Science:人類蛋白質圖譜分析大進展

2020-11-30 儀器信息網

    2015年1月23日一期的Science公布了基於人類蛋白質圖譜的大分析結果,包括與癌症相關的詳細蛋白質圖片,血液中蛋白質種類和數量,以及市場上被批准的所有藥物所作用的目標蛋白質。

    人類蛋白質圖譜(The Human Protein Atlas),是由Knut and Alice Wallenberg基金會於2014年11月支持的一個大型跨國研究項目。近期他們又開放了一個以人器官組織為基礎的蛋白質圖譜資料庫。基於1300萬個注釋的圖像,整個資料庫涵蓋了人體中的所有主要組織和器官的蛋白質分布,也標註了僅表達在特定組織,如腦,心臟或肝臟的蛋白。作為一個開放的數據資源,這個資料庫提高了對人類生物學的基本見解,更有望幫助推動新的診斷和藥物的開發。

    在Science的這篇文章裡,"基於組織的人類蛋白質組圖譜" 結合基因組學,轉錄組學,蛋白質組學,以及基於抗體的分析,詳細分析了大約20,000個蛋白質編碼基因。分析結果表明,蛋白編碼基因幾乎一半都是普遍表達在所有分析的組織。而有大概的15%的蛋白質編碼基因大量表達在一個或幾個特定的組織或器官,包括眾所周知的組織特異性蛋白質,如胰島素和肌鈣蛋白。睪丸是含有最豐富種類蛋白質的器官,其後是大腦和肝臟。分析結果還表明,大約3000種蛋白質是從細胞中分泌釋放的,另有5500種蛋白位於細胞膜結構。

    這一蛋白質圖分析結果為製藥行業的提供了重要信息。研究小組的Uhlén表示,他們發現了市場上使用的藥品有70%的作用目標是分泌或膜結合蛋白。有趣的是,另外30%被發現是作用其他組織和器官,這可能有助於解釋藥物的一些副作用,並且對未來藥物開發提供一定的參考價值。

    該資料庫已經免費對外開放,網址是www.proteinatlas.org.

相關焦點

  • 人、豬、鼠大腦蛋白質圖譜問世,進攻人類科學最後的前沿
    自從人類基因組測序完成以來,人類蛋白質圖譜(HPA)計劃最終的目標是了解約 20000 個蛋白質編碼基因的動態表達,並生成人類蛋白質組圖譜。「圖譜」 是指對某一主題有全面了解的圖片或圖表的集合,完成人類蛋白質圖譜的目標是揭示每個人類蛋白質在不同人類組織、癌症類型和細胞系中的空間分布和表達。
  • Science重磅發布:人類大腦細胞結構的三維概率圖譜
    圖譜的概念是動態的,例如,隨著映射方面的進展而不斷調整,公開支持健康受試者和患者的神經影像學研究,以及建模、仿真和交互操作,以連接其他的圖譜和資源。 Julich腦圖譜是基於23個人死後大腦的組織學切片獲得的。經過41個項目,繪製出了人類大腦的248個細胞結構區域圖(圖1)。
  • Science重磅發布:人類大腦細胞結構的三維概率圖譜
    圖譜的概念是動態的,例如,隨著映射方面的進展而不斷調整,公開支持健康受試者和患者的神經影像學研究,以及建模、仿真和交互操作,以連接其他的圖譜和資源。Julich腦圖譜是基於23個人死後大腦的組織學切片獲得的。
  • 快訊 | Science發表最新人類腦圖譜
    學術快訊神外前沿https://science.sciencemag.org/content/early/2020/07/29/science.abb4588神外前沿訊,近日,《Science》雜誌上發表了德國Katrin Amunts教授團隊繪製的最新大腦圖譜。
  • Science:對人類血細胞中的所有蛋白編碼基因進行全基因組轉錄組分析
    2019年12月31日訊/生物谷BIOON/---在臨床和研究環境中,血液都是對人類進行分子分析的主要來源,並且是許多治療策略的目標,這突顯了需要對構成人類血液的細胞進行全面的分子圖譜構建。人類蛋白質圖譜計劃(www.proteinatlas.org)是一個開放式資料庫,旨在通過整合各種組學技術(包括基於抗體的成像)來繪製所有人類蛋白的圖譜。
  • Science | 繪製SARS-CoV-2的S蛋白三聚體糖基化圖譜
    撰文 | 唐小糖  病毒的糖基化修飾在病毒生物學具有廣泛的作用,包括介導蛋白質摺疊和穩定以及塑造病毒嗜性
  • Science:重大進展!人類原發性癌症染色質可接近性圖譜揭示DNA-蛋白...
    儘管2%的編碼蛋白的人類基因組已被廣泛研究,但是關於癌症中的非編碼基因組(佔人類基因組的98%)和基因調控,仍然有很多是未知的。通過轉錄因子(transcription factor, TF)作用於分散在非編碼基因組中的發揮著長程影響的DNA調節元件,基因在適當的細胞類型和細胞狀態中打開和關閉。
  • 重大進展!三篇Science揭示單個細胞形成完整有機體的基因圖譜
    2018年4月29日/生物谷BIOON/---不論是蠕蟲、人類還是藍鯨,所有的多細胞生物都是從單個細胞卵子開始的。這個細胞產生形成有機體所需的許多其他的細胞,而且每個新的細胞都是在合適的時間在合適的位置上產生的,從而通過與它的相鄰細胞進行合作而精確地發揮它的功能。
  • Science:首次構建出人腦細胞結構數字圖譜---Julich-Brain
    2020年8月1日訊/生物谷BIOON/---Julich-Brain是第一個人腦三維圖譜的名稱,它以微觀解析度反映了大腦結構的變化。該圖譜有近250個結構不同的區域,每個區域都是基於對10個大腦的分析。24000多張極薄的大腦切片由專家們進行數位化處理、三維組裝和繪製圖譜。
  • 遺傳相互作用圖譜可確定蛋白質複合物的整合結構
    遺傳相互作用圖譜可確定蛋白質複合物的整合結構 作者:小柯機器人 發布時間:2020/12/12 20:55:40 美國加州大學舊金山分校Nevan J.
  • Science兩連發 | 人類胎兒基因表達與染色質可及性圖譜
    121個人類胎兒器官樣本的超過400萬個單細胞的基因表達水平。最後他們將人類胎兒單細胞圖譜和小鼠胚胎細胞圖譜整合在一起並構建了細胞和基因從胚胎到胎兒發育的動態軌跡。這項研究對於研究各種人體細胞的種類和分化途徑,器官的形成,以及理解兒童的各種發育異常和疾病提供了分子和細胞學基礎。
  • 科學家繪製蛋白質組熱穩定性圖譜
    科學家繪製蛋白質組熱穩定性圖譜 作者:小柯機器人 發布時間:2020/4/19 23:00:44 德國慕尼黑工業大學Bernhard Kuster、歐洲分子生物學實驗室Mikhail M.
  • 科學家繪製出生物界的蛋白質圖譜
    德國馬克斯普朗克研究所Matthias Mann團隊繪製出生物界的蛋白質圖譜。2020年6月17日,《自然》雜誌在線發表了這項成果。研究人員使用先進的蛋白質組學工作流程(其中肽分離步驟是通過微結構且可高度重現的色譜系統執行的)來深入研究100種分類學多樣的生物。通過以標準化方式獲得的200萬個肽段和340,000個嚴格的蛋白質鑑定,研究人員利用科學界已知的可靠實驗證據將蛋白質的數量增加了一倍。
  • 圖譜研究揭示蛋白質間交互作用鏈
    藉助先進手段,研究員從細胞中捕獲了數千個「分子機」,並離析出組成它們的單個蛋白質,繪製成詳細的蛋白質圖譜,通過該圖譜,可以由已知功能的蛋白質推出未知蛋白質的作用。  根據這些數據繪製的蛋白圖譜,研究人員發現了上萬條蛋白質之間的相互作用。經統計,細胞內大約四分之一的蛋白質都彼此聯繫,哪怕只有一個蛋白質在相互作用鏈中失去,都會導致疾病。
  • 生物進化樹中蛋白質組熱穩定性圖譜
    本篇文章使用基於質譜的蛋白質組學方法系統地描繪了從古細菌到人類共13個物種中48000個蛋白的熱穩定性圖譜,其中涵蓋的變性溫度從30℃到90℃。文章研究發現,蛋白質的序列,組成及大小會影響原核生物的熱穩定性而真核蛋白的無序結構程度與其熱穩定性之間呈非線性關係。
  • 兩篇Science論文構建出胎兒基因表達和染色質可及性的人類細胞圖譜...
    2020年11月16日訊/生物谷BIOON/---在兩項新的研究中,來自美國華盛頓大學醫學院和布羅特曼-巴蒂精準醫學研究所等研究機構的研究人員構建出兩個細胞圖譜,用於追蹤人類細胞類型和組織發育過程中的基因表達和和染色質可及性(chromatin accessibility,也譯為染色質可訪問性)。
  • Science:利用單細胞基因組學進行人類細胞表型分析
    瑞士巴塞爾分子與臨床眼科研究所人類視網膜與器官發育小組負責人Gray Camp說道,「為了對人類細胞類型進行分類,了解它們的發育方式,它們在不同人之間的差異,以及它們在疾病中出現功能障礙的方式,將徹底改變人們對人類細胞表型的理解。」圖片來自Science期刊。
  • 19年前的今天,人類基因組圖譜首次被公布
    當前位置: 首頁  >  興趣圈  >  科幻世界  >  科幻資訊  >  科幻出版 19年前的今天,人類基因組圖譜首次被公布
  • 用RNP圖譜分析RNA和蛋白質網絡確定RNA功能樞紐
    用RNP圖譜分析RNA和蛋白質網絡確定RNA功能樞紐 作者:小柯機器人 發布時間:2020/10/22 14:38:16 美國北卡羅萊納大學Kevin M.
  • 科學家繪製出胎兒基因表達的人類細胞圖譜
    科學家繪製出胎兒基因表達的人類細胞圖譜 作者:小柯機器人 發布時間:2020/11/16 13:42:53 美國華盛頓大學Jay Shendure、Cole Trapnell等研究人員合作繪製出胎兒基因表達的人類細胞圖譜。