雜程度，可以設計出來64格模型，延伸出來384種運動狀態，事物的演化過程。
這種計算，在處理算法方面，計算數字方面和傳統計算機也許差別不大，
不過在推演事物發展過程，資源分配方面，那性能合理性是非常完美的，匹配造物主。
疾病分類，氣象預測，健康趨勢，基因檢測，職業分類，整合評估，
對那些用邏輯和模糊算法的領域，尤其適用。