【健康:關於逆轉錄病毒宿主共同進化的新知識】
導語:逆轉錄病毒通過將其基因插入宿主基因組,在脊椎動物宿主體內定居了數百萬年,使它們能夠通過世代遺傳成為內源性逆轉錄病毒(ERVs)。研究人員通過研究野生和家養家兔的ERV變異和分離,提供了有關逆轉錄病毒及其宿主的長期聯繫的新知識。
逆轉錄病毒通過將其基因插入宿主基因組,在脊椎動物宿主體內進行了數百萬年的殖民,使它們能夠通過世代遺傳成為內源性逆轉錄病毒(ERVs)。烏普薩拉大學的研究人員通過研究野生和家養兔子的ERV變異和分離,提供了有關逆轉錄病毒及其宿主的長期聯繫的新知識。
逆轉錄病毒,如人類的愛滋病毒,必須成為宿主細胞核DNA的一部分才能產生新的病毒。在數百萬年的時間跨度中,生殖細胞的逆轉錄病毒浸潤已經被宿主的後代作為ERVs遺傳,ERVs構成了當今脊椎動物基因組的很大一部分。
研究人員利用最近的技術進展,對野生和家養宿主的全基因組進行基於種群的分析,這為ERV-host基因組變異提供了新的見解。作為一個模型,研究人員對歐洲兔子進行了研究。歐洲兔子大約100萬年前在伊比利亞半島分化為兩個亞種,大約1000年前在法國南部被馴化。
該研究的主要作者Daniel Rivas說:「通過研究來自相關宿主群體的全基因組序列,與單個個體的基因組相比,我們可以識別出新的ERVs來更好地理解逆轉錄病毒宿主共同進化。」
利用來自許多兔子種群的數百個個體的數據,研究人員能夠識別先前未知的逆轉錄病毒插入物,並確定參考基因組中存在的那些插入物的傳播情況。ERV的多樣性主要遵循兔的輻散度,結果表明,在不同的兔群中ERV插入之間存在顯著的差異。我們從宿主群體中發現的豐度和分離變異證明了基因組ERV記錄是逆轉錄病毒宿主關係進化觀點的一個顯著來源。
總結:這一新知識揭示了ERVs如何在宿主種群中傳播,以及這種傳播如何與宿主物種的進化相關。