PubMed資料庫是科研人員經常使用的資料庫。科研人員在文獻檢索時常常會發生明明有篇文章在PubMed當中看到過,但是關閉資料庫之後再找就找不到了,或者能找到,但是又從頭閱讀了之前的檢索結果,終於篩選出來。那如何快速找到之前曾經遇到過的文獻呢?又或者讀到一篇比較好的文獻,怎麼最快的分享給別人呢?
一、什麼是PMID?
PMID即PubMed Identifier,是PubMed文獻在PubMed中的唯一識別號,每個PMID號都對應著唯一一篇文獻。
PMID顯示在文獻詳細信息頁面中摘要和關鍵詞的下面,如下圖所示:
圖1. 引文界面中的PMID
二、如何使用PMID進行單文獻和多文獻檢索?
在PubMed的檢索框中輸入PMID號,無論是否輸入[PMID]的欄位限定,都可以可以直接定位到該文獻的詳細信息頁。在欄位限定檢索中,UID和PMID的效果是一樣的,無論輸入哪一個都是進行的PMID檢索。
圖2. 單個PMID檢索文獻
圖3. 單個PMID與欄位限制檢索文獻
圖4. 單個PMID與欄位限制檢索文獻
上面三個輸入方式檢索結果都是一樣的哦,都定位到圖1的檢索結果頁面。
也可以同時輸入多個PMID,不同PMID之間用空格分開即可,PubMed會進行OR運算,將多個PMID檢索結果合併顯示。
圖5. 多個PMID批量檢索文獻。
檢索結果如下:
圖6. 多個PMID批量檢索文獻的結果。
三、在網址中使用PMID
可能有機智的小夥伴已經發現,其實PubMed文獻詳細信息頁面網址最後一串數字就是PMID,我們可以通過閱讀這段數字來獲取PMID,也可以直接在PubMed網址後面加上/PMID即可定位到目標文獻。比如,在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed網址後面,加上26904262:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/26904262;或者直接輸入這個短網址也可:www.PubMed.com/26904262。
四、利用PMID進行批量檢索
如果我們收集了一批PMID號,可以使用Batch Entrez批量檢索功能,直接提交給PubMed一個txt格式的文本文件,進行PMID號批量檢索。
PMID批量檢索步驟如下:
1、建立一個PMID的txt文本文檔,格式如下圖
圖7
2、打開 Batch Entrez批量檢索,網址如下:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez?
選擇PubMed數據集,點擊瀏覽按鈕選擇並含有PMID的文本文檔,然後點擊檢索,顯示檢索結果如下圖,點擊下圖中最後一行的超連結。即可瀏覽全部檢索結果。
圖8
圖9. 利用PMID進行Batch Entrez批量檢索
五、使用PMID進行文獻互助和文獻傳遞
在丁香園文獻全文互助平臺、醫知網等文獻傳遞的網站,可以直接用PMID號直接發出文獻傳遞請求。
丁香園文獻全文互助平臺直接輸入PMID即可求助:
圖10. 丁香園網站的PMID文獻互助。
醫知網也提供PMID檢索:
圖11. 醫知網的PMID文獻互助。
總之,有了PMID,既可以用PMID快速在PubMed中查找,又可以利用PubMed進行文獻求助或者傳遞,也可以直接把PMID號推薦給項目組的同事,而不是在電話或者簡訊中讀整個題錄的內容。利用好PMID,「滄海取一粟」並不是難事!